Protein–RNA interactions for Protein: P78312

FAM193A, Protein FAM193A, humanhuman

Predictions only

Length 1,265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM193AP78312 BAK1-203ENST00000442998 2212 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM193AP78312 ZNF609-202ENST00000416172 3863 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM193AP78312 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FAM193AP78312 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM193AP78312 MAP2K3-203ENST00000361818 2034 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM193AP78312 KIRREL3-205ENST00000529097 3397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM193AP78312 SLC4A5-201ENST00000346834 6233 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM193AP78312 GPR88-201ENST00000315033 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM193AP78312 HSD17B4-215ENST00000510025 2589 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM193AP78312 RRAGD-201ENST00000359203 4042 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM193AP78312 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM193AP78312 EGR1-201ENST00000239938 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM193AP78312 ATG9A-201ENST00000361242 3130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM193AP78312 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM193AP78312 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM193AP78312 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM193AP78312 PPFIA4-204ENST00000447715 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM193AP78312 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM193AP78312 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM193AP78312 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM193AP78312 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM193AP78312 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM193AP78312 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM193AP78312 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM193AP78312 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM193AP78312 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM193AP78312 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM193AP78312 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM193AP78312 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM193AP78312 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM193AP78312 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM193AP78312 PLSCR4-203ENST00000433593 2839 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM193AP78312 MAP3K12-203ENST00000547035 2944 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM193AP78312 PLCD1-204ENST00000463876 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM193AP78312 KLHL9-201ENST00000359039 5710 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM193AP78312 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM193AP78312 FIBCD1-202ENST00000372338 3253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM193AP78312 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM193AP78312 FNTB-201ENST00000246166 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM193AP78312 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
FAM193AP78312 AP5Z1-201ENST00000348624 2901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
FAM193AP78312 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
FAM193AP78312 HACD2-201ENST00000383657 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
FAM193AP78312 PSEN2-202ENST00000366783 2306 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
FAM193AP78312 NOTCH1-201ENST00000277541 9371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
FAM193AP78312 ABI2-201ENST00000261016 6634 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
FAM193AP78312 ABI2-203ENST00000261018 6638 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
FAM193AP78312 MAN2B1-203ENST00000456935 3184 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
FAM193AP78312 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
FAM193AP78312 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
FAM193AP78312 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
FAM193AP78312 B3GNT5-202ENST00000460419 3368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
FAM193AP78312 LRRC20-201ENST00000355790 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM193AP78312 CHMP7-202ENST00000397677 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM193AP78312 ADAMTSL4-203ENST00000369039 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM193AP78312 VPS9D1-202ENST00000561976 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM193AP78312 PPP1R3D-201ENST00000370996 3630 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM193AP78312 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM193AP78312 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM193AP78312 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM193AP78312 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM193AP78312 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM193AP78312 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM193AP78312 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM193AP78312 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM193AP78312 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM193AP78312 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM193AP78312 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM193AP78312 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM193AP78312 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM193AP78312 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM193AP78312 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM193AP78312 TMEM25-204ENST00000359862 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM193AP78312 ACIN1-202ENST00000338631 2445 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM193AP78312 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM193AP78312 SERBP1-204ENST00000370995 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM193AP78312 CREB3L4-204ENST00000368603 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM193AP78312 FFAR4-202ENST00000371483 3653 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM193AP78312 CREBL2-201ENST00000228865 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM193AP78312 TNS2-202ENST00000314276 4944 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM193AP78312 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM193AP78312 SGCE-202ENST00000415788 1871 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM193AP78312 KIFC3-202ENST00000421376 3128 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM193AP78312 RIOK3-203ENST00000577501 1904 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM193AP78312 STK26-202ENST00000394334 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM193AP78312 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM193AP78312 FAM189A1-201ENST00000261275 4705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM193AP78312 BTRC-203ENST00000393441 6084 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM193AP78312 AC012184.2-203ENST00000443119 2110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM193AP78312 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM193AP78312 IFITM10-201ENST00000340134 3706 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM193AP78312 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM193AP78312 GRIN1-204ENST00000371553 3751 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM193AP78312 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM193AP78312 PLEKHB2-205ENST00000409279 2488 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM193AP78312 RAPGEF3-218ENST00000548919 2776 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM193AP78312 DAGLB-201ENST00000297056 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM193AP78312 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM193AP78312 ATP2C2-AS1-201ENST00000565700 2998 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM193AP78312 PRCP-201ENST00000313010 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.7 ms