Protein–RNA interactions for Protein: P48165

GJA8, Gap junction alpha-8 protein, humanhuman

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA8P48165 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GJA8P48165 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GJA8P48165 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GJA8P48165 S100A13-203ENST00000392623 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GJA8P48165 LINC00339-202ENST00000416769 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GJA8P48165 KRT18P4-201ENST00000422599 1288 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
GJA8P48165 SNX3-204ENST00000426155 1072 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GJA8P48165 BX248123.1-201ENST00000429070 606 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GJA8P48165 GAS5-209ENST00000430245 723 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GJA8P48165 AL512599.1-201ENST00000430724 685 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
GJA8P48165 CDK2-203ENST00000440311 1031 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GJA8P48165 AC087071.1-201ENST00000469264 427 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GJA8P48165 AC108474.1-201ENST00000507776 421 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GJA8P48165 FXYD6-208ENST00000529335 708 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GJA8P48165 F11R-204ENST00000537746 1245 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GJA8P48165 NAA40-205ENST00000539656 577 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GJA8P48165 VENTXP3-201ENST00000546480 773 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
GJA8P48165 RPL18-205ENST00000549273 1036 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GJA8P48165 AC023968.2-201ENST00000560593 1049 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
GJA8P48165 NDUFB10P1-201ENST00000567319 521 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
GJA8P48165 AC019294.2-203ENST00000569596 594 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GJA8P48165 STAT5A-208ENST00000587646 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GJA8P48165 CTSH-218ENST00000615999 972 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GJA8P48165 Metazoa_SRP.157-201ENST00000622819 262 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
GJA8P48165 ADAMTS9-AS1-216ENST00000626280 882 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GJA8P48165 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GJA8P48165 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GJA8P48165 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GJA8P48165 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GJA8P48165 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GJA8P48165 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GJA8P48165 MRM2-201ENST00000242257 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GJA8P48165 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GJA8P48165 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GJA8P48165 C3orf52-202ENST00000431717 2054 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GJA8P48165 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GJA8P48165 ARRB2-218ENST00000575877 1579 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GJA8P48165 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GJA8P48165 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GJA8P48165 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GJA8P48165 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GJA8P48165 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GJA8P48165 PSG4-203ENST00000433626 1887 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GJA8P48165 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GJA8P48165 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GJA8P48165 LINC00905-203ENST00000588838 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GJA8P48165 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GJA8P48165 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GJA8P48165 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GJA8P48165 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GJA8P48165 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
GJA8P48165 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GJA8P48165 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GJA8P48165 BIN3-202ENST00000399977 1340 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GJA8P48165 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GJA8P48165 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GJA8P48165 PIFO-201ENST00000369737 746 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GJA8P48165 AQP7-202ENST00000377425 1068 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GJA8P48165 ID2-AS1-201ENST00000412712 953 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GJA8P48165 SIX3-AS1-201ENST00000419364 844 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GJA8P48165 AC103702.2-203ENST00000425510 379 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GJA8P48165 NSD2-209ENST00000436793 835 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GJA8P48165 HIST1H2APS2-201ENST00000454426 370 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
GJA8P48165 ANKRD2-204ENST00000455090 1072 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GJA8P48165 CD300LF-206ENST00000464910 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GJA8P48165 RN7SL375P-201ENST00000492442 298 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
GJA8P48165 KRT18P37-201ENST00000520711 1282 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
GJA8P48165 TNFSF13B-206ENST00000542136 495 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GJA8P48165 DUT-207ENST00000559416 635 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GJA8P48165 LOXL1-AS1-207ENST00000565689 735 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GJA8P48165 HNRNPA1P16-201ENST00000575692 955 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
GJA8P48165 AC110057.1-201ENST00000636031 898 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
GJA8P48165 ATP5A1-201ENST00000282050 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GJA8P48165 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GJA8P48165 TMEM9-203ENST00000367333 1564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GJA8P48165 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GJA8P48165 SERPINA1-209ENST00000449399 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GJA8P48165 KCTD18-202ENST00000409157 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GJA8P48165 SARS2-202ENST00000430193 1886 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GJA8P48165 PPHLN1-223ENST00000610488 1521 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GJA8P48165 OPRM1-201ENST00000229768 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GJA8P48165 OPRM1-207ENST00000428397 1481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GJA8P48165 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GJA8P48165 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GJA8P48165 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GJA8P48165 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GJA8P48165 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
GJA8P48165 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GJA8P48165 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GJA8P48165 MRGPRX4-201ENST00000314254 1444 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GJA8P48165 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GJA8P48165 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GJA8P48165 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GJA8P48165 FKBP4P8-201ENST00000610931 1369 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
GJA8P48165 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GJA8P48165 AC109466.1-209ENST00000486913 1618 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GJA8P48165 ARL1-202ENST00000536227 1322 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GJA8P48165 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GJA8P48165 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GJA8P48165 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.3 ms