Protein–RNA interactions for Protein: Q05D60

DEUP1, Deuterosome assembly protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEUP1Q05D60 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DEUP1Q05D60 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DEUP1Q05D60 SH3KBP1-205ENST00000397821 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DEUP1Q05D60 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DEUP1Q05D60 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DEUP1Q05D60 HIPK3-203ENST00000456517 7399 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DEUP1Q05D60 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DEUP1Q05D60 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DEUP1Q05D60 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DEUP1Q05D60 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DEUP1Q05D60 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DEUP1Q05D60 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DEUP1Q05D60 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DEUP1Q05D60 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DEUP1Q05D60 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DEUP1Q05D60 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DEUP1Q05D60 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DEUP1Q05D60 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
DEUP1Q05D60 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
DEUP1Q05D60 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DEUP1Q05D60 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
DEUP1Q05D60 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DEUP1Q05D60 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DEUP1Q05D60 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DEUP1Q05D60 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DEUP1Q05D60 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
DEUP1Q05D60 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DEUP1Q05D60 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
DEUP1Q05D60 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DEUP1Q05D60 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
DEUP1Q05D60 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DEUP1Q05D60 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DEUP1Q05D60 CCDC88A-201ENST00000263630 9667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DEUP1Q05D60 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DEUP1Q05D60 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DEUP1Q05D60 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DEUP1Q05D60 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DEUP1Q05D60 ACAN-209ENST00000617301 8669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DEUP1Q05D60 DUSP28-202ENST00000405954 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DEUP1Q05D60 AATBC-201ENST00000400385 4598 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DEUP1Q05D60 PHF14-201ENST00000403050 4276 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DEUP1Q05D60 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DEUP1Q05D60 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DEUP1Q05D60 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DEUP1Q05D60 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DEUP1Q05D60 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DEUP1Q05D60 GPRASP1-205ENST00000537097 5980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DEUP1Q05D60 GRM7-215ENST00000486284 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DEUP1Q05D60 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DEUP1Q05D60 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DEUP1Q05D60 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DEUP1Q05D60 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DEUP1Q05D60 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DEUP1Q05D60 HSD17B4-222ENST00000515320 2494 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DEUP1Q05D60 PDPK1-202ENST00000342085 7241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DEUP1Q05D60 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DEUP1Q05D60 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DEUP1Q05D60 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DEUP1Q05D60 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DEUP1Q05D60 SFXN3-202ENST00000393459 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DEUP1Q05D60 LRRC41-208ENST00000617760 2158 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DEUP1Q05D60 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DEUP1Q05D60 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DEUP1Q05D60 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DEUP1Q05D60 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DEUP1Q05D60 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DEUP1Q05D60 STC1-202ENST00000524323 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DEUP1Q05D60 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DEUP1Q05D60 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DEUP1Q05D60 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
DEUP1Q05D60 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DEUP1Q05D60 MCRIP1-207ENST00000574190 2775 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DEUP1Q05D60 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DEUP1Q05D60 NPFFR1-201ENST00000277942 8921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DEUP1Q05D60 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DEUP1Q05D60 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DEUP1Q05D60 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DEUP1Q05D60 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DEUP1Q05D60 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DEUP1Q05D60 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
DEUP1Q05D60 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DEUP1Q05D60 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
DEUP1Q05D60 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DEUP1Q05D60 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DEUP1Q05D60 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DEUP1Q05D60 MLX-202ENST00000346833 2334 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DEUP1Q05D60 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DEUP1Q05D60 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DEUP1Q05D60 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DEUP1Q05D60 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DEUP1Q05D60 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DEUP1Q05D60 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DEUP1Q05D60 SCARF1-201ENST00000263071 3443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DEUP1Q05D60 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DEUP1Q05D60 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DEUP1Q05D60 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DEUP1Q05D60 PHLDB2-203ENST00000412622 5996 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DEUP1Q05D60 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DEUP1Q05D60 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DEUP1Q05D60 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 113.6 ms