Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTG1

PKDREJ, Polycystic kidney disease and receptor for egg jelly-related protein, humanhuman

Predictions only

Length 2,253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKDREJQ9NTG1 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
PKDREJQ9NTG1 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PKDREJQ9NTG1 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PKDREJQ9NTG1 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PKDREJQ9NTG1 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
PKDREJQ9NTG1 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
PKDREJQ9NTG1 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
PKDREJQ9NTG1 SVOPL-201ENST00000288513 1413 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
PKDREJQ9NTG1 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PKDREJQ9NTG1 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
PKDREJQ9NTG1 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
PKDREJQ9NTG1 AC005726.3-202ENST00000577814 1316 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
PKDREJQ9NTG1 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PKDREJQ9NTG1 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PKDREJQ9NTG1 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PKDREJQ9NTG1 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PKDREJQ9NTG1 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PKDREJQ9NTG1 AJUBA-201ENST00000262713 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PKDREJQ9NTG1 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PKDREJQ9NTG1 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
PKDREJQ9NTG1 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
PKDREJQ9NTG1 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PKDREJQ9NTG1 RASSF3-202ENST00000336061 1030 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PKDREJQ9NTG1 LAMA4-208ENST00000431543 1080 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PKDREJQ9NTG1 AL096772.1-201ENST00000451135 781 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PKDREJQ9NTG1 TMBIM4-208ENST00000542724 770 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PKDREJQ9NTG1 HKR1-225ENST00000592168 566 ntTSL 4 BASIC12.78□□□□□ -0.36
PKDREJQ9NTG1 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PKDREJQ9NTG1 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PKDREJQ9NTG1 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PKDREJQ9NTG1 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PKDREJQ9NTG1 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
PKDREJQ9NTG1 PARP1-203ENST00000366794 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PKDREJQ9NTG1 FRMPD2B-201ENST00000431305 1347 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
PKDREJQ9NTG1 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
PKDREJQ9NTG1 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
PKDREJQ9NTG1 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.77□□□□□ -0.36
PKDREJQ9NTG1 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
PKDREJQ9NTG1 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
PKDREJQ9NTG1 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
PKDREJQ9NTG1 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.36
PKDREJQ9NTG1 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
PKDREJQ9NTG1 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
PKDREJQ9NTG1 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
PKDREJQ9NTG1 KRTAP1-3-201ENST00000344363 972 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.36
PKDREJQ9NTG1 CRYBB3-202ENST00000404334 601 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.36
PKDREJQ9NTG1 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.36
PKDREJQ9NTG1 DDX39AP1-201ENST00000445147 1181 ntBASIC12.77□□□□□ -0.36
PKDREJQ9NTG1 ZNF529-AS1-201ENST00000448373 1004 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.36
PKDREJQ9NTG1 AC010234.1-201ENST00000494599 870 ntBASIC12.77□□□□□ -0.36
PKDREJQ9NTG1 AC084781.1-201ENST00000613737 656 ntBASIC12.77□□□□□ -0.36
PKDREJQ9NTG1 AC004706.3-207ENST00000634823 977 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
PKDREJQ9NTG1 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
PKDREJQ9NTG1 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
PKDREJQ9NTG1 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
PKDREJQ9NTG1 RCAN2-203ENST00000371374 3327 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
PKDREJQ9NTG1 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.36
PKDREJQ9NTG1 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC12.77□□□□□ -0.36
PKDREJQ9NTG1 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
PKDREJQ9NTG1 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
PKDREJQ9NTG1 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
PKDREJQ9NTG1 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
PKDREJQ9NTG1 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
PKDREJQ9NTG1 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
PKDREJQ9NTG1 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
PKDREJQ9NTG1 CSF2RA-219ENST00000501036 1622 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
PKDREJQ9NTG1 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
PKDREJQ9NTG1 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
PKDREJQ9NTG1 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
PKDREJQ9NTG1 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
PKDREJQ9NTG1 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
PKDREJQ9NTG1 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
PKDREJQ9NTG1 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
PKDREJQ9NTG1 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
PKDREJQ9NTG1 LCE3B-201ENST00000335633 288 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
PKDREJQ9NTG1 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
PKDREJQ9NTG1 MAGOH-202ENST00000371470 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
PKDREJQ9NTG1 NCR3-202ENST00000376071 541 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
PKDREJQ9NTG1 EEF1B2-203ENST00000392222 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
PKDREJQ9NTG1 INS-IGF2-202ENST00000397270 828 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
PKDREJQ9NTG1 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
PKDREJQ9NTG1 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
PKDREJQ9NTG1 AC004837.1-201ENST00000446267 564 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
PKDREJQ9NTG1 AGPAT5P1-201ENST00000455855 1019 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
PKDREJQ9NTG1 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
PKDREJQ9NTG1 APOPT1-209ENST00000492189 513 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
PKDREJQ9NTG1 PRDM16-206ENST00000511072 4282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
PKDREJQ9NTG1 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
PKDREJQ9NTG1 AL356417.2-202ENST00000608986 532 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
PKDREJQ9NTG1 LINC01783-202ENST00000614408 828 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
PKDREJQ9NTG1 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
PKDREJQ9NTG1 BX284668.2-205ENST00000619677 828 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
PKDREJQ9NTG1 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
PKDREJQ9NTG1 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
PKDREJQ9NTG1 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
PKDREJQ9NTG1 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
PKDREJQ9NTG1 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
PKDREJQ9NTG1 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
PKDREJQ9NTG1 LINC00513-201ENST00000447430 1616 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
PKDREJQ9NTG1 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms