Protein–RNA interactions for Protein: P20648

ATP4A, Potassium-transporting ATPase alpha chain 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP4AP20648 ATP6V1D-206ENST00000554236 888 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP4AP20648 AC124068.2-202ENST00000562356 612 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP4AP20648 AC124068.2-201ENST00000569473 1109 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP4AP20648 MIR3907-201ENST00000579424 151 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP4AP20648 MIR4754-201ENST00000582477 89 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP4AP20648 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP4AP20648 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP4AP20648 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP4AP20648 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP4AP20648 NCBP2-206ENST00000447325 2216 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP4AP20648 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP4AP20648 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP4AP20648 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP4AP20648 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP4AP20648 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP4AP20648 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP4AP20648 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP4AP20648 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP4AP20648 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP4AP20648 AHCYP4-201ENST00000419201 1315 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP4AP20648 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP4AP20648 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP4AP20648 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATP4AP20648 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP4AP20648 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP4AP20648 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP4AP20648 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP4AP20648 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP4AP20648 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP4AP20648 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP4AP20648 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP4AP20648 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP4AP20648 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP4AP20648 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP4AP20648 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP4AP20648 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP4AP20648 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP4AP20648 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP4AP20648 DKK4-201ENST00000220812 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP4AP20648 RPP40-201ENST00000319533 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP4AP20648 AL009181.1-201ENST00000418471 1085 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP4AP20648 CSTF3-202ENST00000431742 715 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP4AP20648 RTN3P1-201ENST00000536295 711 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP4AP20648 UBE3B-206ENST00000536398 1120 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP4AP20648 AC011825.3-201ENST00000583184 565 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP4AP20648 HPN-206ENST00000597419 1212 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP4AP20648 LINC01278-203ENST00000608788 820 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP4AP20648 LINC01278-207ENST00000610234 555 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP4AP20648 MBD3L2B-201ENST00000636986 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP4AP20648 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP4AP20648 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP4AP20648 COLEC11-203ENST00000382062 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP4AP20648 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP4AP20648 BSDC1-205ENST00000446293 1505 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP4AP20648 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP4AP20648 LINC00905-203ENST00000588838 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP4AP20648 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP4AP20648 AC015909.3-201ENST00000572855 1794 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP4AP20648 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP4AP20648 ADGRE2-208ENST00000595839 2046 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP4AP20648 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATP4AP20648 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP4AP20648 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP4AP20648 LINC00665-205ENST00000585356 1557 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP4AP20648 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP4AP20648 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP4AP20648 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP4AP20648 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP4AP20648 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP4AP20648 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP4AP20648 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP4AP20648 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP4AP20648 MPZL2-202ENST00000438295 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP4AP20648 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP4AP20648 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP4AP20648 SNRPN-203ENST00000400097 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP4AP20648 CELA3B-201ENST00000337107 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP4AP20648 RPS16-202ENST00000339471 643 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP4AP20648 COPS7B-205ENST00000409295 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP4AP20648 AC007274.2-201ENST00000421675 662 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP4AP20648 AL590617.2-201ENST00000432673 917 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP4AP20648 LINC00431-201ENST00000440735 1189 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP4AP20648 ZNF529-AS1-201ENST00000448373 1004 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP4AP20648 CEP164P1-201ENST00000455142 418 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP4AP20648 AL392046.1-202ENST00000457255 521 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP4AP20648 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP4AP20648 REC114-202ENST00000560581 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP4AP20648 AC026803.1-201ENST00000569130 274 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP4AP20648 AC010754.1-201ENST00000582300 1061 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP4AP20648 MIR3188-201ENST00000583494 85 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP4AP20648 CENPX-208ENST00000584347 799 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP4AP20648 MAP3K14-AS1-210ENST00000592422 831 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP4AP20648 AC011466.3-201ENST00000596563 852 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP4AP20648 BX537318.1-201ENST00000608290 1207 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP4AP20648 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP4AP20648 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP4AP20648 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP4AP20648 RASGEF1B-202ENST00000335927 1756 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP4AP20648 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATP4AP20648 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms