Protein–RNA interactions for Protein: Q06828

FMOD, Fibromodulin, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FMODQ06828 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
FMODQ06828 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
FMODQ06828 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
FMODQ06828 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
FMODQ06828 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
FMODQ06828 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
FMODQ06828 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
FMODQ06828 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
FMODQ06828 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC13.05□□□□□ -0.32
FMODQ06828 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
FMODQ06828 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
FMODQ06828 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
FMODQ06828 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
FMODQ06828 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
FMODQ06828 ANO10-203ENST00000396091 2419 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
FMODQ06828 FAAP100-201ENST00000327787 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
FMODQ06828 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
FMODQ06828 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
FMODQ06828 LLGL1-201ENST00000316843 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
FMODQ06828 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
FMODQ06828 SEZ6-201ENST00000317338 4471 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
FMODQ06828 TFDP1-201ENST00000375370 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
FMODQ06828 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
FMODQ06828 HS1BP3-201ENST00000304031 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
FMODQ06828 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
FMODQ06828 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
FMODQ06828 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
FMODQ06828 MPP2-214ENST00000523501 2121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
FMODQ06828 TEX13C-201ENST00000632600 5095 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
FMODQ06828 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
FMODQ06828 PML-201ENST00000268058 4508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
FMODQ06828 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
FMODQ06828 ENDOV-206ENST00000518901 2549 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
FMODQ06828 ZNF541-203ENST00000391901 4580 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
FMODQ06828 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
FMODQ06828 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
FMODQ06828 LINC01138-206ENST00000622328 2212 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
FMODQ06828 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
FMODQ06828 SEMA4F-202ENST00000357877 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
FMODQ06828 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
FMODQ06828 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
FMODQ06828 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
FMODQ06828 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
FMODQ06828 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
FMODQ06828 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
FMODQ06828 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
FMODQ06828 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
FMODQ06828 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
FMODQ06828 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
FMODQ06828 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
FMODQ06828 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
FMODQ06828 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
FMODQ06828 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
FMODQ06828 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
FMODQ06828 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
FMODQ06828 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
FMODQ06828 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
FMODQ06828 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
FMODQ06828 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
FMODQ06828 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
FMODQ06828 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
FMODQ06828 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
FMODQ06828 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
FMODQ06828 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
FMODQ06828 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
FMODQ06828 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
FMODQ06828 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
FMODQ06828 DDX20-201ENST00000369702 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
FMODQ06828 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
FMODQ06828 GOLGA2P7-207ENST00000559668 4253 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
FMODQ06828 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
FMODQ06828 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
FMODQ06828 MLXIPL-204ENST00000414749 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
FMODQ06828 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
FMODQ06828 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
FMODQ06828 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
FMODQ06828 DNER-201ENST00000341772 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
FMODQ06828 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
FMODQ06828 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
FMODQ06828 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
FMODQ06828 ARHGEF1-202ENST00000347545 3091 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
FMODQ06828 KCNH4-201ENST00000264661 3920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
FMODQ06828 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
FMODQ06828 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
FMODQ06828 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
FMODQ06828 SHROOM1-208ENST00000617339 3638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
FMODQ06828 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
FMODQ06828 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
FMODQ06828 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
FMODQ06828 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
FMODQ06828 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
FMODQ06828 TDP2-201ENST00000341060 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
FMODQ06828 NAALADL1-202ENST00000355721 2100 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
FMODQ06828 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
FMODQ06828 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
FMODQ06828 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
FMODQ06828 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
FMODQ06828 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
FMODQ06828 CHIT1-202ENST00000367229 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
FMODQ06828 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms