Protein–RNA interactions for Protein: Q9C000

NLRP1, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP1Q9C000 SIAE-206ENST00000618733 1980 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NLRP1Q9C000 NCF4-202ENST00000397147 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NLRP1Q9C000 C18orf21-202ENST00000333234 958 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NLRP1Q9C000 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NLRP1Q9C000 EFNA4-203ENST00000427683 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NLRP1Q9C000 LINC00303-203ENST00000427799 1028 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NLRP1Q9C000 ZNF877P-201ENST00000437614 612 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
NLRP1Q9C000 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NLRP1Q9C000 HOXC-AS3-203ENST00000514702 368 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NLRP1Q9C000 AC113133.1-201ENST00000522388 1088 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NLRP1Q9C000 AC007298.2-201ENST00000551849 862 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NLRP1Q9C000 AC120498.7-201ENST00000562876 330 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
NLRP1Q9C000 AC010127.1-202ENST00000597623 713 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NLRP1Q9C000 AL645608.7-201ENST00000607769 351 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NLRP1Q9C000 AC126755.5-201ENST00000622756 267 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
NLRP1Q9C000 AC110057.1-201ENST00000636031 898 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
NLRP1Q9C000 GNG14-201ENST00000640117 210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NLRP1Q9C000 AC139713.2-207ENST00000641556 1292 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
NLRP1Q9C000 AMT-256ENST00000638063 1783 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NLRP1Q9C000 AC062028.1-201ENST00000536743 1422 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NLRP1Q9C000 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NLRP1Q9C000 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NLRP1Q9C000 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NLRP1Q9C000 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NLRP1Q9C000 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NLRP1Q9C000 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NLRP1Q9C000 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NLRP1Q9C000 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NLRP1Q9C000 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NLRP1Q9C000 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NLRP1Q9C000 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NLRP1Q9C000 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NLRP1Q9C000 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NLRP1Q9C000 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NLRP1Q9C000 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NLRP1Q9C000 SSR4-202ENST00000370085 526 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NLRP1Q9C000 TCEA3-201ENST00000374601 1197 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NLRP1Q9C000 KRTAP4-12-201ENST00000394014 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NLRP1Q9C000 CDK2-203ENST00000440311 1031 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NLRP1Q9C000 FAM138B-202ENST00000446648 1130 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NLRP1Q9C000 FAM138C-202ENST00000449442 1126 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NLRP1Q9C000 AC025594.1-201ENST00000469533 543 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
NLRP1Q9C000 AC092756.1-201ENST00000560248 448 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NLRP1Q9C000 AC074050.2-201ENST00000563338 538 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NLRP1Q9C000 TNFRSF12A-204ENST00000573001 648 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NLRP1Q9C000 FAM138F-201ENST00000631376 1183 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NLRP1Q9C000 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NLRP1Q9C000 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NLRP1Q9C000 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NLRP1Q9C000 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NLRP1Q9C000 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NLRP1Q9C000 OR3A2-205ENST00000641164 2033 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NLRP1Q9C000 LINC00115-201ENST00000473798 1317 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
NLRP1Q9C000 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NLRP1Q9C000 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NLRP1Q9C000 AC006450.3-201ENST00000453529 2146 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NLRP1Q9C000 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NLRP1Q9C000 SUCLA2-205ENST00000470760 1445 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NLRP1Q9C000 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NLRP1Q9C000 SKOR2-201ENST00000400404 891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NLRP1Q9C000 OR2W2P-201ENST00000406313 909 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
NLRP1Q9C000 AC136604.1-202ENST00000425471 771 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
NLRP1Q9C000 FAM3D-AS1-201ENST00000464125 821 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NLRP1Q9C000 AC100858.1-201ENST00000514059 1228 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
NLRP1Q9C000 MIR2278-201ENST00000516344 96 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
NLRP1Q9C000 LINC00301-203ENST00000527161 749 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NLRP1Q9C000 TPP1-209ENST00000528657 578 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NLRP1Q9C000 AC073569.2-201ENST00000551995 354 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NLRP1Q9C000 OVOL3-201ENST00000585332 695 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NLRP1Q9C000 AC016586.1-201ENST00000600056 684 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NLRP1Q9C000 AL591424.3-201ENST00000614278 872 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
NLRP1Q9C000 PSMA6-217ENST00000628955 364 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NLRP1Q9C000 OVOL3-202ENST00000633214 675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NLRP1Q9C000 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NLRP1Q9C000 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NLRP1Q9C000 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NLRP1Q9C000 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NLRP1Q9C000 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NLRP1Q9C000 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NLRP1Q9C000 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NLRP1Q9C000 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NLRP1Q9C000 DNAJB13-201ENST00000339764 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NLRP1Q9C000 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NLRP1Q9C000 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NLRP1Q9C000 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NLRP1Q9C000 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NLRP1Q9C000 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NLRP1Q9C000 NSMCE1-201ENST00000361439 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NLRP1Q9C000 IGHV1-3-201ENST00000390595 395 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NLRP1Q9C000 SMAD9-IT1-201ENST00000437983 504 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NLRP1Q9C000 AC010900.1-201ENST00000449849 1296 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
NLRP1Q9C000 NALT1-202ENST00000450304 437 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NLRP1Q9C000 HNRNPA1P56-201ENST00000505767 954 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
NLRP1Q9C000 GABARAPL1-213ENST00000544284 531 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NLRP1Q9C000 IFI27L1-212ENST00000557218 413 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NLRP1Q9C000 SRP14-208ENST00000560773 468 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NLRP1Q9C000 AC079414.2-201ENST00000567157 1104 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
NLRP1Q9C000 ANKRD26P1-203ENST00000569528 966 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
NLRP1Q9C000 MIR4746-201ENST00000579802 71 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
NLRP1Q9C000 MIR4254-201ENST00000581063 76 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.4 ms