Protein–RNA interactions for Protein: A4FU69

EFCAB5, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,503 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFCAB5A4FU69 FAM90A14P-201ENST00000530386 1395 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
EFCAB5A4FU69 FAM90A13P-201ENST00000534703 1395 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
EFCAB5A4FU69 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
EFCAB5A4FU69 LCE2C-201ENST00000368783 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EFCAB5A4FU69 AL158166.1-201ENST00000433110 371 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EFCAB5A4FU69 MIATNB-206ENST00000444388 918 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EFCAB5A4FU69 F11R-204ENST00000537746 1245 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EFCAB5A4FU69 ZNF268-210ENST00000541211 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EFCAB5A4FU69 KRT16P3-202ENST00000580113 1012 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EFCAB5A4FU69 KRT16P1-203ENST00000581027 1012 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EFCAB5A4FU69 AC148477.9-201ENST00000623974 539 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
EFCAB5A4FU69 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EFCAB5A4FU69 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EFCAB5A4FU69 CACNA1A-211ENST00000592864 1623 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EFCAB5A4FU69 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EFCAB5A4FU69 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EFCAB5A4FU69 WDR46-231ENST00000374617 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EFCAB5A4FU69 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EFCAB5A4FU69 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EFCAB5A4FU69 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EFCAB5A4FU69 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EFCAB5A4FU69 HTR3E-205ENST00000436361 1371 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EFCAB5A4FU69 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EFCAB5A4FU69 AL590824.1-201ENST00000403828 1349 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
EFCAB5A4FU69 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EFCAB5A4FU69 SVOPL-203ENST00000421622 1653 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EFCAB5A4FU69 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EFCAB5A4FU69 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EFCAB5A4FU69 HBB-201ENST00000335295 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EFCAB5A4FU69 GEMIN8P4-201ENST00000380526 729 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
EFCAB5A4FU69 IGKV1D-43-201ENST00000468879 532 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EFCAB5A4FU69 RN7SL375P-201ENST00000492442 298 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
EFCAB5A4FU69 NDRG1-209ENST00000518176 888 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EFCAB5A4FU69 ARL17B-203ENST00000570618 1140 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EFCAB5A4FU69 THY1-209ENST00000580275 578 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EFCAB5A4FU69 AC055811.3-201ENST00000584952 686 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
EFCAB5A4FU69 AP005131.2-201ENST00000589045 487 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EFCAB5A4FU69 HKR1-225ENST00000592168 566 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EFCAB5A4FU69 MIA-206ENST00000597784 455 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EFCAB5A4FU69 AL135936.1-201ENST00000617956 998 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EFCAB5A4FU69 ZFP1-201ENST00000332307 1502 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EFCAB5A4FU69 HMGA1-203ENST00000374116 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EFCAB5A4FU69 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EFCAB5A4FU69 HPSE2-206ENST00000628193 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EFCAB5A4FU69 PRC1-204ENST00000442656 2060 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EFCAB5A4FU69 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EFCAB5A4FU69 TEX44-201ENST00000313965 1383 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EFCAB5A4FU69 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EFCAB5A4FU69 CPA5-206ENST00000474905 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EFCAB5A4FU69 ARL1-202ENST00000536227 1322 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EFCAB5A4FU69 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EFCAB5A4FU69 HMGCLL1-203ENST00000370850 1171 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EFCAB5A4FU69 ANG-202ENST00000397990 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EFCAB5A4FU69 KCNE1-203ENST00000399286 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EFCAB5A4FU69 KRTAP10-5-201ENST00000400372 1150 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EFCAB5A4FU69 AL513211.1-201ENST00000429053 483 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EFCAB5A4FU69 MOCS1-207ENST00000432280 1071 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EFCAB5A4FU69 IFI35-204ENST00000438323 1232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EFCAB5A4FU69 AL356218.1-201ENST00000450864 353 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EFCAB5A4FU69 FAM3D-AS1-201ENST00000464125 821 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EFCAB5A4FU69 CD81-209ENST00000492627 886 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EFCAB5A4FU69 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EFCAB5A4FU69 AL136982.5-201ENST00000605222 294 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
EFCAB5A4FU69 APOBEC3H-207ENST00000613996 465 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EFCAB5A4FU69 AC073578.2-201ENST00000618927 464 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EFCAB5A4FU69 Metazoa_SRP.157-201ENST00000622819 262 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
EFCAB5A4FU69 PAF1-204ENST00000595564 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EFCAB5A4FU69 EFHD1-207ENST00000611312 1490 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EFCAB5A4FU69 ZNF100-201ENST00000305570 2283 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EFCAB5A4FU69 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EFCAB5A4FU69 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EFCAB5A4FU69 NIPA1-207ENST00000561183 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EFCAB5A4FU69 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EFCAB5A4FU69 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EFCAB5A4FU69 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EFCAB5A4FU69 SPRY1-208ENST00000622283 2352 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EFCAB5A4FU69 UGP2-207ENST00000467648 2057 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EFCAB5A4FU69 TPM2-204ENST00000378300 1771 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EFCAB5A4FU69 PLA2G12B-201ENST00000373032 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EFCAB5A4FU69 AP001628.2-201ENST00000420273 784 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EFCAB5A4FU69 AL365436.2-201ENST00000434112 526 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EFCAB5A4FU69 ALKBH2-203ENST00000440112 574 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EFCAB5A4FU69 AC068057.1-201ENST00000453322 709 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EFCAB5A4FU69 AC026470.1-201ENST00000478038 846 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
EFCAB5A4FU69 AL162632.1-201ENST00000546784 548 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EFCAB5A4FU69 CLEC20A-202ENST00000623247 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EFCAB5A4FU69 MARK2-206ENST00000425897 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EFCAB5A4FU69 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EFCAB5A4FU69 PGD-201ENST00000270776 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EFCAB5A4FU69 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EFCAB5A4FU69 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EFCAB5A4FU69 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EFCAB5A4FU69 PPARG-205ENST00000397010 2017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EFCAB5A4FU69 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EFCAB5A4FU69 DDC-AS1-201ENST00000454521 1776 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
EFCAB5A4FU69 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EFCAB5A4FU69 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
EFCAB5A4FU69 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
EFCAB5A4FU69 PES1P2-201ENST00000449745 1735 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
EFCAB5A4FU69 ZNF436-AS1-201ENST00000335648 2547 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms