Protein–RNA interactions for Protein: Q08554

DSC1, Desmocollin-1, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC1Q08554 OPRM1-207ENST00000428397 1481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DSC1Q08554 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DSC1Q08554 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DSC1Q08554 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DSC1Q08554 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DSC1Q08554 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DSC1Q08554 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DSC1Q08554 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DSC1Q08554 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DSC1Q08554 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DSC1Q08554 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DSC1Q08554 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DSC1Q08554 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DSC1Q08554 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DSC1Q08554 OR3A2-205ENST00000641164 2033 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DSC1Q08554 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
DSC1Q08554 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DSC1Q08554 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DSC1Q08554 BFAR-203ENST00000562442 1414 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DSC1Q08554 AL513327.1-206ENST00000587696 1432 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DSC1Q08554 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DSC1Q08554 SPACA3-201ENST00000269053 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DSC1Q08554 DYDC1-201ENST00000372202 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DSC1Q08554 CXCL12-202ENST00000374426 470 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DSC1Q08554 MAPK3-204ENST00000395200 997 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DSC1Q08554 AL157788.1-201ENST00000437838 229 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DSC1Q08554 Z99943.1-201ENST00000451545 718 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DSC1Q08554 AL512330.1-201ENST00000456701 349 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DSC1Q08554 RTN4RL2-203ENST00000533205 637 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DSC1Q08554 AL845331.2-201ENST00000561882 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DSC1Q08554 SPACA3-205ENST00000580599 949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DSC1Q08554 SNHG25-202ENST00000582965 278 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DSC1Q08554 LINC01224-201ENST00000593573 798 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DSC1Q08554 AC009145.4-201ENST00000625119 1294 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
DSC1Q08554 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DSC1Q08554 LILRA2-203ENST00000391737 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DSC1Q08554 ZNF576-202ENST00000391965 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DSC1Q08554 AC109460.1-201ENST00000567209 1478 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DSC1Q08554 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DSC1Q08554 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DSC1Q08554 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DSC1Q08554 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DSC1Q08554 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DSC1Q08554 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DSC1Q08554 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DSC1Q08554 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DSC1Q08554 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DSC1Q08554 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DSC1Q08554 TTC39A-216ENST00000530004 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DSC1Q08554 KCTD1-207ENST00000580059 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DSC1Q08554 SLC4A1-206ENST00000631130 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DSC1Q08554 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DSC1Q08554 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DSC1Q08554 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DSC1Q08554 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DSC1Q08554 PSMB10-201ENST00000358514 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DSC1Q08554 BAX-205ENST00000391871 687 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DSC1Q08554 PUS10-202ENST00000398658 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DSC1Q08554 UBE2I-206ENST00000403747 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DSC1Q08554 GYPC-203ENST00000409836 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DSC1Q08554 AL137058.1-201ENST00000418237 673 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DSC1Q08554 AL139241.1-201ENST00000433374 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DSC1Q08554 AL356056.1-201ENST00000437899 369 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DSC1Q08554 AC079112.1-201ENST00000454972 939 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
DSC1Q08554 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
DSC1Q08554 AC246817.2-203ENST00000517357 569 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DSC1Q08554 AC246817.2-202ENST00000519393 564 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DSC1Q08554 MBP-227ENST00000526111 581 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DSC1Q08554 AP000911.2-201ENST00000534330 502 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
DSC1Q08554 AC135782.2-201ENST00000562040 472 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DSC1Q08554 TMEM98-205ENST00000578289 806 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DSC1Q08554 RN7SL665P-201ENST00000578793 300 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
DSC1Q08554 LINC00116-203ENST00000611969 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DSC1Q08554 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DSC1Q08554 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DSC1Q08554 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DSC1Q08554 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DSC1Q08554 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DSC1Q08554 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DSC1Q08554 UPK3BL1-201ENST00000340457 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DSC1Q08554 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DSC1Q08554 HPGD-209ENST00000510901 1535 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DSC1Q08554 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DSC1Q08554 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DSC1Q08554 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DSC1Q08554 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DSC1Q08554 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DSC1Q08554 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DSC1Q08554 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DSC1Q08554 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DSC1Q08554 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DSC1Q08554 FAM149A-203ENST00000389354 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DSC1Q08554 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DSC1Q08554 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DSC1Q08554 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DSC1Q08554 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DSC1Q08554 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DSC1Q08554 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DSC1Q08554 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DSC1Q08554 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms