Protein–RNA interactions for Protein: P0C7W6

CCDC172, Coiled-coil domain-containing protein 172, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC172P0C7W6 MEST-204ENST00000393187 2380 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC172P0C7W6 GAL3ST4-202ENST00000411994 1404 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC172P0C7W6 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC172P0C7W6 ANO7-202ENST00000402430 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC172P0C7W6 CAP2-209ENST00000616440 2776 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC172P0C7W6 PXDN-201ENST00000252804 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC172P0C7W6 NEDD4L-238ENST00000635997 4402 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC172P0C7W6 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC172P0C7W6 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC172P0C7W6 TNS2-202ENST00000314276 4944 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC172P0C7W6 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC172P0C7W6 LINC01138-206ENST00000622328 2212 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC172P0C7W6 TMEM87B-201ENST00000283206 5212 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC172P0C7W6 PDE8A-201ENST00000310298 3984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC172P0C7W6 CSPG4-201ENST00000308508 8290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC172P0C7W6 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC172P0C7W6 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC172P0C7W6 SLC25A29-208ENST00000554912 5169 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC172P0C7W6 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC172P0C7W6 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC172P0C7W6 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC172P0C7W6 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC172P0C7W6 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC172P0C7W6 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC172P0C7W6 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC172P0C7W6 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC172P0C7W6 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC172P0C7W6 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC172P0C7W6 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC172P0C7W6 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC172P0C7W6 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC172P0C7W6 ELK4-202ENST00000357992 10239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC172P0C7W6 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC172P0C7W6 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC172P0C7W6 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC172P0C7W6 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC172P0C7W6 PTPRN-201ENST00000295718 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC172P0C7W6 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC172P0C7W6 IMPDH1-204ENST00000419067 2431 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC172P0C7W6 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC172P0C7W6 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC172P0C7W6 CEMIP-201ENST00000220244 7226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC172P0C7W6 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC172P0C7W6 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC172P0C7W6 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC172P0C7W6 ZNF718-202ENST00000609714 2772 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC172P0C7W6 DDX20-201ENST00000369702 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC172P0C7W6 THBD-201ENST00000377103 4109 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC172P0C7W6 SHPK-201ENST00000225519 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC172P0C7W6 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC172P0C7W6 ZNF747-202ENST00000395094 3504 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC172P0C7W6 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC172P0C7W6 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC172P0C7W6 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC172P0C7W6 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC172P0C7W6 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC172P0C7W6 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC172P0C7W6 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC172P0C7W6 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC172P0C7W6 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC172P0C7W6 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC172P0C7W6 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC172P0C7W6 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC172P0C7W6 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC172P0C7W6 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC172P0C7W6 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC172P0C7W6 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC172P0C7W6 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC172P0C7W6 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC172P0C7W6 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC172P0C7W6 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC172P0C7W6 GABRB3-219ENST00000636466 4509 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC172P0C7W6 PSMC1-201ENST00000261303 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC172P0C7W6 ASAH1-258ENST00000637790 3042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC172P0C7W6 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC172P0C7W6 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC172P0C7W6 TCAM1P-207ENST00000485295 1537 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC172P0C7W6 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC172P0C7W6 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC172P0C7W6 MOB3C-203ENST00000371940 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC172P0C7W6 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC172P0C7W6 NFIC-206ENST00000589123 8068 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC172P0C7W6 RUBCNL-201ENST00000378781 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC172P0C7W6 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC172P0C7W6 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC172P0C7W6 TRPV6-201ENST00000359396 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC172P0C7W6 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC172P0C7W6 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC172P0C7W6 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC172P0C7W6 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC172P0C7W6 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC172P0C7W6 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC172P0C7W6 INF2-209ENST00000617571 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC172P0C7W6 PPIP5K1-209ENST00000420765 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC172P0C7W6 OTP-201ENST00000306422 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC172P0C7W6 SF1-201ENST00000227503 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC172P0C7W6 COL22A1-201ENST00000303045 6346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC172P0C7W6 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC172P0C7W6 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC172P0C7W6 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms