Protein–RNA interactions for Protein: Q9UP83

COG5, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 5, humanhuman

Predictions only

Length 839 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG5Q9UP83 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
COG5Q9UP83 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
COG5Q9UP83 AC148477.9-201ENST00000623974 539 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
COG5Q9UP83 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
COG5Q9UP83 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
COG5Q9UP83 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
COG5Q9UP83 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
COG5Q9UP83 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
COG5Q9UP83 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
COG5Q9UP83 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
COG5Q9UP83 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
COG5Q9UP83 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
COG5Q9UP83 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
COG5Q9UP83 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
COG5Q9UP83 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
COG5Q9UP83 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
COG5Q9UP83 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
COG5Q9UP83 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
COG5Q9UP83 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
COG5Q9UP83 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
COG5Q9UP83 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
COG5Q9UP83 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
COG5Q9UP83 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
COG5Q9UP83 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
COG5Q9UP83 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
COG5Q9UP83 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
COG5Q9UP83 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
COG5Q9UP83 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
COG5Q9UP83 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
COG5Q9UP83 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
COG5Q9UP83 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
COG5Q9UP83 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
COG5Q9UP83 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
COG5Q9UP83 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
COG5Q9UP83 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
COG5Q9UP83 TOMM7-201ENST00000358435 778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
COG5Q9UP83 SSR4-203ENST00000370086 643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
COG5Q9UP83 TRO-205ENST00000399736 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
COG5Q9UP83 ISCA2P1-201ENST00000425548 448 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
COG5Q9UP83 CLNS1A-211ENST00000532069 898 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
COG5Q9UP83 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
COG5Q9UP83 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
COG5Q9UP83 NAP1L6-202ENST00000641404 1222 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
COG5Q9UP83 PPIL3-201ENST00000286175 1370 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
COG5Q9UP83 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
COG5Q9UP83 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
COG5Q9UP83 SLCO6A1-207ENST00000513675 1611 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
COG5Q9UP83 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
COG5Q9UP83 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
COG5Q9UP83 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
COG5Q9UP83 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
COG5Q9UP83 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
COG5Q9UP83 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
COG5Q9UP83 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
COG5Q9UP83 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
COG5Q9UP83 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
COG5Q9UP83 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
COG5Q9UP83 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
COG5Q9UP83 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
COG5Q9UP83 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
COG5Q9UP83 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
COG5Q9UP83 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
COG5Q9UP83 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
COG5Q9UP83 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
COG5Q9UP83 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
COG5Q9UP83 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
COG5Q9UP83 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
COG5Q9UP83 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
COG5Q9UP83 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
COG5Q9UP83 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
COG5Q9UP83 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
COG5Q9UP83 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
COG5Q9UP83 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
COG5Q9UP83 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
COG5Q9UP83 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
COG5Q9UP83 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
COG5Q9UP83 NTF3-202ENST00000423158 1336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
COG5Q9UP83 RN7SKP214-201ENST00000364208 315 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
COG5Q9UP83 CXCL12-202ENST00000374426 470 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
COG5Q9UP83 IGHV3-13-201ENST00000390602 430 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
COG5Q9UP83 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
COG5Q9UP83 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
COG5Q9UP83 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
COG5Q9UP83 ORAOV1-209ENST00000538554 1000 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
COG5Q9UP83 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
COG5Q9UP83 ELOF1-202ENST00000586120 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
COG5Q9UP83 IRF3-215ENST00000596822 823 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
COG5Q9UP83 RNF146-211ENST00000609447 607 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
COG5Q9UP83 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
COG5Q9UP83 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
COG5Q9UP83 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
COG5Q9UP83 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
COG5Q9UP83 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
COG5Q9UP83 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
COG5Q9UP83 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
COG5Q9UP83 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
COG5Q9UP83 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
COG5Q9UP83 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
COG5Q9UP83 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
COG5Q9UP83 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.1 ms