Protein–RNA interactions for Protein: P25024

CXCR1, C-X-C chemokine receptor type 1, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCR1P25024 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
CXCR1P25024 GRIN1-203ENST00000371550 3940 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CXCR1P25024 SYT12-201ENST00000393946 4534 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CXCR1P25024 ADGRL1-201ENST00000340736 7853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CXCR1P25024 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CXCR1P25024 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CXCR1P25024 PHACTR2-202ENST00000367582 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CXCR1P25024 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CXCR1P25024 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CXCR1P25024 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CXCR1P25024 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CXCR1P25024 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CXCR1P25024 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CXCR1P25024 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CXCR1P25024 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CXCR1P25024 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CXCR1P25024 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
CXCR1P25024 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CXCR1P25024 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CXCR1P25024 GMCL1-201ENST00000282570 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CXCR1P25024 EDEM3-201ENST00000318130 6898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CXCR1P25024 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CXCR1P25024 USP22-201ENST00000261497 5220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CXCR1P25024 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CXCR1P25024 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CXCR1P25024 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CXCR1P25024 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CXCR1P25024 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
CXCR1P25024 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
CXCR1P25024 GRID2IP-203ENST00000457091 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CXCR1P25024 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
CXCR1P25024 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CXCR1P25024 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CXCR1P25024 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CXCR1P25024 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CXCR1P25024 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CXCR1P25024 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CXCR1P25024 IKZF1-218ENST00000615491 5637 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CXCR1P25024 MOB3C-203ENST00000371940 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CXCR1P25024 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CXCR1P25024 WWTR1-203ENST00000465804 5030 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CXCR1P25024 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CXCR1P25024 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CXCR1P25024 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CXCR1P25024 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CXCR1P25024 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CXCR1P25024 GTF2I-215ENST00000614986 4415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CXCR1P25024 GTF2I-221ENST00000621734 4412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CXCR1P25024 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CXCR1P25024 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CXCR1P25024 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CXCR1P25024 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CXCR1P25024 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
CXCR1P25024 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CXCR1P25024 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CXCR1P25024 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
CXCR1P25024 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CXCR1P25024 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CXCR1P25024 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
CXCR1P25024 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CXCR1P25024 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CXCR1P25024 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CXCR1P25024 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CXCR1P25024 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CXCR1P25024 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CXCR1P25024 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CXCR1P25024 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CXCR1P25024 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
CXCR1P25024 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CXCR1P25024 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CXCR1P25024 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CXCR1P25024 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CXCR1P25024 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CXCR1P25024 ADCYAP1R1-207ENST00000614107 6575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CXCR1P25024 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CXCR1P25024 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CXCR1P25024 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CXCR1P25024 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CXCR1P25024 ANKH-201ENST00000284268 8203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CXCR1P25024 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CXCR1P25024 COL20A1-203ENST00000422202 8097 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CXCR1P25024 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CXCR1P25024 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CXCR1P25024 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
CXCR1P25024 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CXCR1P25024 CACNA2D1-202ENST00000356860 7563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CXCR1P25024 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CXCR1P25024 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CXCR1P25024 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CXCR1P25024 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CXCR1P25024 WAPL-201ENST00000263070 5987 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CXCR1P25024 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
CXCR1P25024 AL356275.1-201ENST00000638446 7440 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CXCR1P25024 RAB18-208ENST00000611151 4931 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CXCR1P25024 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CXCR1P25024 TP73-201ENST00000346387 4854 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
CXCR1P25024 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CXCR1P25024 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CXCR1P25024 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
CXCR1P25024 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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