Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNY4

TTF2, Transcription termination factor 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,162 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTF2Q9UNY4 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TTF2Q9UNY4 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TTF2Q9UNY4 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TTF2Q9UNY4 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TTF2Q9UNY4 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TTF2Q9UNY4 RHD-203ENST00000357542 1387 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TTF2Q9UNY4 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TTF2Q9UNY4 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TTF2Q9UNY4 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TTF2Q9UNY4 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TTF2Q9UNY4 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TTF2Q9UNY4 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TTF2Q9UNY4 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TTF2Q9UNY4 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TTF2Q9UNY4 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TTF2Q9UNY4 TOMM22-201ENST00000216034 2040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TTF2Q9UNY4 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TTF2Q9UNY4 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TTF2Q9UNY4 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TTF2Q9UNY4 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TTF2Q9UNY4 MUC1-203ENST00000342482 537 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TTF2Q9UNY4 GNRH2-204ENST00000380347 758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TTF2Q9UNY4 RPS9-204ENST00000391753 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TTF2Q9UNY4 PIK3IP1-202ENST00000402249 999 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TTF2Q9UNY4 ZNF226-203ENST00000413984 716 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TTF2Q9UNY4 LINC01237-201ENST00000415434 573 ntTSL 4 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TTF2Q9UNY4 AL807761.2-201ENST00000422849 729 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
TTF2Q9UNY4 AL109767.1-201ENST00000429450 564 ntTSL 4 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TTF2Q9UNY4 NDUFS6P1-201ENST00000485187 316 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
TTF2Q9UNY4 AC092535.3-201ENST00000504969 468 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TTF2Q9UNY4 NDUFC1-209ENST00000539002 1198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TTF2Q9UNY4 NDUFC1-211ENST00000544855 1257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TTF2Q9UNY4 AL031713.1-201ENST00000564813 661 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
TTF2Q9UNY4 MIR4522-201ENST00000584932 87 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
TTF2Q9UNY4 PARD6G-AS1-205ENST00000589574 647 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TTF2Q9UNY4 AC007881.3-201ENST00000608897 607 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
TTF2Q9UNY4 LINC00116-203ENST00000611969 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TTF2Q9UNY4 ZNF596-213ENST00000640035 1163 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TTF2Q9UNY4 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TTF2Q9UNY4 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TTF2Q9UNY4 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TTF2Q9UNY4 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TTF2Q9UNY4 LINC01229-201ENST00000561510 1494 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TTF2Q9UNY4 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TTF2Q9UNY4 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TTF2Q9UNY4 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TTF2Q9UNY4 TMEM144-209ENST00000509278 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TTF2Q9UNY4 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TTF2Q9UNY4 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TTF2Q9UNY4 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TTF2Q9UNY4 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TTF2Q9UNY4 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TTF2Q9UNY4 G6PD-201ENST00000369620 1799 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TTF2Q9UNY4 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TTF2Q9UNY4 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TTF2Q9UNY4 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TTF2Q9UNY4 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TTF2Q9UNY4 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TTF2Q9UNY4 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TTF2Q9UNY4 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TTF2Q9UNY4 DDX39A-201ENST00000242776 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TTF2Q9UNY4 GAD1-201ENST00000344257 1029 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TTF2Q9UNY4 S100A2-203ENST00000368709 457 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TTF2Q9UNY4 NAGK-204ENST00000443872 878 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TTF2Q9UNY4 DUX4L50-201ENST00000455245 715 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
TTF2Q9UNY4 RHEB-207ENST00000496004 744 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TTF2Q9UNY4 AC009264.1-206ENST00000592183 534 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TTF2Q9UNY4 AC007326.1-201ENST00000604539 458 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
TTF2Q9UNY4 AL022334.2-201ENST00000610000 484 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
TTF2Q9UNY4 HIST1H3C-201ENST00000612966 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TTF2Q9UNY4 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TTF2Q9UNY4 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TTF2Q9UNY4 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TTF2Q9UNY4 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TTF2Q9UNY4 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TTF2Q9UNY4 KRT8P31-201ENST00000504812 1408 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
TTF2Q9UNY4 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TTF2Q9UNY4 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TTF2Q9UNY4 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TTF2Q9UNY4 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TTF2Q9UNY4 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TTF2Q9UNY4 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TTF2Q9UNY4 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TTF2Q9UNY4 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TTF2Q9UNY4 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TTF2Q9UNY4 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TTF2Q9UNY4 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TTF2Q9UNY4 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TTF2Q9UNY4 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TTF2Q9UNY4 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TTF2Q9UNY4 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TTF2Q9UNY4 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TTF2Q9UNY4 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TTF2Q9UNY4 ODF2L-204ENST00000370566 2155 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TTF2Q9UNY4 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TTF2Q9UNY4 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TTF2Q9UNY4 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TTF2Q9UNY4 NOP14-AS1-201ENST00000503709 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TTF2Q9UNY4 SOD2-202ENST00000367054 815 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TTF2Q9UNY4 NACA-202ENST00000393891 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms