Protein–RNA interactions for Protein: Q92547

TOPBP1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOPBP1Q92547 ACER3-205ENST00000526597 1269 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TOPBP1Q92547 AP000920.1-201ENST00000531824 344 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
TOPBP1Q92547 AC093510.1-202ENST00000546238 442 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TOPBP1Q92547 AL139316.1-201ENST00000555643 568 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TOPBP1Q92547 AC026120.2-201ENST00000617239 309 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
TOPBP1Q92547 AC006207.1-201ENST00000637958 562 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TOPBP1Q92547 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TOPBP1Q92547 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TOPBP1Q92547 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TOPBP1Q92547 KCNIP1-210ENST00000636734 1613 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TOPBP1Q92547 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TOPBP1Q92547 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TOPBP1Q92547 PSMC5-201ENST00000310144 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TOPBP1Q92547 ZFP1-201ENST00000332307 1502 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TOPBP1Q92547 FUNDC2P2-201ENST00000331369 1223 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TOPBP1Q92547 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TOPBP1Q92547 TMSB4X-202ENST00000380635 767 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TOPBP1Q92547 AC231533.1-201ENST00000416061 925 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TOPBP1Q92547 AL355482.2-201ENST00000428646 1145 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TOPBP1Q92547 AC103923.1-201ENST00000453229 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TOPBP1Q92547 AC087442.1-201ENST00000525563 249 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TOPBP1Q92547 APOPT1-215ENST00000556253 783 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TOPBP1Q92547 ZNF677-210ENST00000601413 706 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TOPBP1Q92547 IFITM2-205ENST00000602569 605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TOPBP1Q92547 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TOPBP1Q92547 Z98885.3-201ENST00000624882 1757 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
TOPBP1Q92547 NFATC4-226ENST00000556279 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TOPBP1Q92547 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TOPBP1Q92547 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TOPBP1Q92547 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TOPBP1Q92547 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TOPBP1Q92547 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TOPBP1Q92547 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TOPBP1Q92547 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TOPBP1Q92547 AL359649.1-202ENST00000375713 443 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TOPBP1Q92547 AL022332.1-202ENST00000432495 426 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TOPBP1Q92547 B9D1-206ENST00000461069 923 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TOPBP1Q92547 RN7SL173P-201ENST00000461853 292 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
TOPBP1Q92547 DPY19L2P4-201ENST00000479881 442 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
TOPBP1Q92547 AC004893.2-203ENST00000482799 796 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TOPBP1Q92547 AC099328.1-201ENST00000498809 1030 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
TOPBP1Q92547 RMDN1-218ENST00000523911 950 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TOPBP1Q92547 AC091588.3-201ENST00000583442 770 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TOPBP1Q92547 AP003900.1-201ENST00000622592 859 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TOPBP1Q92547 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TOPBP1Q92547 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TOPBP1Q92547 AL008638.4-201ENST00000624792 1315 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
TOPBP1Q92547 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TOPBP1Q92547 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TOPBP1Q92547 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TOPBP1Q92547 OR2T8-201ENST00000319968 939 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TOPBP1Q92547 SPATS1-202ENST00000323108 1107 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TOPBP1Q92547 SKA1-202ENST00000398452 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TOPBP1Q92547 KCNE1-202ENST00000399284 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TOPBP1Q92547 KRT18P44-201ENST00000416086 1285 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
TOPBP1Q92547 SNRPCP15-201ENST00000424055 192 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
TOPBP1Q92547 CCND3P1-201ENST00000438347 580 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
TOPBP1Q92547 AL031587.2-201ENST00000445483 414 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TOPBP1Q92547 RNA5SP420-201ENST00000516997 137 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
TOPBP1Q92547 CD44-224ENST00000526669 870 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TOPBP1Q92547 MBP-230ENST00000528160 584 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TOPBP1Q92547 FAM167A-AS1-202ENST00000533578 1222 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TOPBP1Q92547 CMTM1-219ENST00000533953 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TOPBP1Q92547 AC026470.4-201ENST00000565812 308 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TOPBP1Q92547 AC132812.1-201ENST00000583145 892 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
TOPBP1Q92547 ETV4-208ENST00000586826 917 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TOPBP1Q92547 AP001462.1-201ENST00000594089 452 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
TOPBP1Q92547 PSME2-217ENST00000615264 874 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TOPBP1Q92547 PSME2-218ENST00000630027 185 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TOPBP1Q92547 OR2T8-202ENST00000641945 1226 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TOPBP1Q92547 NEK3-210ENST00000620675 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TOPBP1Q92547 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TOPBP1Q92547 HNRNPC-205ENST00000553300 1375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TOPBP1Q92547 CLUAP1-201ENST00000341633 1643 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TOPBP1Q92547 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TOPBP1Q92547 APOF-201ENST00000398189 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TOPBP1Q92547 MECP2-217ENST00000628176 1712 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TOPBP1Q92547 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TOPBP1Q92547 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TOPBP1Q92547 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TOPBP1Q92547 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TOPBP1Q92547 RARG-202ENST00000394426 2640 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
TOPBP1Q92547 LGALS4-201ENST00000307751 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
TOPBP1Q92547 ART3-201ENST00000341029 1517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
TOPBP1Q92547 KRTAP12-2-201ENST00000360770 739 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.36
TOPBP1Q92547 GLRX2-202ENST00000367440 1131 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
TOPBP1Q92547 CIDEC-205ENST00000443115 443 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
TOPBP1Q92547 SNHG4-204ENST00000507197 865 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
TOPBP1Q92547 NAV2-AS2-201ENST00000533767 782 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
TOPBP1Q92547 AC026310.2-201ENST00000546353 728 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.36
TOPBP1Q92547 GRAMD4P6-201ENST00000556999 244 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
TOPBP1Q92547 PRR20FP-201ENST00000603320 180 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
TOPBP1Q92547 KRTAP10-4-202ENST00000616689 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
TOPBP1Q92547 AL512324.3-201ENST00000619383 882 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
TOPBP1Q92547 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
TOPBP1Q92547 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
TOPBP1Q92547 IL18BP-201ENST00000260049 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
TOPBP1Q92547 FAM167A-AS1-203ENST00000624614 1357 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
TOPBP1Q92547 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
TOPBP1Q92547 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms