Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJX2

CDC23, Cell division cycle protein 23 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 597 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC23Q9UJX2 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDC23Q9UJX2 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDC23Q9UJX2 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDC23Q9UJX2 NUP210-201ENST00000254508 7193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDC23Q9UJX2 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDC23Q9UJX2 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDC23Q9UJX2 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDC23Q9UJX2 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDC23Q9UJX2 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDC23Q9UJX2 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDC23Q9UJX2 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDC23Q9UJX2 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CDC23Q9UJX2 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDC23Q9UJX2 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CDC23Q9UJX2 THRB-AS1-202ENST00000438096 702 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDC23Q9UJX2 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CDC23Q9UJX2 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDC23Q9UJX2 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CDC23Q9UJX2 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDC23Q9UJX2 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDC23Q9UJX2 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDC23Q9UJX2 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDC23Q9UJX2 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDC23Q9UJX2 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDC23Q9UJX2 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CDC23Q9UJX2 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CDC23Q9UJX2 G3BP2-202ENST00000359707 4883 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDC23Q9UJX2 HMGCL-203ENST00000374490 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDC23Q9UJX2 MICB-202ENST00000399150 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDC23Q9UJX2 SACM1L-201ENST00000389061 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDC23Q9UJX2 SLC4A7-211ENST00000445684 4061 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDC23Q9UJX2 DNM1P51-202ENST00000558801 8752 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDC23Q9UJX2 CCT6B-201ENST00000314144 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDC23Q9UJX2 PCDHGA11-201ENST00000398587 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDC23Q9UJX2 PCDHB5-201ENST00000231134 3408 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDC23Q9UJX2 METAP1D-201ENST00000315796 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDC23Q9UJX2 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CDC23Q9UJX2 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDC23Q9UJX2 TMEM189-202ENST00000371652 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDC23Q9UJX2 PLEKHB2-206ENST00000409612 2210 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDC23Q9UJX2 CHRNA7-201ENST00000306901 6181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDC23Q9UJX2 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDC23Q9UJX2 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDC23Q9UJX2 ENO2-201ENST00000229277 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDC23Q9UJX2 GULP1-207ENST00000409843 2643 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDC23Q9UJX2 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDC23Q9UJX2 AFDN-205ENST00000392108 6812 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CDC23Q9UJX2 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDC23Q9UJX2 TRIM69-206ENST00000559390 2486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDC23Q9UJX2 SMC5-201ENST00000361138 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDC23Q9UJX2 TMPRSS2-201ENST00000332149 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDC23Q9UJX2 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDC23Q9UJX2 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDC23Q9UJX2 AL118506.1-201ENST00000601296 3082 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CDC23Q9UJX2 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDC23Q9UJX2 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDC23Q9UJX2 COL6A1-201ENST00000361866 4238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDC23Q9UJX2 LINC00882-204ENST00000484698 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDC23Q9UJX2 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDC23Q9UJX2 RBFADN-204ENST00000568911 5187 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDC23Q9UJX2 FAM167A-201ENST00000284486 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDC23Q9UJX2 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDC23Q9UJX2 AC093668.2-201ENST00000481893 3569 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDC23Q9UJX2 AC105052.1-201ENST00000519541 3569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDC23Q9UJX2 POLM-201ENST00000242248 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDC23Q9UJX2 AC118758.2-201ENST00000614242 2813 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CDC23Q9UJX2 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDC23Q9UJX2 MORC4-202ENST00000355610 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDC23Q9UJX2 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDC23Q9UJX2 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDC23Q9UJX2 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDC23Q9UJX2 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDC23Q9UJX2 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDC23Q9UJX2 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDC23Q9UJX2 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CDC23Q9UJX2 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDC23Q9UJX2 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CDC23Q9UJX2 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDC23Q9UJX2 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDC23Q9UJX2 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDC23Q9UJX2 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDC23Q9UJX2 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDC23Q9UJX2 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDC23Q9UJX2 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDC23Q9UJX2 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDC23Q9UJX2 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDC23Q9UJX2 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CDC23Q9UJX2 TNRC18-203ENST00000399537 10572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDC23Q9UJX2 TNRC18-205ENST00000430969 10562 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDC23Q9UJX2 PSAP-202ENST00000394936 2872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDC23Q9UJX2 BEGAIN-212ENST00000637716 3259 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDC23Q9UJX2 CPNE5-201ENST00000244751 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDC23Q9UJX2 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDC23Q9UJX2 FRMD8-201ENST00000317568 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDC23Q9UJX2 LRSAM1-201ENST00000300417 3146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDC23Q9UJX2 ICOSLG-202ENST00000400377 2907 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDC23Q9UJX2 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDC23Q9UJX2 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDC23Q9UJX2 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDC23Q9UJX2 GSDMA-201ENST00000301659 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.2 ms