Protein–RNA interactions for Protein: P17987

TCP1, T-complex protein 1 subunit alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCP1P17987 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TCP1P17987 AGFG1-204ENST00000409315 2912 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TCP1P17987 CDK3-201ENST00000425876 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TCP1P17987 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TCP1P17987 PELP1-202ENST00000436683 3524 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TCP1P17987 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TCP1P17987 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TCP1P17987 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TCP1P17987 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TCP1P17987 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TCP1P17987 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TCP1P17987 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TCP1P17987 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TCP1P17987 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TCP1P17987 APBB1-220ENST00000609331 1574 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TCP1P17987 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TCP1P17987 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TCP1P17987 FOXP1-222ENST00000615603 7140 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TCP1P17987 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TCP1P17987 PTK7-203ENST00000345201 4071 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TCP1P17987 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TCP1P17987 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TCP1P17987 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TCP1P17987 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TCP1P17987 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TCP1P17987 CARHSP1-216ENST00000610831 2841 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TCP1P17987 ESS2-201ENST00000252137 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TCP1P17987 MARK1-201ENST00000366917 2946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TCP1P17987 TCAF2-202ENST00000411935 2906 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TCP1P17987 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TCP1P17987 AC012349.1-201ENST00000518662 2643 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TCP1P17987 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TCP1P17987 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TCP1P17987 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TCP1P17987 TMEM63B-202ENST00000323267 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TCP1P17987 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TCP1P17987 CPN1-201ENST00000370418 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TCP1P17987 SELENON-201ENST00000354177 4227 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TCP1P17987 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TCP1P17987 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TCP1P17987 PSIP1-203ENST00000380733 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TCP1P17987 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TCP1P17987 WASHC2C-201ENST00000336378 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TCP1P17987 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TCP1P17987 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TCP1P17987 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TCP1P17987 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TCP1P17987 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TCP1P17987 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TCP1P17987 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TCP1P17987 SNRPC-202ENST00000374017 1054 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TCP1P17987 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TCP1P17987 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TCP1P17987 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TCP1P17987 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TCP1P17987 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TCP1P17987 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TCP1P17987 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TCP1P17987 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TCP1P17987 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TCP1P17987 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TCP1P17987 PLPPR1-201ENST00000374874 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TCP1P17987 SYNRG-217ENST00000612223 8229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TCP1P17987 ARHGAP10-201ENST00000336498 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TCP1P17987 SLC9B2-202ENST00000394785 3126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TCP1P17987 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TCP1P17987 PBRM1-204ENST00000394830 5071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TCP1P17987 ANKMY1-206ENST00000401804 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TCP1P17987 VWA8-201ENST00000281496 3475 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TCP1P17987 SLC35G1-201ENST00000371408 3490 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TCP1P17987 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TCP1P17987 ANGPTL2-202ENST00000373425 3707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TCP1P17987 CCT2-201ENST00000299300 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TCP1P17987 PCK2-216ENST00000561286 2012 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TCP1P17987 ITGB4-202ENST00000449880 5689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TCP1P17987 ZNF541-202ENST00000314121 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
TCP1P17987 IKZF1-205ENST00000357364 5925 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
TCP1P17987 RAVER1-206ENST00000611074 3586 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
TCP1P17987 AC135782.3-201ENST00000562782 2105 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
TCP1P17987 ARHGEF26-202ENST00000465093 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TCP1P17987 AHCY-205ENST00000538132 2366 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
TCP1P17987 IL1RL2-201ENST00000264257 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TCP1P17987 OSBPL5-201ENST00000263650 3889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TCP1P17987 MAN2C1-216ENST00000563622 2961 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TCP1P17987 GPT2-201ENST00000340124 3984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TCP1P17987 AC064801.2-201ENST00000625052 1303 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TCP1P17987 PXDN-201ENST00000252804 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TCP1P17987 NEDD4L-238ENST00000635997 4402 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TCP1P17987 TMEM25-201ENST00000313236 2409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TCP1P17987 PPHLN1-206ENST00000395580 1693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TCP1P17987 FAM224A-201ENST00000419557 2031 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TCP1P17987 TMEM130-203ENST00000416379 2881 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TCP1P17987 C20orf203-202ENST00000608990 5076 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TCP1P17987 ADAMTSL4-203ENST00000369039 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TCP1P17987 DLGAP4-202ENST00000340491 2392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TCP1P17987 DHTKD1-201ENST00000263035 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TCP1P17987 SEMA7A-202ENST00000542748 3228 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TCP1P17987 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TCP1P17987 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TCP1P17987 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms