Protein–RNA interactions for Protein: P13612

ITGA4, Integrin alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA4P13612 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ITGA4P13612 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ITGA4P13612 LINC01233-203ENST00000601708 494 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ITGA4P13612 AL645939.5-201ENST00000606834 243 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ITGA4P13612 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ITGA4P13612 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ITGA4P13612 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ITGA4P13612 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ITGA4P13612 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ITGA4P13612 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ITGA4P13612 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ITGA4P13612 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ITGA4P13612 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ITGA4P13612 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ITGA4P13612 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ITGA4P13612 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ITGA4P13612 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ITGA4P13612 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ITGA4P13612 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ITGA4P13612 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ITGA4P13612 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ITGA4P13612 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ITGA4P13612 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ITGA4P13612 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ITGA4P13612 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ITGA4P13612 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ITGA4P13612 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ITGA4P13612 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ITGA4P13612 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ITGA4P13612 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ITGA4P13612 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ITGA4P13612 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ITGA4P13612 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ITGA4P13612 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ITGA4P13612 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ITGA4P13612 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ITGA4P13612 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ITGA4P13612 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ITGA4P13612 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ITGA4P13612 AL157373.2-201ENST00000437559 784 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ITGA4P13612 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ITGA4P13612 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ITGA4P13612 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ITGA4P13612 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ITGA4P13612 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ITGA4P13612 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ITGA4P13612 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ITGA4P13612 SYT17-208ENST00000568433 812 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ITGA4P13612 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ITGA4P13612 C17orf50-202ENST00000604830 477 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ITGA4P13612 AC026740.1-201ENST00000607068 791 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ITGA4P13612 MBD3L2B-202ENST00000637800 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ITGA4P13612 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ITGA4P13612 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ITGA4P13612 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ITGA4P13612 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ITGA4P13612 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ITGA4P13612 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ITGA4P13612 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ITGA4P13612 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ITGA4P13612 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ITGA4P13612 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ITGA4P13612 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ITGA4P13612 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ITGA4P13612 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ITGA4P13612 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ITGA4P13612 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ITGA4P13612 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ITGA4P13612 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ITGA4P13612 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ITGA4P13612 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ITGA4P13612 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ITGA4P13612 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ITGA4P13612 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ITGA4P13612 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ITGA4P13612 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ITGA4P13612 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ITGA4P13612 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ITGA4P13612 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ITGA4P13612 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ITGA4P13612 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ITGA4P13612 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ITGA4P13612 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ITGA4P13612 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ITGA4P13612 CATSPERZ-201ENST00000328404 743 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ITGA4P13612 RGS10-202ENST00000369103 804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ITGA4P13612 TMEM254-204ENST00000372277 366 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ITGA4P13612 IGLC7-201ENST00000390331 441 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ITGA4P13612 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ITGA4P13612 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ITGA4P13612 Z97180.1-201ENST00000445173 988 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ITGA4P13612 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ITGA4P13612 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ITGA4P13612 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ITGA4P13612 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ITGA4P13612 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ITGA4P13612 RN7SL11P-201ENST00000471305 293 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ITGA4P13612 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ITGA4P13612 AC129492.3-201ENST00000498285 460 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ITGA4P13612 TNNT1-203ENST00000536926 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms