Protein–RNA interactions for Protein: O60931

CTNS, Cystinosin, humanhuman

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Length 367 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNSO60931 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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CTNSO60931 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CTNSO60931 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CTNSO60931 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CTNSO60931 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CTNSO60931 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
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CTNSO60931 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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CTNSO60931 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CTNSO60931 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CTNSO60931 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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CTNSO60931 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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CTNSO60931 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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CTNSO60931 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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CTNSO60931 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
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CTNSO60931 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
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CTNSO60931 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CTNSO60931 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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CTNSO60931 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CTNSO60931 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CTNSO60931 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CTNSO60931 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CTNSO60931 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CTNSO60931 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CTNSO60931 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CTNSO60931 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CTNSO60931 APBB1-220ENST00000609331 1574 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CTNSO60931 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CTNSO60931 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CTNSO60931 GRM7-215ENST00000486284 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CTNSO60931 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
CTNSO60931 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CTNSO60931 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
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