Protein–RNA interactions for Protein: P23467

PTPRB, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, humanhuman

Predictions only

Length 1,997 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRBP23467 IGHV1-3-201ENST00000390595 395 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PTPRBP23467 AP001628.2-201ENST00000420273 784 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PTPRBP23467 HNRNPA3P6-201ENST00000472163 1006 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
PTPRBP23467 TMEM14B-215ENST00000481240 1032 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PTPRBP23467 LINC00301-203ENST00000527161 749 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PTPRBP23467 MIR4254-201ENST00000581063 76 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
PTPRBP23467 ATF7-212ENST00000591397 860 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PTPRBP23467 AC113385.2-201ENST00000614465 762 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
PTPRBP23467 AC106782.5-201ENST00000616011 337 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
PTPRBP23467 AC026336.4-201ENST00000624565 1050 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
PTPRBP23467 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PTPRBP23467 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PTPRBP23467 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PTPRBP23467 AC064801.2-201ENST00000625052 1303 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
PTPRBP23467 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PTPRBP23467 FAM226B-201ENST00000602508 1490 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
PTPRBP23467 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PTPRBP23467 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PTPRBP23467 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PTPRBP23467 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PTPRBP23467 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PTPRBP23467 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PTPRBP23467 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PTPRBP23467 SEC61B-201ENST00000223641 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PTPRBP23467 U3.5-201ENST00000363448 216 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
PTPRBP23467 COA6-203ENST00000366615 710 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PTPRBP23467 TMEM14B-201ENST00000379530 787 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PTPRBP23467 AL591242.1-201ENST00000422284 343 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PTPRBP23467 AL137244.1-201ENST00000422931 865 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
PTPRBP23467 HNRNPA1P21-201ENST00000424115 961 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
PTPRBP23467 RPSAP12-201ENST00000435879 888 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
PTPRBP23467 AC074389.3-201ENST00000450458 454 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PTPRBP23467 HFE-209ENST00000461397 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PTPRBP23467 SEC61B-203ENST00000498603 587 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PTPRBP23467 C5orf63-203ENST00000509733 553 ntTSL 4 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PTPRBP23467 BATF-202ENST00000555504 361 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PTPRBP23467 HNRNPA1P5-201ENST00000558213 966 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
PTPRBP23467 AC123912.6-201ENST00000612657 315 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
PTPRBP23467 PAX6-264ENST00000640125 1375 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PTPRBP23467 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PTPRBP23467 CERCAM-214ENST00000613052 1429 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PTPRBP23467 AKR1C2-202ENST00000421196 1481 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PTPRBP23467 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PTPRBP23467 ADPRH-205ENST00000478927 1501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PTPRBP23467 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PTPRBP23467 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PTPRBP23467 CACNA1A-211ENST00000592864 1623 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PTPRBP23467 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PTPRBP23467 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PTPRBP23467 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PTPRBP23467 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PTPRBP23467 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PTPRBP23467 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PTPRBP23467 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PTPRBP23467 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PTPRBP23467 CCL25-202ENST00000315626 450 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PTPRBP23467 MT1H-201ENST00000332374 397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PTPRBP23467 SKOR2-201ENST00000400404 891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PTPRBP23467 SF3B1-204ENST00000414963 651 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PTPRBP23467 AC099328.1-201ENST00000498809 1030 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
PTPRBP23467 AC097381.2-201ENST00000510640 859 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PTPRBP23467 ACY3-202ENST00000529256 933 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PTPRBP23467 TROAP-213ENST00000550709 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PTPRBP23467 RORA-AS1-202ENST00000558140 869 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PTPRBP23467 FAM187B2P-201ENST00000577135 713 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
PTPRBP23467 HKR1-220ENST00000591259 734 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PTPRBP23467 AL353622.2-201ENST00000605846 425 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
PTPRBP23467 UBL7-206ENST00000565335 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PTPRBP23467 AC092115.1-201ENST00000566277 1402 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
PTPRBP23467 CHRNA1-205ENST00000409542 1460 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PTPRBP23467 SVOPL-202ENST00000419765 1523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PTPRBP23467 HTD2-205ENST00000477305 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PTPRBP23467 IMMT-212ENST00000620815 1520 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PTPRBP23467 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PTPRBP23467 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PTPRBP23467 CCDC86-201ENST00000227520 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PTPRBP23467 UBE2A-202ENST00000371558 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PTPRBP23467 DSG1-202ENST00000462981 1857 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PTPRBP23467 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PTPRBP23467 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PTPRBP23467 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PTPRBP23467 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PTPRBP23467 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PTPRBP23467 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PTPRBP23467 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PTPRBP23467 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PTPRBP23467 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PTPRBP23467 CYP1B1-AS1-201ENST00000413828 1781 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PTPRBP23467 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PTPRBP23467 PRL-201ENST00000306482 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PTPRBP23467 OLFML2B-202ENST00000367938 1153 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PTPRBP23467 KRTAP2-3-201ENST00000391418 875 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PTPRBP23467 TRAPPC4-202ENST00000434101 794 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PTPRBP23467 FAM138B-202ENST00000446648 1130 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PTPRBP23467 FAM138C-202ENST00000449442 1126 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PTPRBP23467 CSTP2-201ENST00000610599 398 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
PTPRBP23467 FAM138F-201ENST00000631376 1183 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PTPRBP23467 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PTPRBP23467 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PTPRBP23467 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.2 ms