Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNG2

TNFSF18, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 18, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF18Q9UNG2 ARAP1-201ENST00000334211 4942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
TNFSF18Q9UNG2 PLA2G6-202ENST00000335539 3060 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
TNFSF18Q9UNG2 ZNF772-204ENST00000427512 5130 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
TNFSF18Q9UNG2 SGK3-208ENST00000521198 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
TNFSF18Q9UNG2 PRPF40B-209ENST00000548825 3307 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
TNFSF18Q9UNG2 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
TNFSF18Q9UNG2 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
TNFSF18Q9UNG2 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
TNFSF18Q9UNG2 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
TNFSF18Q9UNG2 AC003958.1-201ENST00000435883 421 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
TNFSF18Q9UNG2 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
TNFSF18Q9UNG2 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
TNFSF18Q9UNG2 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
TNFSF18Q9UNG2 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
TNFSF18Q9UNG2 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
TNFSF18Q9UNG2 PWWP2A-202ENST00000456329 3991 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
TNFSF18Q9UNG2 FARP2-201ENST00000264042 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
TNFSF18Q9UNG2 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
TNFSF18Q9UNG2 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
TNFSF18Q9UNG2 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
TNFSF18Q9UNG2 IL10-202ENST00000423557 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
TNFSF18Q9UNG2 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
TNFSF18Q9UNG2 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
TNFSF18Q9UNG2 VAMP2-201ENST00000316509 2153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
TNFSF18Q9UNG2 BCL2L1-202ENST00000376055 2383 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
TNFSF18Q9UNG2 MAD1L1-201ENST00000265854 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
TNFSF18Q9UNG2 CCDC144NL-201ENST00000327925 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
TNFSF18Q9UNG2 ADAM8-201ENST00000415217 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
TNFSF18Q9UNG2 TAX1BP1-207ENST00000433216 3174 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
TNFSF18Q9UNG2 TUBGCP5-208ENST00000620435 3342 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
TNFSF18Q9UNG2 ANKRD20A1-201ENST00000562196 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
TNFSF18Q9UNG2 NCDN-201ENST00000356090 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
TNFSF18Q9UNG2 DTX1-201ENST00000257600 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
TNFSF18Q9UNG2 UNK-205ENST00000589666 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
TNFSF18Q9UNG2 GOPC-202ENST00000368498 4450 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
TNFSF18Q9UNG2 AL008727.1-201ENST00000564460 4728 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
TNFSF18Q9UNG2 TCOF1-207ENST00000504761 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
TNFSF18Q9UNG2 IGFN1-201ENST00000295591 4439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
TNFSF18Q9UNG2 SMYD4-201ENST00000305513 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
TNFSF18Q9UNG2 ALDH3A2-201ENST00000176643 3928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
TNFSF18Q9UNG2 VHL-201ENST00000256474 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
TNFSF18Q9UNG2 TNRC18P1-201ENST00000502875 3650 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
TNFSF18Q9UNG2 SMTN-203ENST00000358743 3198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
TNFSF18Q9UNG2 PLPPR1-201ENST00000374874 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
TNFSF18Q9UNG2 LINC01301-202ENST00000506428 2444 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
TNFSF18Q9UNG2 PLXNB2-201ENST00000359337 6335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
TNFSF18Q9UNG2 SDR9C7-201ENST00000293502 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
TNFSF18Q9UNG2 PPP1R11-205ENST00000376772 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
TNFSF18Q9UNG2 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
TNFSF18Q9UNG2 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
TNFSF18Q9UNG2 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
TNFSF18Q9UNG2 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
TNFSF18Q9UNG2 LINC00339-208ENST00000634934 1518 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
TNFSF18Q9UNG2 ZIK1-204ENST00000597850 4181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
TNFSF18Q9UNG2 RIC1-203ENST00000414202 6774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
TNFSF18Q9UNG2 GLIS3-201ENST00000324333 6667 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
TNFSF18Q9UNG2 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
TNFSF18Q9UNG2 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
TNFSF18Q9UNG2 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
TNFSF18Q9UNG2 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
TNFSF18Q9UNG2 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
TNFSF18Q9UNG2 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
TNFSF18Q9UNG2 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
TNFSF18Q9UNG2 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
TNFSF18Q9UNG2 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
TNFSF18Q9UNG2 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
TNFSF18Q9UNG2 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
TNFSF18Q9UNG2 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC11.98□□□□□ -0.49
TNFSF18Q9UNG2 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
TNFSF18Q9UNG2 LAMTOR5-AS1-209ENST00000597455 805 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
TNFSF18Q9UNG2 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
TNFSF18Q9UNG2 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
TNFSF18Q9UNG2 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
TNFSF18Q9UNG2 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
TNFSF18Q9UNG2 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
TNFSF18Q9UNG2 MTMR3-204ENST00000401950 6018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
TNFSF18Q9UNG2 PAX2-202ENST00000361791 3193 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
TNFSF18Q9UNG2 ELN-211ENST00000414324 3139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
TNFSF18Q9UNG2 CCER1-201ENST00000358859 2962 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
TNFSF18Q9UNG2 AC005014.1-201ENST00000432006 2976 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
TNFSF18Q9UNG2 TMBIM6-217ENST00000549385 2771 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
TNFSF18Q9UNG2 ALKBH5-201ENST00000399138 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
TNFSF18Q9UNG2 COL22A1-201ENST00000303045 6346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
TNFSF18Q9UNG2 TMPRSS13-202ENST00000445164 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
TNFSF18Q9UNG2 APLP2-201ENST00000263574 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
TNFSF18Q9UNG2 NLRX1-201ENST00000292199 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
TNFSF18Q9UNG2 TBC1D3L-201ENST00000612727 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
TNFSF18Q9UNG2 PSKH1-201ENST00000291041 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
TNFSF18Q9UNG2 DDX21-202ENST00000620315 4829 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
TNFSF18Q9UNG2 NLRP2-204ENST00000391721 3420 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
TNFSF18Q9UNG2 FAM86C1-201ENST00000346333 2010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
TNFSF18Q9UNG2 LOXHD1-203ENST00000398686 1958 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
TNFSF18Q9UNG2 FAM230C-201ENST00000623511 1970 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
TNFSF18Q9UNG2 PTK2-202ENST00000395218 4415 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
TNFSF18Q9UNG2 USP3-204ENST00000540797 5474 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
TNFSF18Q9UNG2 GOLGA6L10-209ENST00000621197 4160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
TNFSF18Q9UNG2 KAT7-204ENST00000454930 1774 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
TNFSF18Q9UNG2 AP1M2-201ENST00000250244 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
TNFSF18Q9UNG2 WWTR1-203ENST00000465804 5030 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
TNFSF18Q9UNG2 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms