Protein–RNA interactions for Protein: P45974

USP5, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 5, humanhuman

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP5P45974 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
USP5P45974 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
USP5P45974 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
USP5P45974 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
USP5P45974 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
USP5P45974 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
USP5P45974 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
USP5P45974 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
USP5P45974 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
USP5P45974 KRTAP2-4-201ENST00000394015 764 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
USP5P45974 AC006335.1-201ENST00000445200 547 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
USP5P45974 ZNF529-AS1-201ENST00000448373 1004 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
USP5P45974 AL160290.2-202ENST00000448671 574 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
USP5P45974 SUPT4H1P2-201ENST00000501248 353 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
USP5P45974 AC005833.2-201ENST00000527518 1249 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
USP5P45974 AC004706.3-207ENST00000634823 977 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
USP5P45974 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
USP5P45974 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
USP5P45974 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
USP5P45974 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
USP5P45974 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
USP5P45974 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
USP5P45974 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
USP5P45974 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
USP5P45974 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
USP5P45974 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
USP5P45974 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
USP5P45974 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
USP5P45974 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
USP5P45974 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
USP5P45974 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
USP5P45974 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
USP5P45974 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
USP5P45974 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
USP5P45974 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
USP5P45974 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
USP5P45974 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
USP5P45974 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
USP5P45974 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
USP5P45974 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
USP5P45974 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
USP5P45974 THOC6-201ENST00000253952 1246 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
USP5P45974 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
USP5P45974 BORCS5-201ENST00000298571 549 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
USP5P45974 UQCRQ-203ENST00000378670 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
USP5P45974 AC012506.3-201ENST00000415245 892 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
USP5P45974 FKBP11-202ENST00000444214 630 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
USP5P45974 LAMA4-209ENST00000453937 645 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
USP5P45974 GUSBP1-202ENST00000508260 1012 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
USP5P45974 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
USP5P45974 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
USP5P45974 NAA40-206ENST00000542163 1035 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
USP5P45974 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
USP5P45974 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
USP5P45974 GFER-204ENST00000567719 483 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
USP5P45974 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
USP5P45974 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
USP5P45974 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
USP5P45974 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
USP5P45974 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
USP5P45974 SLC35G2-201ENST00000393079 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
USP5P45974 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
USP5P45974 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
USP5P45974 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
USP5P45974 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
USP5P45974 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
USP5P45974 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
USP5P45974 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
USP5P45974 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
USP5P45974 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
USP5P45974 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
USP5P45974 GPSM3-209ENST00000487761 1460 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
USP5P45974 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
USP5P45974 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
USP5P45974 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
USP5P45974 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
USP5P45974 SEZ6-201ENST00000317338 4471 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
USP5P45974 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
USP5P45974 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
USP5P45974 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
USP5P45974 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
USP5P45974 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
USP5P45974 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
USP5P45974 AXIN2-201ENST00000307078 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
USP5P45974 NIT1-203ENST00000368009 1362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
USP5P45974 LINC02405-201ENST00000512624 1361 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
USP5P45974 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
USP5P45974 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
USP5P45974 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
USP5P45974 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
USP5P45974 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
USP5P45974 RHOXF1-201ENST00000217999 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
USP5P45974 SLC25A26-201ENST00000336733 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
USP5P45974 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
USP5P45974 FCRLB-202ENST00000367944 1172 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
USP5P45974 FCRLB-203ENST00000367945 1131 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
USP5P45974 AC239868.1-201ENST00000369385 493 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
USP5P45974 XBP1P1-201ENST00000436573 652 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
USP5P45974 AC018680.1-202ENST00000500324 525 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
USP5P45974 TMBIM4-205ENST00000535812 766 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms