Protein–RNA interactions for Protein: P19838

NFKB1, Nuclear factor NF-kappa-B p105 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 968 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKB1P19838 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NFKB1P19838 ARHGAP36-201ENST00000276211 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
NFKB1P19838 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NFKB1P19838 ZNF251-201ENST00000292562 2807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
NFKB1P19838 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NFKB1P19838 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
NFKB1P19838 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC14.92□□□□□ -0.02
NFKB1P19838 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
NFKB1P19838 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NFKB1P19838 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
NFKB1P19838 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC14.92□□□□□ -0.02
NFKB1P19838 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
NFKB1P19838 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC14.92□□□□□ -0.02
NFKB1P19838 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
NFKB1P19838 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
NFKB1P19838 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
NFKB1P19838 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
NFKB1P19838 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
NFKB1P19838 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
NFKB1P19838 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
NFKB1P19838 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
NFKB1P19838 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NFKB1P19838 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NFKB1P19838 HSPA8P5-201ENST00000456928 2069 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
NFKB1P19838 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NFKB1P19838 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NFKB1P19838 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NFKB1P19838 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NFKB1P19838 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
NFKB1P19838 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NFKB1P19838 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
NFKB1P19838 ANXA9-201ENST00000368947 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NFKB1P19838 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
NFKB1P19838 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
NFKB1P19838 HPD-204ENST00000543163 1709 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
NFKB1P19838 AC008125.1-201ENST00000548488 1538 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
NFKB1P19838 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NFKB1P19838 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
NFKB1P19838 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NFKB1P19838 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NFKB1P19838 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NFKB1P19838 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NFKB1P19838 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NFKB1P19838 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NFKB1P19838 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
NFKB1P19838 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NFKB1P19838 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
NFKB1P19838 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
NFKB1P19838 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NFKB1P19838 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NFKB1P19838 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NFKB1P19838 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NFKB1P19838 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NFKB1P19838 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
NFKB1P19838 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NFKB1P19838 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
NFKB1P19838 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC14.91□□□□□ -0.02
NFKB1P19838 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NFKB1P19838 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
NFKB1P19838 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
NFKB1P19838 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
NFKB1P19838 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
NFKB1P19838 BCAT2-203ENST00000545387 1272 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NFKB1P19838 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
NFKB1P19838 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
NFKB1P19838 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
NFKB1P19838 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
NFKB1P19838 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
NFKB1P19838 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
NFKB1P19838 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
NFKB1P19838 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
NFKB1P19838 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
NFKB1P19838 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
NFKB1P19838 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NFKB1P19838 GRID2IP-203ENST00000457091 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
NFKB1P19838 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
NFKB1P19838 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NFKB1P19838 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
NFKB1P19838 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
NFKB1P19838 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
NFKB1P19838 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NFKB1P19838 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
NFKB1P19838 GOLGA8VP-201ENST00000559009 1798 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
NFKB1P19838 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NFKB1P19838 MPP2-214ENST00000523501 2121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NFKB1P19838 ARID3B-201ENST00000346246 4271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NFKB1P19838 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NFKB1P19838 NBPF26-208ENST00000620612 4602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NFKB1P19838 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NFKB1P19838 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NFKB1P19838 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NFKB1P19838 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NFKB1P19838 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NFKB1P19838 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NFKB1P19838 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NFKB1P19838 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NFKB1P19838 PAF1-204ENST00000595564 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NFKB1P19838 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
NFKB1P19838 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
NFKB1P19838 AL139260.2-201ENST00000622355 2171 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms