Protein–RNA interactions for Protein: Q15032

R3HDM1, R3H domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,099 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3HDM1Q15032 TPPP3-205ENST00000564104 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
R3HDM1Q15032 LPCAT4-209ENST00000617710 1719 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
R3HDM1Q15032 SIAE-206ENST00000618733 1980 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
R3HDM1Q15032 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
R3HDM1Q15032 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
R3HDM1Q15032 POLR3K-201ENST00000293860 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
R3HDM1Q15032 NCF4-202ENST00000397147 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
R3HDM1Q15032 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
R3HDM1Q15032 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
R3HDM1Q15032 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
R3HDM1Q15032 SRPX-205ENST00000538295 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
R3HDM1Q15032 RPL3P2-204ENST00000413027 1203 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
R3HDM1Q15032 AC137579.2-201ENST00000517714 551 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
R3HDM1Q15032 ZNF816-208ENST00000535506 529 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
R3HDM1Q15032 AC005921.2-201ENST00000574246 670 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
R3HDM1Q15032 LINC02498-201ENST00000635390 1065 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
R3HDM1Q15032 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
R3HDM1Q15032 ABI2-215ENST00000430418 1676 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
R3HDM1Q15032 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
R3HDM1Q15032 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
R3HDM1Q15032 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
R3HDM1Q15032 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
R3HDM1Q15032 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
R3HDM1Q15032 METTL6-202ENST00000383790 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
R3HDM1Q15032 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
R3HDM1Q15032 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
R3HDM1Q15032 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
R3HDM1Q15032 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
R3HDM1Q15032 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
R3HDM1Q15032 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
R3HDM1Q15032 TSGA13-201ENST00000356588 1372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
R3HDM1Q15032 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
R3HDM1Q15032 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
R3HDM1Q15032 OR2T8-201ENST00000319968 939 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
R3HDM1Q15032 NR1I3-201ENST00000367979 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
R3HDM1Q15032 NR1I3-207ENST00000367985 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
R3HDM1Q15032 VPREB1-202ENST00000403807 755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
R3HDM1Q15032 AL158207.2-201ENST00000414926 266 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
R3HDM1Q15032 KCNK15-AS1-203ENST00000427598 862 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
R3HDM1Q15032 CCND3P1-201ENST00000438347 580 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
R3HDM1Q15032 AL110503.1-201ENST00000457224 534 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
R3HDM1Q15032 NR1I3-225ENST00000508387 634 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
R3HDM1Q15032 HNRNPA1P72-201ENST00000529511 967 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
R3HDM1Q15032 EIF2B1-205ENST00000539951 848 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
R3HDM1Q15032 SLC13A2-205ENST00000545060 1276 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
R3HDM1Q15032 AL136298.3-201ENST00000556746 445 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
R3HDM1Q15032 TRPM1-210ENST00000559179 1002 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
R3HDM1Q15032 AC009119.3-202ENST00000566773 196 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
R3HDM1Q15032 OR2T8-202ENST00000641945 1226 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
R3HDM1Q15032 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
R3HDM1Q15032 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
R3HDM1Q15032 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
R3HDM1Q15032 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
R3HDM1Q15032 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
R3HDM1Q15032 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
R3HDM1Q15032 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
R3HDM1Q15032 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
R3HDM1Q15032 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
R3HDM1Q15032 HERPUD1-203ENST00000379792 1782 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
R3HDM1Q15032 LRIF1-202ENST00000485275 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
R3HDM1Q15032 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
R3HDM1Q15032 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
R3HDM1Q15032 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
R3HDM1Q15032 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
R3HDM1Q15032 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
R3HDM1Q15032 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
R3HDM1Q15032 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
R3HDM1Q15032 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
R3HDM1Q15032 NIPAL3-202ENST00000339255 1676 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
R3HDM1Q15032 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
R3HDM1Q15032 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
R3HDM1Q15032 L2HGDH-201ENST00000261699 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
R3HDM1Q15032 SERHL2-201ENST00000327678 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
R3HDM1Q15032 RPL18A-205ENST00000600147 1391 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
R3HDM1Q15032 PAX6-264ENST00000640125 1375 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
R3HDM1Q15032 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
R3HDM1Q15032 LXN-201ENST00000264265 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
R3HDM1Q15032 IGHV3-11-201ENST00000390601 473 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
R3HDM1Q15032 CPSF4L-202ENST00000397671 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
R3HDM1Q15032 AC091729.3-203ENST00000413706 674 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
R3HDM1Q15032 AC000077.1-201ENST00000420012 953 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
R3HDM1Q15032 AL512328.1-203ENST00000428480 673 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
R3HDM1Q15032 C3orf84-201ENST00000432035 669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
R3HDM1Q15032 AC026150.1-201ENST00000562992 701 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
R3HDM1Q15032 ADGRE3-204ENST00000595472 486 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
R3HDM1Q15032 ASNA1-205ENST00000611688 1214 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
R3HDM1Q15032 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
R3HDM1Q15032 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
R3HDM1Q15032 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
R3HDM1Q15032 FAM83A-AS1-202ENST00000520576 1347 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
R3HDM1Q15032 APBB3-201ENST00000354402 1810 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
R3HDM1Q15032 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
R3HDM1Q15032 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
R3HDM1Q15032 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
R3HDM1Q15032 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
R3HDM1Q15032 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
R3HDM1Q15032 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
R3HDM1Q15032 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
R3HDM1Q15032 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
R3HDM1Q15032 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms