Protein–RNA interactions for Protein: Q8TAP4

LMO3, LIM domain only protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3Q8TAP4 FOXF1-201ENST00000262426 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LMO3Q8TAP4 SLC9B1-201ENST00000296422 1879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LMO3Q8TAP4 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LMO3Q8TAP4 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LMO3Q8TAP4 AC148477.2-201ENST00000537762 3039 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LMO3Q8TAP4 IL17RD-203ENST00000463523 2348 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LMO3Q8TAP4 RAB11FIP1-206ENST00000524118 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LMO3Q8TAP4 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LMO3Q8TAP4 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LMO3Q8TAP4 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LMO3Q8TAP4 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LMO3Q8TAP4 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LMO3Q8TAP4 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
LMO3Q8TAP4 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LMO3Q8TAP4 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LMO3Q8TAP4 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LMO3Q8TAP4 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LMO3Q8TAP4 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LMO3Q8TAP4 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LMO3Q8TAP4 AC099684.2-201ENST00000574520 870 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LMO3Q8TAP4 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LMO3Q8TAP4 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LMO3Q8TAP4 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
LMO3Q8TAP4 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LMO3Q8TAP4 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LMO3Q8TAP4 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LMO3Q8TAP4 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LMO3Q8TAP4 RNF41-202ENST00000394013 2452 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LMO3Q8TAP4 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LMO3Q8TAP4 AC012184.2-203ENST00000443119 2110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LMO3Q8TAP4 AGFG1-204ENST00000409315 2912 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LMO3Q8TAP4 NDRG4-217ENST00000562999 2931 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LMO3Q8TAP4 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LMO3Q8TAP4 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LMO3Q8TAP4 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LMO3Q8TAP4 ZNF829-201ENST00000391711 1805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LMO3Q8TAP4 RASSF3-204ENST00000542104 3492 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LMO3Q8TAP4 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
LMO3Q8TAP4 HIF3A-202ENST00000244303 2250 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LMO3Q8TAP4 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LMO3Q8TAP4 GRHL1-202ENST00000405379 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LMO3Q8TAP4 LAP3P2-201ENST00000454686 1454 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
LMO3Q8TAP4 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LMO3Q8TAP4 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LMO3Q8TAP4 PISD-209ENST00000439502 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
LMO3Q8TAP4 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
LMO3Q8TAP4 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
LMO3Q8TAP4 ZNF674-AS1-201ENST00000421685 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
LMO3Q8TAP4 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
LMO3Q8TAP4 EFHC1-230ENST00000637263 2089 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
LMO3Q8TAP4 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
LMO3Q8TAP4 EIF4E2-201ENST00000258416 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
LMO3Q8TAP4 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LMO3Q8TAP4 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LMO3Q8TAP4 RBPJ-206ENST00000361572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LMO3Q8TAP4 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LMO3Q8TAP4 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LMO3Q8TAP4 PPM1M-203ENST00000409502 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LMO3Q8TAP4 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LMO3Q8TAP4 PRTFDC1-202ENST00000376376 741 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LMO3Q8TAP4 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LMO3Q8TAP4 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LMO3Q8TAP4 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LMO3Q8TAP4 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
LMO3Q8TAP4 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LMO3Q8TAP4 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LMO3Q8TAP4 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LMO3Q8TAP4 AC124068.2-202ENST00000562356 612 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LMO3Q8TAP4 AC124068.2-201ENST00000569473 1109 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
LMO3Q8TAP4 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LMO3Q8TAP4 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LMO3Q8TAP4 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LMO3Q8TAP4 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LMO3Q8TAP4 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
LMO3Q8TAP4 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LMO3Q8TAP4 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LMO3Q8TAP4 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LMO3Q8TAP4 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LMO3Q8TAP4 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LMO3Q8TAP4 TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 181 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
LMO3Q8TAP4 DDX5-235ENST00000630471 473 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LMO3Q8TAP4 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
LMO3Q8TAP4 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LMO3Q8TAP4 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LMO3Q8TAP4 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LMO3Q8TAP4 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LMO3Q8TAP4 MCRS1-201ENST00000343810 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LMO3Q8TAP4 FAM90A7P-201ENST00000382628 1395 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
LMO3Q8TAP4 FAM90A23P-201ENST00000400136 1395 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
LMO3Q8TAP4 FAM90A1-203ENST00000538603 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LMO3Q8TAP4 OLFML3-203ENST00000393300 1961 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LMO3Q8TAP4 SERPING1-201ENST00000278407 2002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LMO3Q8TAP4 SVIL-AS1-204ENST00000427063 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LMO3Q8TAP4 PLA1A-204ENST00000488919 1456 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LMO3Q8TAP4 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LMO3Q8TAP4 CRMP1-205ENST00000512574 2764 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LMO3Q8TAP4 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LMO3Q8TAP4 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LMO3Q8TAP4 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LMO3Q8TAP4 FAM213A-203ENST00000372187 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 148.4 ms