Protein–RNA interactions for Protein: P26951

IL3RA, Interleukin-3 receptor subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IL3RAP26951 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
IL3RAP26951 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
IL3RAP26951 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
IL3RAP26951 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
IL3RAP26951 C20orf203-202ENST00000608990 5076 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
IL3RAP26951 TKFC-201ENST00000394900 4696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
IL3RAP26951 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
IL3RAP26951 RET-205ENST00000615310 4337 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
IL3RAP26951 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
IL3RAP26951 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
IL3RAP26951 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
IL3RAP26951 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
IL3RAP26951 SEPT9-220ENST00000588690 2919 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
IL3RAP26951 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
IL3RAP26951 AC108002.1-201ENST00000520572 5684 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
IL3RAP26951 COL6A4P2-202ENST00000504443 2753 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
IL3RAP26951 KDM2B-202ENST00000377071 4595 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
IL3RAP26951 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
IL3RAP26951 SETD1B-202ENST00000542440 8185 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
IL3RAP26951 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
IL3RAP26951 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
IL3RAP26951 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
IL3RAP26951 PTPRVP-205ENST00000641549 5067 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
IL3RAP26951 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
IL3RAP26951 OFD1-204ENST00000398395 3307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
IL3RAP26951 ANTXR2-203ENST00000403729 8273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
IL3RAP26951 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
IL3RAP26951 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
IL3RAP26951 ADCYAP1R1-201ENST00000304166 6487 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
IL3RAP26951 CERKL-206ENST00000410087 3208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
IL3RAP26951 UGT3A2-201ENST00000282507 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
IL3RAP26951 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
IL3RAP26951 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
IL3RAP26951 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
IL3RAP26951 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
IL3RAP26951 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
IL3RAP26951 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
IL3RAP26951 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
IL3RAP26951 DNMT3B-204ENST00000353855 4237 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
IL3RAP26951 PAQR3-209ENST00000512733 9811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
IL3RAP26951 DUSP28-202ENST00000405954 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
IL3RAP26951 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
IL3RAP26951 ARHGAP20-201ENST00000260283 6189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
IL3RAP26951 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
IL3RAP26951 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
IL3RAP26951 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
IL3RAP26951 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
IL3RAP26951 A1CF-202ENST00000373993 1997 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
IL3RAP26951 SPTBN2-201ENST00000309996 7866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
IL3RAP26951 SLC4A11-202ENST00000380059 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
IL3RAP26951 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
IL3RAP26951 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
IL3RAP26951 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
IL3RAP26951 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
IL3RAP26951 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
IL3RAP26951 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
IL3RAP26951 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
IL3RAP26951 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
IL3RAP26951 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
IL3RAP26951 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
IL3RAP26951 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC12.22□□□□□ -0.45
IL3RAP26951 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
IL3RAP26951 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
IL3RAP26951 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
IL3RAP26951 PITRM1-206ENST00000451104 3183 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
IL3RAP26951 PRDM10-202ENST00000358825 6322 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
IL3RAP26951 PRDM10-203ENST00000360871 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
IL3RAP26951 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
IL3RAP26951 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
IL3RAP26951 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
IL3RAP26951 DGCR9-201ENST00000609630 2415 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
IL3RAP26951 OSBPL1A-201ENST00000319481 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
IL3RAP26951 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
IL3RAP26951 PDZD7-206ENST00000619208 4135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
IL3RAP26951 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
IL3RAP26951 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
IL3RAP26951 CACNA1G-228ENST00000514079 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
IL3RAP26951 FBXL19-201ENST00000338343 3965 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
IL3RAP26951 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
IL3RAP26951 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
IL3RAP26951 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
IL3RAP26951 MAP3K4-203ENST00000366920 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
IL3RAP26951 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
IL3RAP26951 WDR17-205ENST00000508596 4294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
IL3RAP26951 ZNF782-205ENST00000481138 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
IL3RAP26951 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
IL3RAP26951 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
IL3RAP26951 TMEM131L-202ENST00000409663 5017 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
IL3RAP26951 PELP1-212ENST00000574876 3465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
IL3RAP26951 MADD-203ENST00000349238 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
IL3RAP26951 ZNF800-203ENST00000393313 4358 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
IL3RAP26951 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
IL3RAP26951 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
IL3RAP26951 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC12.21□□□□□ -0.45
IL3RAP26951 ARHGAP45-201ENST00000313093 4273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
IL3RAP26951 TMEM212-201ENST00000334567 1881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
IL3RAP26951 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
IL3RAP26951 PRR12-201ENST00000418929 6955 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
IL3RAP26951 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
IL3RAP26951 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms