Protein–RNA interactions for Protein: P08575

PTPRC, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C, humanhuman

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Length 1,304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCP08575 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPRCP08575 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPRCP08575 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPRCP08575 AP000320.1-201ENST00000440403 471 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPRCP08575 AC135178.1-201ENST00000458568 537 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPRCP08575 SEC23A-204ENST00000548032 907 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPRCP08575 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPRCP08575 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPRCP08575 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPRCP08575 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPRCP08575 PLA1A-204ENST00000488919 1456 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPRCP08575 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPRCP08575 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPRCP08575 BIN3-205ENST00000519513 1431 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPRCP08575 ZNF174-201ENST00000268655 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPRCP08575 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPRCP08575 C3orf33-205ENST00000534941 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPRCP08575 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPRCP08575 OR3A2-205ENST00000641164 2033 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPRCP08575 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPRCP08575 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPRCP08575 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPRCP08575 PLEKHB2-206ENST00000409612 2210 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPRCP08575 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPRCP08575 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PTPRCP08575 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTPRCP08575 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTPRCP08575 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTPRCP08575 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTPRCP08575 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTPRCP08575 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTPRCP08575 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTPRCP08575 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTPRCP08575 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTPRCP08575 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTPRCP08575 KRT8P21-201ENST00000430398 1491 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
PTPRCP08575 GNRH2-204ENST00000380347 758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTPRCP08575 IGHV3-13-201ENST00000390602 430 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTPRCP08575 OGFR-AS1-201ENST00000431361 668 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTPRCP08575 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTPRCP08575 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTPRCP08575 HOXB-AS3-206ENST00000474040 741 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTPRCP08575 SDHD-202ENST00000525291 790 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTPRCP08575 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTPRCP08575 MIR3188-201ENST00000583494 85 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
PTPRCP08575 AC008133.1-201ENST00000584688 557 ntTSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTPRCP08575 PYY-202ENST00000592796 580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTPRCP08575 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
PTPRCP08575 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTPRCP08575 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTPRCP08575 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTPRCP08575 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTPRCP08575 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTPRCP08575 LGALS12-202ENST00000340246 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTPRCP08575 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTPRCP08575 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTPRCP08575 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTPRCP08575 CDK3-201ENST00000425876 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTPRCP08575 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTPRCP08575 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTPRCP08575 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTPRCP08575 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTPRCP08575 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PTPRCP08575 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PTPRCP08575 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
PTPRCP08575 CCT8L1P-201ENST00000465400 1674 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
PTPRCP08575 ACTG1P17-202ENST00000560958 1662 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
PTPRCP08575 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
PTPRCP08575 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PTPRCP08575 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PTPRCP08575 ODF2L-204ENST00000370566 2155 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
PTPRCP08575 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PTPRCP08575 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PTPRCP08575 SNRPN-203ENST00000400097 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PTPRCP08575 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
PTPRCP08575 USP17L6P-201ENST00000382470 1197 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
PTPRCP08575 CRYBA2-202ENST00000392096 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PTPRCP08575 LINC00441-201ENST00000433480 1143 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PTPRCP08575 FKBP11-202ENST00000444214 630 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
PTPRCP08575 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.53
PTPRCP08575 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
PTPRCP08575 SNHG14-213ENST00000551077 638 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
PTPRCP08575 AL135838.1-202ENST00000556411 441 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
PTPRCP08575 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.53
PTPRCP08575 AC023824.4-202ENST00000569557 849 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.53
PTPRCP08575 ADGRE3-204ENST00000595472 486 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.53
PTPRCP08575 CD59-201ENST00000351554 1775 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PTPRCP08575 AC021683.1-201ENST00000585798 1767 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PTPRCP08575 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PTPRCP08575 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PTPRCP08575 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PTPRCP08575 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PTPRCP08575 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PTPRCP08575 C16orf45-202ENST00000452191 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PTPRCP08575 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PTPRCP08575 NIT1-203ENST00000368009 1362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PTPRCP08575 AGER-201ENST00000375055 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PTPRCP08575 SHCBP1-201ENST00000303383 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PTPRCP08575 ATL2-210ENST00000452935 2199 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PTPRCP08575 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
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