Protein–RNA interactions for Protein: Q14964

RAB39A, Ras-related protein Rab-39A, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB39AQ14964 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
RAB39AQ14964 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
RAB39AQ14964 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
RAB39AQ14964 GEM-201ENST00000297596 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RAB39AQ14964 CARMIL2-202ENST00000545661 4119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RAB39AQ14964 CD34-203ENST00000367036 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RAB39AQ14964 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RAB39AQ14964 DENND3-202ENST00000424248 4740 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RAB39AQ14964 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RAB39AQ14964 CCDC86-201ENST00000227520 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RAB39AQ14964 COL18A1-AS1-201ENST00000397787 3425 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RAB39AQ14964 PCGF2-202ENST00000611883 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RAB39AQ14964 RRAGD-201ENST00000359203 4042 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
RAB39AQ14964 INPPL1-213ENST00000541756 4649 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
RAB39AQ14964 TMUB2-211ENST00000589184 1837 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
RAB39AQ14964 MEAF6-204ENST00000373075 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RAB39AQ14964 LINC01114-203ENST00000425879 2434 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
RAB39AQ14964 PTH2R-201ENST00000272847 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RAB39AQ14964 ENG-202ENST00000373203 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RAB39AQ14964 ARHGEF33-202ENST00000409978 4484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
RAB39AQ14964 LINC00940-201ENST00000418006 2350 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
RAB39AQ14964 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RAB39AQ14964 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RAB39AQ14964 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RAB39AQ14964 PCDHA11-201ENST00000398640 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RAB39AQ14964 CCT2-201ENST00000299300 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RAB39AQ14964 RSBN1-201ENST00000261441 6621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
RAB39AQ14964 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RAB39AQ14964 TTC14-202ENST00000382584 2274 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RAB39AQ14964 CNKSR2-203ENST00000425654 5668 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
RAB39AQ14964 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RAB39AQ14964 AC073869.1-201ENST00000415574 2762 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
RAB39AQ14964 KIAA1217-203ENST00000376452 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RAB39AQ14964 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RAB39AQ14964 RBSN-207ENST00000476527 3005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RAB39AQ14964 SMTN-201ENST00000333137 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RAB39AQ14964 AL121827.1-201ENST00000370257 3264 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RAB39AQ14964 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RAB39AQ14964 SETD1A-201ENST00000262519 6451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RAB39AQ14964 FBXL18-201ENST00000382368 3498 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RAB39AQ14964 ARHGEF4-217ENST00000611048 3486 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RAB39AQ14964 FAM122C-203ENST00000414371 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RAB39AQ14964 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RAB39AQ14964 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RAB39AQ14964 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RAB39AQ14964 STEAP2-201ENST00000287908 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RAB39AQ14964 HMGA1-203ENST00000374116 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RAB39AQ14964 AFAP1-203ENST00000382543 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RAB39AQ14964 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RAB39AQ14964 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RAB39AQ14964 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RAB39AQ14964 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
RAB39AQ14964 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RAB39AQ14964 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RAB39AQ14964 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RAB39AQ14964 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
RAB39AQ14964 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
RAB39AQ14964 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RAB39AQ14964 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RAB39AQ14964 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RAB39AQ14964 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RAB39AQ14964 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RAB39AQ14964 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RAB39AQ14964 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RAB39AQ14964 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RAB39AQ14964 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RAB39AQ14964 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RAB39AQ14964 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RAB39AQ14964 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RAB39AQ14964 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RAB39AQ14964 ANKRD42-201ENST00000260047 2514 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RAB39AQ14964 RPUSD4-201ENST00000298317 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RAB39AQ14964 LGALS9-201ENST00000302228 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RAB39AQ14964 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RAB39AQ14964 ALOX15B-202ENST00000380183 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RAB39AQ14964 TET3-201ENST00000305799 5174 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RAB39AQ14964 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RAB39AQ14964 CHD1-212ENST00000614616 8095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RAB39AQ14964 CAPN14-202ENST00000403897 2197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RAB39AQ14964 CCT7-201ENST00000258091 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RAB39AQ14964 TFR2-205ENST00000462107 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RAB39AQ14964 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RAB39AQ14964 NAPB-202ENST00000398425 3824 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RAB39AQ14964 C19orf44-203ENST00000594035 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RAB39AQ14964 CENPL-202ENST00000356198 2357 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RAB39AQ14964 C4B-201ENST00000425700 5237 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RAB39AQ14964 KLHL13-204ENST00000371882 3256 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RAB39AQ14964 RNF220-203ENST00000361799 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
RAB39AQ14964 RNF220-204ENST00000372247 3010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
RAB39AQ14964 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
RAB39AQ14964 HCFC2-201ENST00000229330 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RAB39AQ14964 POTEM-201ENST00000547889 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RAB39AQ14964 ACIN1-204ENST00000397341 2738 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RAB39AQ14964 SLC4A7-211ENST00000445684 4061 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RAB39AQ14964 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
RAB39AQ14964 SLC25A29-208ENST00000554912 5169 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RAB39AQ14964 CEACAM20-204ENST00000617951 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
RAB39AQ14964 KDM6B-201ENST00000254846 6713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RAB39AQ14964 PAPPA-201ENST00000328252 10959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
RAB39AQ14964 TICAM1-201ENST00000248244 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms