Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBJ5

COLGALT1, Procollagen galactosyltransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COLGALT1Q8NBJ5 S100A2-203ENST00000368709 457 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
COLGALT1Q8NBJ5 SDHAF4-201ENST00000370474 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
COLGALT1Q8NBJ5 AP000356.3-201ENST00000382243 753 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
COLGALT1Q8NBJ5 TRO-205ENST00000399736 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
COLGALT1Q8NBJ5 PIK3IP1-202ENST00000402249 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
COLGALT1Q8NBJ5 LINC00322-201ENST00000450205 699 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
COLGALT1Q8NBJ5 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
COLGALT1Q8NBJ5 ZNF124-204ENST00000491356 956 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
COLGALT1Q8NBJ5 CFL1-206ENST00000527344 962 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
COLGALT1Q8NBJ5 AC073573.1-201ENST00000550908 481 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
COLGALT1Q8NBJ5 ANP32A-210ENST00000560303 724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
COLGALT1Q8NBJ5 AC135983.4-201ENST00000564116 1262 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
COLGALT1Q8NBJ5 AIPL1-211ENST00000576776 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
COLGALT1Q8NBJ5 AC138894.2-201ENST00000602838 371 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
COLGALT1Q8NBJ5 LINC01783-202ENST00000614408 828 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
COLGALT1Q8NBJ5 BX284668.2-205ENST00000619677 828 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
COLGALT1Q8NBJ5 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
COLGALT1Q8NBJ5 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
COLGALT1Q8NBJ5 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
COLGALT1Q8NBJ5 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
COLGALT1Q8NBJ5 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
COLGALT1Q8NBJ5 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
COLGALT1Q8NBJ5 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
COLGALT1Q8NBJ5 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
COLGALT1Q8NBJ5 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
COLGALT1Q8NBJ5 DDX39A-201ENST00000242776 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
COLGALT1Q8NBJ5 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
COLGALT1Q8NBJ5 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
COLGALT1Q8NBJ5 MIR762HG-203ENST00000570025 1429 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
COLGALT1Q8NBJ5 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
COLGALT1Q8NBJ5 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
COLGALT1Q8NBJ5 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
COLGALT1Q8NBJ5 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
COLGALT1Q8NBJ5 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
COLGALT1Q8NBJ5 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
COLGALT1Q8NBJ5 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
COLGALT1Q8NBJ5 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
COLGALT1Q8NBJ5 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
COLGALT1Q8NBJ5 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
COLGALT1Q8NBJ5 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
COLGALT1Q8NBJ5 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
COLGALT1Q8NBJ5 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
COLGALT1Q8NBJ5 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
COLGALT1Q8NBJ5 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
COLGALT1Q8NBJ5 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
COLGALT1Q8NBJ5 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
COLGALT1Q8NBJ5 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
COLGALT1Q8NBJ5 ABHD4-201ENST00000216327 716 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
COLGALT1Q8NBJ5 UBL4A-201ENST00000369653 711 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
COLGALT1Q8NBJ5 KRTAP2-4-201ENST00000394015 764 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
COLGALT1Q8NBJ5 RPS9P1-201ENST00000419943 583 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
COLGALT1Q8NBJ5 HLA-DQB2-232ENST00000437316 1214 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
COLGALT1Q8NBJ5 AL080250.1-201ENST00000438676 445 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
COLGALT1Q8NBJ5 IL1R2-203ENST00000441002 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
COLGALT1Q8NBJ5 AC020763.1-201ENST00000567186 551 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
COLGALT1Q8NBJ5 PHBP15-201ENST00000574228 665 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
COLGALT1Q8NBJ5 AP005264.3-201ENST00000592370 485 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
COLGALT1Q8NBJ5 HPN-206ENST00000597419 1212 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
COLGALT1Q8NBJ5 ITGA9-AS1-213ENST00000614028 913 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
COLGALT1Q8NBJ5 AC242376.2-201ENST00000619355 883 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
COLGALT1Q8NBJ5 ALKBH2-208ENST00000619381 895 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
COLGALT1Q8NBJ5 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
COLGALT1Q8NBJ5 AC015909.3-201ENST00000572855 1794 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
COLGALT1Q8NBJ5 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
COLGALT1Q8NBJ5 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
COLGALT1Q8NBJ5 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
COLGALT1Q8NBJ5 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
COLGALT1Q8NBJ5 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
COLGALT1Q8NBJ5 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
COLGALT1Q8NBJ5 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
COLGALT1Q8NBJ5 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
COLGALT1Q8NBJ5 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
COLGALT1Q8NBJ5 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
COLGALT1Q8NBJ5 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
COLGALT1Q8NBJ5 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
COLGALT1Q8NBJ5 SNRPN-203ENST00000400097 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
COLGALT1Q8NBJ5 LINC01165-201ENST00000445190 1623 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
COLGALT1Q8NBJ5 SMTNL1-202ENST00000527972 1649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
COLGALT1Q8NBJ5 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
COLGALT1Q8NBJ5 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
COLGALT1Q8NBJ5 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
COLGALT1Q8NBJ5 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
COLGALT1Q8NBJ5 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
COLGALT1Q8NBJ5 RHD-203ENST00000357542 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
COLGALT1Q8NBJ5 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
COLGALT1Q8NBJ5 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
COLGALT1Q8NBJ5 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
COLGALT1Q8NBJ5 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
COLGALT1Q8NBJ5 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
COLGALT1Q8NBJ5 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
COLGALT1Q8NBJ5 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
COLGALT1Q8NBJ5 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
COLGALT1Q8NBJ5 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
COLGALT1Q8NBJ5 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
COLGALT1Q8NBJ5 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
COLGALT1Q8NBJ5 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
COLGALT1Q8NBJ5 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
COLGALT1Q8NBJ5 AC018629.1-201ENST00000623381 1736 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
COLGALT1Q8NBJ5 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
COLGALT1Q8NBJ5 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 453.9 ms