Protein–RNA interactions for Protein: Q9C037

TRIM4, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM4Q9C037 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRIM4Q9C037 GRIN1-207ENST00000371560 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRIM4Q9C037 MAN2B1-203ENST00000456935 3184 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRIM4Q9C037 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRIM4Q9C037 MAD2L1-201ENST00000296509 5468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRIM4Q9C037 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
TRIM4Q9C037 ROPN1-206ENST00000479867 2056 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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TRIM4Q9C037 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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TRIM4Q9C037 COL6A3-209ENST00000472056 8628 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TRIM4Q9C037 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TRIM4Q9C037 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TRIM4Q9C037 PPFIA4-204ENST00000447715 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TRIM4Q9C037 ESS2-201ENST00000252137 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TRIM4Q9C037 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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TRIM4Q9C037 CHD5-201ENST00000262450 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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TRIM4Q9C037 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TRIM4Q9C037 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TRIM4Q9C037 GPER1-203ENST00000397092 2971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TRIM4Q9C037 DNAJC13-201ENST00000260818 7730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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TRIM4Q9C037 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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TRIM4Q9C037 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TRIM4Q9C037 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC14.84□□□□□ -0.03
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TRIM4Q9C037 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
TRIM4Q9C037 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TRIM4Q9C037 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
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TRIM4Q9C037 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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TRIM4Q9C037 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC14.83□□□□□ -0.04
TRIM4Q9C037 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
TRIM4Q9C037 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
TRIM4Q9C037 SPDYE16-203ENST00000633306 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
TRIM4Q9C037 OCRL-202ENST00000371113 5162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TRIM4Q9C037 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TRIM4Q9C037 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TRIM4Q9C037 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TRIM4Q9C037 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TRIM4Q9C037 UBE2V2-205ENST00000521346 1322 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
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