Protein–RNA interactions for Protein: P12814

ACTN1, Alpha-actinin-1, humanhuman

Predictions only

Length 892 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN1P12814 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACTN1P12814 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACTN1P12814 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACTN1P12814 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACTN1P12814 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACTN1P12814 ATP6V0E2-207ENST00000479613 1666 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACTN1P12814 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACTN1P12814 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACTN1P12814 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ACTN1P12814 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACTN1P12814 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACTN1P12814 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACTN1P12814 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACTN1P12814 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACTN1P12814 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACTN1P12814 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ACTN1P12814 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACTN1P12814 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACTN1P12814 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACTN1P12814 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACTN1P12814 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACTN1P12814 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACTN1P12814 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACTN1P12814 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACTN1P12814 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACTN1P12814 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACTN1P12814 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACTN1P12814 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACTN1P12814 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACTN1P12814 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACTN1P12814 SNHG1-213ENST00000540725 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACTN1P12814 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACTN1P12814 S100A2-203ENST00000368709 457 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACTN1P12814 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACTN1P12814 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACTN1P12814 AC093627.5-203ENST00000497320 746 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACTN1P12814 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACTN1P12814 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACTN1P12814 AC011825.3-201ENST00000583184 565 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACTN1P12814 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACTN1P12814 AC006064.4-201ENST00000602946 422 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACTN1P12814 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACTN1P12814 AF254983.2-201ENST00000612331 135 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ACTN1P12814 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ACTN1P12814 AC006453.1-201ENST00000636037 1257 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ACTN1P12814 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACTN1P12814 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACTN1P12814 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACTN1P12814 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACTN1P12814 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACTN1P12814 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACTN1P12814 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACTN1P12814 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACTN1P12814 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACTN1P12814 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ACTN1P12814 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACTN1P12814 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACTN1P12814 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ACTN1P12814 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACTN1P12814 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACTN1P12814 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACTN1P12814 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACTN1P12814 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACTN1P12814 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACTN1P12814 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACTN1P12814 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACTN1P12814 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACTN1P12814 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACTN1P12814 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACTN1P12814 CELA3B-201ENST00000337107 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACTN1P12814 CMTM5-203ENST00000359320 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACTN1P12814 SSR4-203ENST00000370086 643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACTN1P12814 APRT-201ENST00000378364 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACTN1P12814 Z82214.1-201ENST00000419643 988 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACTN1P12814 MYO16-AS1-201ENST00000439299 580 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACTN1P12814 AC098935.1-201ENST00000446057 611 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ACTN1P12814 RTN3P1-201ENST00000536295 711 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ACTN1P12814 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACTN1P12814 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACTN1P12814 CDIP1-202ENST00000562334 1205 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACTN1P12814 ANKRD11-208ENST00000563291 593 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACTN1P12814 AC020763.1-201ENST00000567186 551 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACTN1P12814 HDDC2-204ENST00000608295 879 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACTN1P12814 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ACTN1P12814 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACTN1P12814 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACTN1P12814 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACTN1P12814 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACTN1P12814 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACTN1P12814 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACTN1P12814 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACTN1P12814 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACTN1P12814 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACTN1P12814 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACTN1P12814 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACTN1P12814 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACTN1P12814 NELFE-201ENST00000375425 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACTN1P12814 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACTN1P12814 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ACTN1P12814 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms