Protein–RNA interactions for Protein: P62068

USP46, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 46, humanhuman

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP46P62068 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
USP46P62068 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
USP46P62068 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
USP46P62068 RN7SL774P-201ENST00000577467 290 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
USP46P62068 ZNFX1-AS1_1.1-201ENST00000615787 198 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
USP46P62068 LINC01670-203ENST00000624859 977 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
USP46P62068 TUBB3-215ENST00000625617 570 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
USP46P62068 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
USP46P62068 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
USP46P62068 CABP4-201ENST00000325656 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
USP46P62068 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
USP46P62068 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
USP46P62068 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
USP46P62068 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
USP46P62068 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
USP46P62068 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
USP46P62068 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
USP46P62068 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
USP46P62068 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
USP46P62068 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
USP46P62068 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
USP46P62068 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
USP46P62068 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
USP46P62068 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
USP46P62068 ZNF790-207ENST00000614179 2361 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
USP46P62068 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
USP46P62068 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
USP46P62068 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
USP46P62068 LINC01837-201ENST00000590021 1320 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
USP46P62068 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
USP46P62068 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
USP46P62068 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
USP46P62068 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
USP46P62068 ANXA6-202ENST00000377751 1430 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
USP46P62068 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
USP46P62068 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
USP46P62068 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
USP46P62068 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
USP46P62068 THTPA-201ENST00000288014 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
USP46P62068 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
USP46P62068 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
USP46P62068 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
USP46P62068 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
USP46P62068 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
USP46P62068 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
USP46P62068 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
USP46P62068 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
USP46P62068 OR5D16-201ENST00000378396 987 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
USP46P62068 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
USP46P62068 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
USP46P62068 AL357558.1-201ENST00000416646 456 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
USP46P62068 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
USP46P62068 AGTRAP-206ENST00000452018 809 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
USP46P62068 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
USP46P62068 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
USP46P62068 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
USP46P62068 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
USP46P62068 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
USP46P62068 GFER-204ENST00000567719 483 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
USP46P62068 AC025810.1-201ENST00000569986 981 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
USP46P62068 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
USP46P62068 AC127024.2-201ENST00000581019 789 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
USP46P62068 C17orf50-202ENST00000604830 477 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
USP46P62068 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
USP46P62068 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
USP46P62068 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
USP46P62068 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
USP46P62068 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
USP46P62068 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
USP46P62068 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
USP46P62068 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
USP46P62068 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
USP46P62068 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
USP46P62068 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
USP46P62068 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
USP46P62068 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
USP46P62068 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
USP46P62068 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
USP46P62068 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
USP46P62068 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
USP46P62068 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
USP46P62068 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
USP46P62068 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
USP46P62068 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
USP46P62068 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
USP46P62068 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
USP46P62068 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
USP46P62068 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
USP46P62068 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
USP46P62068 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
USP46P62068 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
USP46P62068 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
USP46P62068 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
USP46P62068 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
USP46P62068 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
USP46P62068 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
USP46P62068 STX18-AS1-207ENST00000610009 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
USP46P62068 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
USP46P62068 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
USP46P62068 ZFYVE28-211ENST00000515312 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.1 ms