Protein–RNA interactions for Protein: P24390

KDELR1, ER lumen protein-retaining receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDELR1P24390 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KDELR1P24390 SAR1A-204ENST00000373241 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KDELR1P24390 NFE2L2-202ENST00000397063 2651 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KDELR1P24390 HSD17B4-215ENST00000510025 2589 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KDELR1P24390 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KDELR1P24390 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KDELR1P24390 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KDELR1P24390 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KDELR1P24390 SNRPC-202ENST00000374017 1054 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KDELR1P24390 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KDELR1P24390 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KDELR1P24390 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KDELR1P24390 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
KDELR1P24390 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KDELR1P24390 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KDELR1P24390 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KDELR1P24390 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KDELR1P24390 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KDELR1P24390 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
KDELR1P24390 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
KDELR1P24390 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KDELR1P24390 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
KDELR1P24390 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KDELR1P24390 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KDELR1P24390 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KDELR1P24390 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KDELR1P24390 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KDELR1P24390 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
KDELR1P24390 RCAN2-203ENST00000371374 3327 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KDELR1P24390 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KDELR1P24390 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KDELR1P24390 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KDELR1P24390 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KDELR1P24390 MARK2-206ENST00000425897 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KDELR1P24390 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KDELR1P24390 GPR84-202ENST00000551809 2041 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KDELR1P24390 CCT7-201ENST00000258091 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KDELR1P24390 CCDC186-202ENST00000369286 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KDELR1P24390 MFAP4-202ENST00000395592 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KDELR1P24390 FGF12-207ENST00000454309 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KDELR1P24390 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KDELR1P24390 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KDELR1P24390 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KDELR1P24390 ELOA2-202ENST00000620522 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KDELR1P24390 APBB1-203ENST00000389906 2684 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KDELR1P24390 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
KDELR1P24390 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KDELR1P24390 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KDELR1P24390 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KDELR1P24390 MAPKAP1-204ENST00000373498 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KDELR1P24390 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KDELR1P24390 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KDELR1P24390 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KDELR1P24390 WIZ-203ENST00000545156 4466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KDELR1P24390 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KDELR1P24390 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KDELR1P24390 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KDELR1P24390 CNOT9-201ENST00000273064 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KDELR1P24390 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KDELR1P24390 HDAC11-213ENST00000437379 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KDELR1P24390 RNF167-201ENST00000262482 1915 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KDELR1P24390 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KDELR1P24390 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KDELR1P24390 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KDELR1P24390 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KDELR1P24390 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KDELR1P24390 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KDELR1P24390 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KDELR1P24390 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
KDELR1P24390 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KDELR1P24390 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
KDELR1P24390 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KDELR1P24390 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KDELR1P24390 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KDELR1P24390 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KDELR1P24390 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KDELR1P24390 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KDELR1P24390 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KDELR1P24390 TPD52L2-206ENST00000358548 2275 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KDELR1P24390 ARID3B-201ENST00000346246 4271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KDELR1P24390 STIP1-203ENST00000358794 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KDELR1P24390 C12orf73-201ENST00000378090 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KDELR1P24390 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
KDELR1P24390 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KDELR1P24390 PRKAB1-201ENST00000229328 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KDELR1P24390 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KDELR1P24390 TBC1D3-201ENST00000620215 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KDELR1P24390 TBC1D3C-201ENST00000622206 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KDELR1P24390 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KDELR1P24390 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KDELR1P24390 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KDELR1P24390 EXO5-201ENST00000296380 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KDELR1P24390 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KDELR1P24390 NDRG4-217ENST00000562999 2931 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KDELR1P24390 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KDELR1P24390 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KDELR1P24390 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KDELR1P24390 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KDELR1P24390 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KDELR1P24390 FAM149A-203ENST00000389354 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.9 ms