Protein–RNA interactions for Protein: Q969K3

RNF34, E3 ubiquitin-protein ligase RNF34, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF34Q969K3 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RNF34Q969K3 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RNF34Q969K3 TMCC3-201ENST00000261226 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RNF34Q969K3 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RNF34Q969K3 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RNF34Q969K3 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RNF34Q969K3 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
RNF34Q969K3 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RNF34Q969K3 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RNF34Q969K3 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RNF34Q969K3 MTUS1-204ENST00000381869 6256 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RNF34Q969K3 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RNF34Q969K3 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RNF34Q969K3 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RNF34Q969K3 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RNF34Q969K3 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RNF34Q969K3 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RNF34Q969K3 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
RNF34Q969K3 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RNF34Q969K3 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RNF34Q969K3 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RNF34Q969K3 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RNF34Q969K3 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
RNF34Q969K3 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RNF34Q969K3 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RNF34Q969K3 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RNF34Q969K3 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RNF34Q969K3 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RNF34Q969K3 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RNF34Q969K3 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
RNF34Q969K3 CBFA2T3-201ENST00000268679 4477 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RNF34Q969K3 CDH3-201ENST00000264012 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RNF34Q969K3 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RNF34Q969K3 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RNF34Q969K3 COL8A2-201ENST00000303143 4447 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RNF34Q969K3 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RNF34Q969K3 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RNF34Q969K3 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RNF34Q969K3 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RNF34Q969K3 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RNF34Q969K3 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RNF34Q969K3 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RNF34Q969K3 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RNF34Q969K3 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RNF34Q969K3 PSME4-202ENST00000404125 7099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RNF34Q969K3 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RNF34Q969K3 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RNF34Q969K3 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RNF34Q969K3 TBC1D24-207ENST00000627285 4382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RNF34Q969K3 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RNF34Q969K3 GTF2I-215ENST00000614986 4415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RNF34Q969K3 GTF2I-221ENST00000621734 4412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RNF34Q969K3 DHCR24-201ENST00000371269 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RNF34Q969K3 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RNF34Q969K3 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RNF34Q969K3 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RNF34Q969K3 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RNF34Q969K3 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RNF34Q969K3 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RNF34Q969K3 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RNF34Q969K3 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RNF34Q969K3 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RNF34Q969K3 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RNF34Q969K3 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RNF34Q969K3 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RNF34Q969K3 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RNF34Q969K3 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RNF34Q969K3 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RNF34Q969K3 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RNF34Q969K3 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RNF34Q969K3 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RNF34Q969K3 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RNF34Q969K3 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RNF34Q969K3 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RNF34Q969K3 E2F7-202ENST00000416496 5297 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RNF34Q969K3 SYT12-201ENST00000393946 4534 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RNF34Q969K3 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RNF34Q969K3 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RNF34Q969K3 OGFOD3-201ENST00000313056 4287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RNF34Q969K3 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RNF34Q969K3 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RNF34Q969K3 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RNF34Q969K3 OR2C3-201ENST00000366487 8467 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RNF34Q969K3 PPRC1-203ENST00000413464 4580 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RNF34Q969K3 TMEM47-201ENST00000275954 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RNF34Q969K3 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF34Q969K3 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF34Q969K3 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF34Q969K3 SLC35E2B-205ENST00000617444 6283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF34Q969K3 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF34Q969K3 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF34Q969K3 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF34Q969K3 CACNA1G-230ENST00000514717 6699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF34Q969K3 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF34Q969K3 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF34Q969K3 TCF12-201ENST00000267811 6061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF34Q969K3 CACNA2D2-204ENST00000424201 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF34Q969K3 GMCL1-201ENST00000282570 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF34Q969K3 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF34Q969K3 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.5 ms