Protein–RNA interactions for Protein: Q00169

PITPNA, Phosphatidylinositol transfer protein alpha isoform, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITPNAQ00169 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PITPNAQ00169 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PITPNAQ00169 USP22-206ENST00000537526 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PITPNAQ00169 CEP70-201ENST00000264982 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PITPNAQ00169 RGS9-201ENST00000262406 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PITPNAQ00169 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PITPNAQ00169 TYK2-205ENST00000525621 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PITPNAQ00169 TCN2-202ENST00000405742 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PITPNAQ00169 ABCB9-203ENST00000346530 3399 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PITPNAQ00169 GSE1-203ENST00000405402 4366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PITPNAQ00169 CCT6B-201ENST00000314144 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PITPNAQ00169 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PITPNAQ00169 TP73-201ENST00000346387 4854 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PITPNAQ00169 CACNA1C-214ENST00000399634 7590 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PITPNAQ00169 CACNA1C-222ENST00000406454 7590 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PITPNAQ00169 SPATA7-217ENST00000556553 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PITPNAQ00169 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PITPNAQ00169 AL590644.1-201ENST00000412427 4676 ntTSL 4 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PITPNAQ00169 TLL2-201ENST00000357947 6756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PITPNAQ00169 AC010255.3-203ENST00000509403 1727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PITPNAQ00169 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PITPNAQ00169 AC072061.1-201ENST00000569710 2234 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
PITPNAQ00169 SLC26A6-213ENST00000455886 2460 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PITPNAQ00169 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PITPNAQ00169 CCDC86-201ENST00000227520 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PITPNAQ00169 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PITPNAQ00169 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PITPNAQ00169 TMEM25-204ENST00000359862 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PITPNAQ00169 TP53INP1-202ENST00000448464 5631 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PITPNAQ00169 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PITPNAQ00169 SDC1-202ENST00000381150 3291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PITPNAQ00169 LDHAL6A-201ENST00000280706 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PITPNAQ00169 NOP58-201ENST00000264279 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PITPNAQ00169 RERE-202ENST00000377464 6733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PITPNAQ00169 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PITPNAQ00169 SVOPL-202ENST00000419765 1523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PITPNAQ00169 AC008125.1-201ENST00000548488 1538 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PITPNAQ00169 ANO7-202ENST00000402430 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PITPNAQ00169 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PITPNAQ00169 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PITPNAQ00169 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PITPNAQ00169 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PITPNAQ00169 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PITPNAQ00169 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
PITPNAQ00169 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
PITPNAQ00169 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PITPNAQ00169 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PITPNAQ00169 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PITPNAQ00169 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PITPNAQ00169 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PITPNAQ00169 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PITPNAQ00169 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PITPNAQ00169 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PITPNAQ00169 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PITPNAQ00169 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PITPNAQ00169 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PITPNAQ00169 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
PITPNAQ00169 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
PITPNAQ00169 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PITPNAQ00169 PPP6R2-203ENST00000395741 3304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PITPNAQ00169 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PITPNAQ00169 USP2-201ENST00000260187 3732 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PITPNAQ00169 TFEB-205ENST00000394283 2595 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PITPNAQ00169 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PITPNAQ00169 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
PITPNAQ00169 CCDC126-202ENST00000409765 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PITPNAQ00169 LINC02396-202ENST00000550636 2324 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PITPNAQ00169 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PITPNAQ00169 LINC02135-201ENST00000599486 2065 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PITPNAQ00169 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PITPNAQ00169 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PITPNAQ00169 AC098936.1-201ENST00000442318 2885 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PITPNAQ00169 DLGAP1-201ENST00000315677 6683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PITPNAQ00169 GJB1-203ENST00000374029 1587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PITPNAQ00169 HAL-202ENST00000538703 2637 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PITPNAQ00169 ELAVL4-207ENST00000448907 1951 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PITPNAQ00169 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PITPNAQ00169 TMPRSS12-202ENST00000551456 3336 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PITPNAQ00169 PSME4-202ENST00000404125 7099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PITPNAQ00169 CRACR2A-203ENST00000440314 2697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PITPNAQ00169 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PITPNAQ00169 RNF216-205ENST00000425013 5639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PITPNAQ00169 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PITPNAQ00169 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
PITPNAQ00169 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PITPNAQ00169 NFATC2-203ENST00000414705 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PITPNAQ00169 DAZL-201ENST00000250863 3104 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PITPNAQ00169 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PITPNAQ00169 APAF1-202ENST00000357310 7055 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
PITPNAQ00169 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
PITPNAQ00169 COL6A3-203ENST00000353578 9963 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
PITPNAQ00169 DHX34-201ENST00000328771 4372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
PITPNAQ00169 TRMT1L-201ENST00000367506 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PITPNAQ00169 MICB-202ENST00000399150 2346 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PITPNAQ00169 SPHK2-206ENST00000598088 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PITPNAQ00169 PLXNB1-201ENST00000296440 7143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PITPNAQ00169 AC093668.2-201ENST00000481893 3569 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
PITPNAQ00169 AC105052.1-201ENST00000519541 3569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
PITPNAQ00169 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PITPNAQ00169 KREMEN1-202ENST00000400335 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms