Protein–RNA interactions for Protein: Q16099

GRIK4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK4Q16099 BAX-201ENST00000293288 1358 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GRIK4Q16099 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GRIK4Q16099 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GRIK4Q16099 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GRIK4Q16099 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
GRIK4Q16099 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GRIK4Q16099 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GRIK4Q16099 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
GRIK4Q16099 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GRIK4Q16099 LAP3P2-201ENST00000454686 1454 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
GRIK4Q16099 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GRIK4Q16099 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GRIK4Q16099 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GRIK4Q16099 MOGAT2-201ENST00000198801 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GRIK4Q16099 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GRIK4Q16099 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GRIK4Q16099 CAPZB-201ENST00000264202 858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GRIK4Q16099 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GRIK4Q16099 CTSL-201ENST00000340342 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GRIK4Q16099 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GRIK4Q16099 TRO-205ENST00000399736 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GRIK4Q16099 C1QA-202ENST00000402322 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GRIK4Q16099 AL118508.1-202ENST00000411595 709 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GRIK4Q16099 RPSAP31-201ENST00000416648 895 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
GRIK4Q16099 AL627422.1-201ENST00000434104 580 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
GRIK4Q16099 TAC3-208ENST00000441881 731 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GRIK4Q16099 AL139420.2-201ENST00000449439 410 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GRIK4Q16099 LYRM4-206ENST00000468929 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GRIK4Q16099 MYLK-AS1-202ENST00000470449 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GRIK4Q16099 AC009487.3-201ENST00000505579 560 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GRIK4Q16099 AP002803.1-201ENST00000528836 498 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
GRIK4Q16099 MESP2-203ENST00000560219 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GRIK4Q16099 AC107871.2-202ENST00000563057 396 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GRIK4Q16099 PARD6G-AS1-205ENST00000589574 647 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GRIK4Q16099 AC009264.1-206ENST00000592183 534 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GRIK4Q16099 MIR6842-201ENST00000612539 65 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
GRIK4Q16099 TAC3-211ENST00000615887 1120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GRIK4Q16099 AP003419.4-201ENST00000616071 517 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
GRIK4Q16099 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GRIK4Q16099 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GRIK4Q16099 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GRIK4Q16099 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GRIK4Q16099 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GRIK4Q16099 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GRIK4Q16099 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GRIK4Q16099 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GRIK4Q16099 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GRIK4Q16099 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GRIK4Q16099 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GRIK4Q16099 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GRIK4Q16099 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GRIK4Q16099 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GRIK4Q16099 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GRIK4Q16099 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GRIK4Q16099 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GRIK4Q16099 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GRIK4Q16099 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GRIK4Q16099 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GRIK4Q16099 APBB1-220ENST00000609331 1574 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GRIK4Q16099 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GRIK4Q16099 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GRIK4Q16099 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GRIK4Q16099 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GRIK4Q16099 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GRIK4Q16099 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GRIK4Q16099 PFDN6-204ENST00000395131 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GRIK4Q16099 PSMG3-203ENST00000404674 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GRIK4Q16099 CHID1-202ENST00000429789 1289 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GRIK4Q16099 AL161932.2-201ENST00000435436 679 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
GRIK4Q16099 LINC00466-203ENST00000436475 1059 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GRIK4Q16099 UPK1A-AS1-201ENST00000443196 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GRIK4Q16099 MYL7-209ENST00000458240 791 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GRIK4Q16099 CHCHD2P9-201ENST00000461726 456 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
GRIK4Q16099 AC130709.1-201ENST00000484779 1212 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
GRIK4Q16099 CD164-210ENST00000512821 964 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GRIK4Q16099 AC135983.4-201ENST00000564116 1262 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
GRIK4Q16099 RN7SL736P-201ENST00000613111 269 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
GRIK4Q16099 PRSS45-202ENST00000620911 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GRIK4Q16099 IFI27-215ENST00000621160 644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GRIK4Q16099 AC009975.2-202ENST00000634539 854 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GRIK4Q16099 ABI2-215ENST00000430418 1676 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GRIK4Q16099 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
GRIK4Q16099 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
GRIK4Q16099 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GRIK4Q16099 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GRIK4Q16099 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GRIK4Q16099 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GRIK4Q16099 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GRIK4Q16099 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GRIK4Q16099 AC021683.1-201ENST00000585798 1767 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GRIK4Q16099 ELP5-203ENST00000396627 1389 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GRIK4Q16099 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GRIK4Q16099 METAP2-205ENST00000546753 1862 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GRIK4Q16099 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GRIK4Q16099 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GRIK4Q16099 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GRIK4Q16099 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GRIK4Q16099 RAMP3-201ENST00000242249 1323 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GRIK4Q16099 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GRIK4Q16099 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms