Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQY4

RHOXF2, Rhox homeobox family member 2, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOXF2Q9BQY4 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RHOXF2Q9BQY4 GLB1L-201ENST00000295759 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RHOXF2Q9BQY4 ASB2-201ENST00000315988 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RHOXF2Q9BQY4 C1QTNF1-203ENST00000354124 2714 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RHOXF2Q9BQY4 MAGEA4-202ENST00000360243 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RHOXF2Q9BQY4 MAGEA4-203ENST00000370335 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RHOXF2Q9BQY4 MAGEA4-204ENST00000370340 1773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RHOXF2Q9BQY4 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RHOXF2Q9BQY4 PCDHA2-202ENST00000520672 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RHOXF2Q9BQY4 TNIK-204ENST00000436636 6970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RHOXF2Q9BQY4 EPN2-205ENST00000395626 2863 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RHOXF2Q9BQY4 DNAJA4-203ENST00000394855 3245 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RHOXF2Q9BQY4 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RHOXF2Q9BQY4 CARS-214ENST00000529772 2637 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RHOXF2Q9BQY4 TBC1D3E-201ENST00000621587 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RHOXF2Q9BQY4 NRDC-202ENST00000354831 3895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RHOXF2Q9BQY4 GCM2-201ENST00000379491 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RHOXF2Q9BQY4 SVOPL-202ENST00000419765 1523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RHOXF2Q9BQY4 CPPED1-201ENST00000261660 1898 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RHOXF2Q9BQY4 SYNGR1-203ENST00000328933 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RHOXF2Q9BQY4 CYP26B1-201ENST00000001146 4732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RHOXF2Q9BQY4 VGLL3-202ENST00000398399 10400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RHOXF2Q9BQY4 PWWP2A-202ENST00000456329 3991 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RHOXF2Q9BQY4 LSM14A-203ENST00000544216 3596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RHOXF2Q9BQY4 ARAF-201ENST00000290277 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RHOXF2Q9BQY4 ETV4-202ENST00000393664 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RHOXF2Q9BQY4 MRPL17-201ENST00000288937 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RHOXF2Q9BQY4 MTF2-202ENST00000370303 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RHOXF2Q9BQY4 MKRN1-201ENST00000255977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RHOXF2Q9BQY4 MEG3-213ENST00000455531 4867 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RHOXF2Q9BQY4 PRPF40B-209ENST00000548825 3307 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RHOXF2Q9BQY4 C11orf87-201ENST00000327419 5884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RHOXF2Q9BQY4 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RHOXF2Q9BQY4 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RHOXF2Q9BQY4 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RHOXF2Q9BQY4 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RHOXF2Q9BQY4 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RHOXF2Q9BQY4 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RHOXF2Q9BQY4 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RHOXF2Q9BQY4 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RHOXF2Q9BQY4 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RHOXF2Q9BQY4 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RHOXF2Q9BQY4 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RHOXF2Q9BQY4 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RHOXF2Q9BQY4 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RHOXF2Q9BQY4 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RHOXF2Q9BQY4 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RHOXF2Q9BQY4 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RHOXF2Q9BQY4 NTSR1-201ENST00000370501 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RHOXF2Q9BQY4 LINC00567-201ENST00000569854 3409 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RHOXF2Q9BQY4 NRXN1-222ENST00000625672 8113 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RHOXF2Q9BQY4 LARP4-201ENST00000293618 6296 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RHOXF2Q9BQY4 WDR66-201ENST00000288912 4467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RHOXF2Q9BQY4 NTRK3-AS1-201ENST00000569588 2663 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RHOXF2Q9BQY4 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RHOXF2Q9BQY4 FAM30A-205ENST00000630242 9612 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RHOXF2Q9BQY4 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RHOXF2Q9BQY4 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RHOXF2Q9BQY4 CCDC88C-201ENST00000331194 3104 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RHOXF2Q9BQY4 TFR2-205ENST00000462107 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RHOXF2Q9BQY4 UBFD1-207ENST00000567212 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RHOXF2Q9BQY4 MKNK1-203ENST00000371945 2618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RHOXF2Q9BQY4 FLAD1-206ENST00000368432 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RHOXF2Q9BQY4 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RHOXF2Q9BQY4 TBCE-207ENST00000543662 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RHOXF2Q9BQY4 USP31-203ENST00000567975 2142 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RHOXF2Q9BQY4 GOLGA7B-203ENST00000596005 6378 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RHOXF2Q9BQY4 MTMR3-204ENST00000401950 6018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RHOXF2Q9BQY4 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RHOXF2Q9BQY4 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RHOXF2Q9BQY4 DLG4-203ENST00000399510 3975 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RHOXF2Q9BQY4 DMTN-220ENST00000523266 2735 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RHOXF2Q9BQY4 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RHOXF2Q9BQY4 MIRLET7BHG-201ENST00000360737 4560 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RHOXF2Q9BQY4 TRAF3IP3-204ENST00000367026 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RHOXF2Q9BQY4 GMEB2-203ENST00000370077 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RHOXF2Q9BQY4 PPP2R5E-201ENST00000337537 6659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RHOXF2Q9BQY4 SH3D21-205ENST00000505871 2205 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RHOXF2Q9BQY4 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RHOXF2Q9BQY4 TMEM41A-203ENST00000421852 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RHOXF2Q9BQY4 AMOTL2-202ENST00000422605 4335 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RHOXF2Q9BQY4 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RHOXF2Q9BQY4 INTS6-201ENST00000311234 3662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RHOXF2Q9BQY4 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RHOXF2Q9BQY4 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RHOXF2Q9BQY4 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RHOXF2Q9BQY4 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RHOXF2Q9BQY4 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RHOXF2Q9BQY4 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RHOXF2Q9BQY4 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RHOXF2Q9BQY4 WASHC2A-209ENST00000611324 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RHOXF2Q9BQY4 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RHOXF2Q9BQY4 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RHOXF2Q9BQY4 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RHOXF2Q9BQY4 SLC35D1-201ENST00000235345 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RHOXF2Q9BQY4 PAM-207ENST00000455264 2898 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RHOXF2Q9BQY4 FAM120B-205ENST00000630384 3721 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RHOXF2Q9BQY4 IL1RN-201ENST00000259206 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RHOXF2Q9BQY4 KCTD9-201ENST00000221200 3401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RHOXF2Q9BQY4 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.9 ms