Protein–RNA interactions for Protein: P04004

VTN, Vitronectin, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VTNP04004 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VTNP04004 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VTNP04004 LRP10-203ENST00000546834 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
VTNP04004 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VTNP04004 BTBD8-201ENST00000342818 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VTNP04004 CPA5-201ENST00000393213 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VTNP04004 LINC00905-203ENST00000588838 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VTNP04004 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VTNP04004 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VTNP04004 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VTNP04004 SERPINF1-201ENST00000254722 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VTNP04004 BSDC1-205ENST00000446293 1505 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
VTNP04004 MTMR9-202ENST00000526292 1960 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
VTNP04004 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VTNP04004 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
VTNP04004 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VTNP04004 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VTNP04004 PRIMA1-201ENST00000316227 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VTNP04004 NUDT1-201ENST00000339737 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VTNP04004 NUDT1-202ENST00000343985 771 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VTNP04004 LYPLA2-202ENST00000374502 1072 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
VTNP04004 RPL3-202ENST00000401609 1289 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VTNP04004 SAPCD1-208ENST00000415669 916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VTNP04004 LAMA4-208ENST00000431543 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VTNP04004 GDAP1-202ENST00000434412 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VTNP04004 RHEB-207ENST00000496004 744 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
VTNP04004 MIR4722-201ENST00000578292 60 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
VTNP04004 CNOT7-213ENST00000628418 432 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
VTNP04004 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VTNP04004 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
VTNP04004 AWAT1-201ENST00000374521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VTNP04004 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VTNP04004 TUBA3C-202ENST00000618094 1386 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VTNP04004 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VTNP04004 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VTNP04004 NIPAL3-202ENST00000339255 1676 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
VTNP04004 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VTNP04004 CD1E-206ENST00000368161 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VTNP04004 AMHR2-201ENST00000257863 1863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VTNP04004 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VTNP04004 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VTNP04004 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
VTNP04004 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VTNP04004 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VTNP04004 ZNF174-201ENST00000268655 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VTNP04004 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VTNP04004 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VTNP04004 LINC00339-208ENST00000634934 1518 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
VTNP04004 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
VTNP04004 CNN1-201ENST00000252456 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VTNP04004 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VTNP04004 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
VTNP04004 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VTNP04004 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VTNP04004 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VTNP04004 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VTNP04004 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
VTNP04004 PDE6G-201ENST00000331056 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VTNP04004 AL583805.1-201ENST00000391389 531 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
VTNP04004 HDDC2-202ENST00000398153 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VTNP04004 BANF1P3-201ENST00000412556 261 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
VTNP04004 OGFR-AS1-201ENST00000431361 668 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
VTNP04004 DUX4L50-201ENST00000455245 715 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
VTNP04004 RN7SL277P-201ENST00000481521 288 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
VTNP04004 LY6E-208ENST00000520531 490 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
VTNP04004 TMEM218-205ENST00000527271 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
VTNP04004 TSHR-205ENST00000554263 1184 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VTNP04004 TSHR-206ENST00000554435 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VTNP04004 AC005726.2-204ENST00000577790 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
VTNP04004 AC079336.4-201ENST00000584219 408 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
VTNP04004 SPCS2P2-201ENST00000603270 608 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
VTNP04004 ATRAID-207ENST00000606999 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VTNP04004 AC103691.2-201ENST00000618824 433 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
VTNP04004 CCNH-201ENST00000256897 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VTNP04004 OSER1-201ENST00000255174 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VTNP04004 ACTG1P17-202ENST00000560958 1662 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
VTNP04004 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VTNP04004 PPT1-205ENST00000449045 1957 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
VTNP04004 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VTNP04004 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VTNP04004 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VTNP04004 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VTNP04004 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
VTNP04004 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
VTNP04004 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VTNP04004 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VTNP04004 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VTNP04004 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VTNP04004 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VTNP04004 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
VTNP04004 TOMM22-201ENST00000216034 2040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VTNP04004 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
VTNP04004 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VTNP04004 TMEM144-209ENST00000509278 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VTNP04004 HMBS-216ENST00000543090 1347 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
VTNP04004 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
VTNP04004 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VTNP04004 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
VTNP04004 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VTNP04004 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.1 ms