Protein–RNA interactions for Protein: O43300

LRRTM2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, humanhuman

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Length 516 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM2O43300 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
LRRTM2O43300 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
LRRTM2O43300 FBXO3-203ENST00000526785 5798 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
LRRTM2O43300 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
LRRTM2O43300 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
LRRTM2O43300 SYNRG-231ENST00000622045 3859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
LRRTM2O43300 ADAM12-201ENST00000368676 3313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
LRRTM2O43300 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
LRRTM2O43300 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
LRRTM2O43300 LAT2-205ENST00000460943 2527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
LRRTM2O43300 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
LRRTM2O43300 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
LRRTM2O43300 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
LRRTM2O43300 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
LRRTM2O43300 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
LRRTM2O43300 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
LRRTM2O43300 SUOX-201ENST00000266971 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
LRRTM2O43300 PDE4A-209ENST00000592685 2707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
LRRTM2O43300 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
LRRTM2O43300 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
LRRTM2O43300 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
LRRTM2O43300 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
LRRTM2O43300 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
LRRTM2O43300 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
LRRTM2O43300 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
LRRTM2O43300 AL121992.1-201ENST00000428945 2845 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
LRRTM2O43300 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
LRRTM2O43300 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
LRRTM2O43300 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC13.81□□□□□ -0.2
LRRTM2O43300 FXNP2-201ENST00000411625 547 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
LRRTM2O43300 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
LRRTM2O43300 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
LRRTM2O43300 TNNT1-203ENST00000536926 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
LRRTM2O43300 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
LRRTM2O43300 SPAG5-AS1-203ENST00000554154 491 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
LRRTM2O43300 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
LRRTM2O43300 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
LRRTM2O43300 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
LRRTM2O43300 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
LRRTM2O43300 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
LRRTM2O43300 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
LRRTM2O43300 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
LRRTM2O43300 ZNF559-202ENST00000393883 5095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
LRRTM2O43300 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
LRRTM2O43300 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC13.81□□□□□ -0.2
LRRTM2O43300 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
LRRTM2O43300 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
LRRTM2O43300 PITRM1-206ENST00000451104 3183 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
LRRTM2O43300 AL669831.1-201ENST00000506640 6432 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
LRRTM2O43300 CHRNA3-201ENST00000326828 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
LRRTM2O43300 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
LRRTM2O43300 ZNF576-201ENST00000336564 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
LRRTM2O43300 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
LRRTM2O43300 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
LRRTM2O43300 MRVI1-204ENST00000527509 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
LRRTM2O43300 MEX3B-201ENST00000329713 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
LRRTM2O43300 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
LRRTM2O43300 MLXIPL-204ENST00000414749 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
LRRTM2O43300 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
LRRTM2O43300 IFNAR2-202ENST00000342136 2899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
LRRTM2O43300 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
LRRTM2O43300 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
LRRTM2O43300 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
LRRTM2O43300 RBM6-201ENST00000266022 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
LRRTM2O43300 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
LRRTM2O43300 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
LRRTM2O43300 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
LRRTM2O43300 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
LRRTM2O43300 PPIE-203ENST00000372830 1198 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
LRRTM2O43300 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
LRRTM2O43300 AC083949.1-201ENST00000422013 657 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
LRRTM2O43300 AC129492.3-201ENST00000498285 460 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.8□□□□□ -0.2
LRRTM2O43300 AC100858.3-202ENST00000533496 553 ntTSL 4 BASIC13.8□□□□□ -0.2
LRRTM2O43300 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
LRRTM2O43300 NDUFV2P1-201ENST00000596415 907 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
LRRTM2O43300 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
LRRTM2O43300 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC13.8□□□□□ -0.2
LRRTM2O43300 GFRA1-201ENST00000355422 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
LRRTM2O43300 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
LRRTM2O43300 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
LRRTM2O43300 ARHGAP36-201ENST00000276211 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
LRRTM2O43300 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
LRRTM2O43300 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
LRRTM2O43300 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
LRRTM2O43300 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
LRRTM2O43300 ACTR2-205ENST00000542850 1429 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
LRRTM2O43300 PAWR-201ENST00000328827 9129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
LRRTM2O43300 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
LRRTM2O43300 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
LRRTM2O43300 KLHL13-207ENST00000540167 3396 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
LRRTM2O43300 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
LRRTM2O43300 ELP1-201ENST00000374647 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
LRRTM2O43300 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
LRRTM2O43300 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
LRRTM2O43300 TBC1D8B-203ENST00000357242 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
LRRTM2O43300 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
LRRTM2O43300 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
LRRTM2O43300 MYADM-203ENST00000391769 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
LRRTM2O43300 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
LRRTM2O43300 ANK1-202ENST00000289734 8297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
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