Protein–RNA interactions for Protein: Q14973

SLC10A1, Sodium/bile acid cotransporter, humanhuman

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC10A1Q14973 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SLC10A1Q14973 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SLC10A1Q14973 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SLC10A1Q14973 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SLC10A1Q14973 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SLC10A1Q14973 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SLC10A1Q14973 OTOF-202ENST00000338581 4954 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SLC10A1Q14973 PTPRO-201ENST00000281171 5301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
SLC10A1Q14973 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
SLC10A1Q14973 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
SLC10A1Q14973 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
SLC10A1Q14973 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
SLC10A1Q14973 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
SLC10A1Q14973 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
SLC10A1Q14973 PLLP-205ENST00000613167 7578 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
SLC10A1Q14973 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
SLC10A1Q14973 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
SLC10A1Q14973 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
SLC10A1Q14973 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
SLC10A1Q14973 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC13.27□□□□□ -0.28
SLC10A1Q14973 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
SLC10A1Q14973 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.28
SLC10A1Q14973 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SLC10A1Q14973 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SLC10A1Q14973 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SLC10A1Q14973 SSR4-203ENST00000370086 643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SLC10A1Q14973 FAM177A1-202ENST00000382406 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SLC10A1Q14973 RAB1A-201ENST00000398529 1198 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SLC10A1Q14973 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
SLC10A1Q14973 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
SLC10A1Q14973 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
SLC10A1Q14973 LINC00431-201ENST00000440735 1189 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
SLC10A1Q14973 MSRA-203ENST00000441698 788 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
SLC10A1Q14973 AC006335.1-201ENST00000445200 547 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
SLC10A1Q14973 PABPC5-AS1-201ENST00000456187 426 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
SLC10A1Q14973 AC012618.1-201ENST00000461223 412 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
SLC10A1Q14973 RN7SL769P-201ENST00000469386 295 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
SLC10A1Q14973 RAMP3-202ENST00000481345 559 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC13.27□□□□□ -0.29
SLC10A1Q14973 TSACC-208ENST00000481479 741 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
SLC10A1Q14973 RCC2P8-201ENST00000502779 1035 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
SLC10A1Q14973 AC015689.1-201ENST00000525365 462 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
SLC10A1Q14973 AC090857.1-201ENST00000527400 390 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
SLC10A1Q14973 AC117500.3-201ENST00000537032 666 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SLC10A1Q14973 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SLC10A1Q14973 AL161670.2-201ENST00000557650 1227 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
SLC10A1Q14973 AC104758.2-201ENST00000562716 483 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
SLC10A1Q14973 L34079.1-201ENST00000594374 393 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
SLC10A1Q14973 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SLC10A1Q14973 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
SLC10A1Q14973 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SLC10A1Q14973 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SLC10A1Q14973 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
SLC10A1Q14973 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
SLC10A1Q14973 TBC1D8B-203ENST00000357242 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SLC10A1Q14973 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
SLC10A1Q14973 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
SLC10A1Q14973 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SLC10A1Q14973 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SLC10A1Q14973 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
SLC10A1Q14973 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SLC10A1Q14973 ELK4-202ENST00000357992 10239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SLC10A1Q14973 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SLC10A1Q14973 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
SLC10A1Q14973 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
SLC10A1Q14973 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SLC10A1Q14973 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
SLC10A1Q14973 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SLC10A1Q14973 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
SLC10A1Q14973 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SLC10A1Q14973 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
SLC10A1Q14973 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SLC10A1Q14973 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SLC10A1Q14973 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SLC10A1Q14973 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SLC10A1Q14973 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SLC10A1Q14973 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SLC10A1Q14973 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SLC10A1Q14973 COX4I1-201ENST00000253452 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SLC10A1Q14973 OR1J1-201ENST00000259357 969 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SLC10A1Q14973 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SLC10A1Q14973 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SLC10A1Q14973 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SLC10A1Q14973 RAB36-202ENST00000341989 936 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SLC10A1Q14973 AC008132.1-202ENST00000342005 1389 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
SLC10A1Q14973 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SLC10A1Q14973 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SLC10A1Q14973 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SLC10A1Q14973 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SLC10A1Q14973 KCNAB2-207ENST00000378111 822 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SLC10A1Q14973 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
SLC10A1Q14973 IGHV3-13-201ENST00000390602 430 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SLC10A1Q14973 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SLC10A1Q14973 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SLC10A1Q14973 LINC01118-202ENST00000409912 1023 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SLC10A1Q14973 PNPLA6-202ENST00000414982 4522 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SLC10A1Q14973 SYNGAP1-203ENST00000428982 4339 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SLC10A1Q14973 FOXP4-AS1-203ENST00000439386 404 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SLC10A1Q14973 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
SLC10A1Q14973 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
SLC10A1Q14973 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms