Protein–RNA interactions for Protein: P23229

ITGA6, Integrin alpha-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA6P23229 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ITGA6P23229 IL27-201ENST00000356897 1044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ITGA6P23229 BEX2-201ENST00000372674 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ITGA6P23229 CITED1-202ENST00000373619 886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ITGA6P23229 RNF144A-AS1-203ENST00000426122 579 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ITGA6P23229 RHBDD2-203ENST00000428119 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ITGA6P23229 BX276092.5-201ENST00000439926 886 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ITGA6P23229 TAC3-208ENST00000441881 731 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ITGA6P23229 AC093151.3-202ENST00000445073 709 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ITGA6P23229 ARMCX3-AS1-201ENST00000454228 490 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ITGA6P23229 AC008267.1-201ENST00000474858 1069 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
ITGA6P23229 AC009487.3-201ENST00000505579 560 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ITGA6P23229 APOC1P1-201ENST00000507983 630 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ITGA6P23229 LINC01598-205ENST00000508763 719 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ITGA6P23229 KRT8P1-201ENST00000557533 1207 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
ITGA6P23229 AC111170.1-201ENST00000591110 1132 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ITGA6P23229 SMIM22-209ENST00000591870 355 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ITGA6P23229 U62317.3-201ENST00000608319 855 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
ITGA6P23229 TAC3-211ENST00000615887 1120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ITGA6P23229 AC242376.2-201ENST00000619355 883 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
ITGA6P23229 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ITGA6P23229 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ITGA6P23229 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ITGA6P23229 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ITGA6P23229 LHFPL3-201ENST00000401970 1378 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ITGA6P23229 CTSL-201ENST00000340342 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ITGA6P23229 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ITGA6P23229 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ITGA6P23229 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ITGA6P23229 GJB1-203ENST00000374029 1587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ITGA6P23229 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ITGA6P23229 BRD7P5-201ENST00000299197 1822 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
ITGA6P23229 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ITGA6P23229 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ITGA6P23229 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ITGA6P23229 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ITGA6P23229 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ITGA6P23229 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ITGA6P23229 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ITGA6P23229 MRPL19-201ENST00000358788 693 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ITGA6P23229 CST9L-201ENST00000376979 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ITGA6P23229 ARL16-201ENST00000397498 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ITGA6P23229 PCBP3-201ENST00000400304 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ITGA6P23229 PCBP3-208ENST00000449640 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ITGA6P23229 FTH1P22-201ENST00000456305 520 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
ITGA6P23229 AC105389.3-201ENST00000508038 907 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ITGA6P23229 AC140658.4-201ENST00000561990 352 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
ITGA6P23229 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ITGA6P23229 AC087045.2-201ENST00000606279 1003 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
ITGA6P23229 ARL16-214ENST00000621051 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ITGA6P23229 AC092978.1-201ENST00000474979 1309 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ITGA6P23229 AC092978.1-202ENST00000637590 1327 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
ITGA6P23229 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ITGA6P23229 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ITGA6P23229 MARK2P16-201ENST00000605714 1723 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
ITGA6P23229 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ITGA6P23229 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ITGA6P23229 CD59-201ENST00000351554 1775 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ITGA6P23229 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ITGA6P23229 METAP2-205ENST00000546753 1862 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ITGA6P23229 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ITGA6P23229 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ITGA6P23229 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ITGA6P23229 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ITGA6P23229 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ITGA6P23229 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ITGA6P23229 TAF12-201ENST00000263974 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ITGA6P23229 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ITGA6P23229 PLAC8L1-201ENST00000311450 638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ITGA6P23229 LGALS12-202ENST00000340246 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ITGA6P23229 SOD2-202ENST00000367054 815 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ITGA6P23229 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ITGA6P23229 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ITGA6P23229 PEX13-203ENST00000414712 1014 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ITGA6P23229 AL021707.5-201ENST00000420118 461 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ITGA6P23229 IDI2-AS1-201ENST00000420381 672 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ITGA6P23229 OR8T1P-201ENST00000421347 918 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
ITGA6P23229 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ITGA6P23229 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ITGA6P23229 MYL7-209ENST00000458240 791 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ITGA6P23229 KLHDC8A-203ENST00000460687 1022 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ITGA6P23229 PGAP2-212ENST00000464906 1259 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ITGA6P23229 HOXB-AS3-206ENST00000474040 741 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ITGA6P23229 TVP23C-205ENST00000518321 1080 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ITGA6P23229 SNHG21-204ENST00000559366 674 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ITGA6P23229 TPM1-223ENST00000560445 485 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ITGA6P23229 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ITGA6P23229 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ITGA6P23229 MIR6842-201ENST00000612539 65 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
ITGA6P23229 COX6A1P2-201ENST00000620597 330 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
ITGA6P23229 CMC2-224ENST00000630396 481 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ITGA6P23229 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ITGA6P23229 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ITGA6P23229 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ITGA6P23229 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ITGA6P23229 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ITGA6P23229 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ITGA6P23229 GMEB1-202ENST00000361872 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ITGA6P23229 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ITGA6P23229 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.1 ms