Protein–RNA interactions for Protein: Q05D32

CTDSPL2, CTD small phosphatase-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSPL2Q05D32 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CTDSPL2Q05D32 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CTDSPL2Q05D32 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CTDSPL2Q05D32 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CTDSPL2Q05D32 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CTDSPL2Q05D32 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CTDSPL2Q05D32 PSG4-203ENST00000433626 1887 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CTDSPL2Q05D32 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CTDSPL2Q05D32 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CTDSPL2Q05D32 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CTDSPL2Q05D32 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CTDSPL2Q05D32 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CTDSPL2Q05D32 HSD17B6-207ENST00000555805 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CTDSPL2Q05D32 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CTDSPL2Q05D32 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CTDSPL2Q05D32 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CTDSPL2Q05D32 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CTDSPL2Q05D32 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CTDSPL2Q05D32 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CTDSPL2Q05D32 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CTDSPL2Q05D32 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
CTDSPL2Q05D32 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CTDSPL2Q05D32 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CTDSPL2Q05D32 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CTDSPL2Q05D32 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CTDSPL2Q05D32 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CTDSPL2Q05D32 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CTDSPL2Q05D32 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CTDSPL2Q05D32 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CTDSPL2Q05D32 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CTDSPL2Q05D32 SLC16A6P1-201ENST00000413214 1059 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
CTDSPL2Q05D32 CYP46A4P-201ENST00000414953 267 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
CTDSPL2Q05D32 ACTG1P2-201ENST00000415776 1125 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
CTDSPL2Q05D32 ACTG1P11-201ENST00000425411 1125 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
CTDSPL2Q05D32 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CTDSPL2Q05D32 AC005077.2-201ENST00000449786 690 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
CTDSPL2Q05D32 SPTLC1P5-201ENST00000450718 252 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
CTDSPL2Q05D32 AC125604.1-201ENST00000496255 707 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
CTDSPL2Q05D32 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CTDSPL2Q05D32 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CTDSPL2Q05D32 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CTDSPL2Q05D32 AC011773.1-201ENST00000520129 468 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CTDSPL2Q05D32 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CTDSPL2Q05D32 SEC23A-204ENST00000548032 907 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CTDSPL2Q05D32 AC003686.1-201ENST00000550956 1034 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
CTDSPL2Q05D32 CDIP1-202ENST00000562334 1205 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CTDSPL2Q05D32 NPLOC4-209ENST00000572760 946 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CTDSPL2Q05D32 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CTDSPL2Q05D32 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CTDSPL2Q05D32 AC004706.3-207ENST00000634823 977 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CTDSPL2Q05D32 MBD3L2B-202ENST00000637800 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CTDSPL2Q05D32 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CTDSPL2Q05D32 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CTDSPL2Q05D32 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CTDSPL2Q05D32 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CTDSPL2Q05D32 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CTDSPL2Q05D32 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CTDSPL2Q05D32 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CTDSPL2Q05D32 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CTDSPL2Q05D32 CHIA-204ENST00000369740 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CTDSPL2Q05D32 SLCO6A1-207ENST00000513675 1611 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CTDSPL2Q05D32 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CTDSPL2Q05D32 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CTDSPL2Q05D32 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CTDSPL2Q05D32 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CTDSPL2Q05D32 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CTDSPL2Q05D32 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CTDSPL2Q05D32 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CTDSPL2Q05D32 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CTDSPL2Q05D32 DLK1-201ENST00000331224 1324 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CTDSPL2Q05D32 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CTDSPL2Q05D32 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CTDSPL2Q05D32 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
CTDSPL2Q05D32 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CTDSPL2Q05D32 SSR4-203ENST00000370086 643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CTDSPL2Q05D32 NRM-202ENST00000376420 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CTDSPL2Q05D32 AC078875.1-201ENST00000431907 724 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
CTDSPL2Q05D32 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
CTDSPL2Q05D32 OR2R1P-201ENST00000441404 914 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
CTDSPL2Q05D32 Z82198.1-201ENST00000447396 437 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CTDSPL2Q05D32 RCC2P8-201ENST00000502779 1035 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
CTDSPL2Q05D32 CPLX2-209ENST00000515094 576 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CTDSPL2Q05D32 NAA40-206ENST00000542163 1035 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CTDSPL2Q05D32 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CTDSPL2Q05D32 SNHG14-213ENST00000551077 638 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CTDSPL2Q05D32 TUBB4A-212ENST00000601152 590 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CTDSPL2Q05D32 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
CTDSPL2Q05D32 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CTDSPL2Q05D32 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CTDSPL2Q05D32 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CTDSPL2Q05D32 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
CTDSPL2Q05D32 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CTDSPL2Q05D32 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CTDSPL2Q05D32 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CTDSPL2Q05D32 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CTDSPL2Q05D32 SLC35G2-201ENST00000393079 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CTDSPL2Q05D32 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CTDSPL2Q05D32 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CTDSPL2Q05D32 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CTDSPL2Q05D32 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms