Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9W8

FAM71D, Protein FAM71D, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM71DQ8N9W8 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM71DQ8N9W8 GP1BA-202ENST00000611961 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM71DQ8N9W8 KDM1B-201ENST00000297792 3811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM71DQ8N9W8 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM71DQ8N9W8 SIGLEC16-202ENST00000602139 2510 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM71DQ8N9W8 KBTBD12-202ENST00000405109 5727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM71DQ8N9W8 CERS6-202ENST00000392687 6851 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM71DQ8N9W8 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM71DQ8N9W8 PTPRU-204ENST00000428026 5550 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM71DQ8N9W8 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM71DQ8N9W8 STK33-203ENST00000396672 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM71DQ8N9W8 PADI2-202ENST00000375486 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM71DQ8N9W8 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM71DQ8N9W8 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM71DQ8N9W8 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM71DQ8N9W8 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM71DQ8N9W8 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM71DQ8N9W8 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM71DQ8N9W8 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM71DQ8N9W8 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM71DQ8N9W8 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM71DQ8N9W8 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM71DQ8N9W8 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM71DQ8N9W8 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM71DQ8N9W8 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM71DQ8N9W8 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM71DQ8N9W8 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM71DQ8N9W8 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM71DQ8N9W8 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM71DQ8N9W8 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM71DQ8N9W8 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM71DQ8N9W8 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM71DQ8N9W8 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM71DQ8N9W8 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM71DQ8N9W8 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM71DQ8N9W8 FAM90A1-203ENST00000538603 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM71DQ8N9W8 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM71DQ8N9W8 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM71DQ8N9W8 PDLIM2-201ENST00000265810 4592 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM71DQ8N9W8 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM71DQ8N9W8 SPRY1-208ENST00000622283 2352 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM71DQ8N9W8 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM71DQ8N9W8 ABCC6-208ENST00000622290 4941 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM71DQ8N9W8 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM71DQ8N9W8 SH3KBP1-205ENST00000397821 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM71DQ8N9W8 PELP1-212ENST00000574876 3465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FAM71DQ8N9W8 CSNK1D-202ENST00000314028 3712 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FAM71DQ8N9W8 TMPRSS9-201ENST00000332578 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FAM71DQ8N9W8 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FAM71DQ8N9W8 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FAM71DQ8N9W8 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FAM71DQ8N9W8 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FAM71DQ8N9W8 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FAM71DQ8N9W8 IL17RD-208ENST00000640796 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FAM71DQ8N9W8 FGFR3-201ENST00000260795 4132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FAM71DQ8N9W8 ARHGAP45-206ENST00000586866 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FAM71DQ8N9W8 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FAM71DQ8N9W8 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FAM71DQ8N9W8 SCUBE2-201ENST00000309263 3727 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FAM71DQ8N9W8 CCNG1-202ENST00000393929 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FAM71DQ8N9W8 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FAM71DQ8N9W8 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FAM71DQ8N9W8 TTC28-AS1-212ENST00000433317 3080 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FAM71DQ8N9W8 ADAM12-201ENST00000368676 3313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FAM71DQ8N9W8 B3GAT2-201ENST00000230053 6565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FAM71DQ8N9W8 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FAM71DQ8N9W8 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FAM71DQ8N9W8 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FAM71DQ8N9W8 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FAM71DQ8N9W8 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FAM71DQ8N9W8 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FAM71DQ8N9W8 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FAM71DQ8N9W8 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FAM71DQ8N9W8 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
FAM71DQ8N9W8 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FAM71DQ8N9W8 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FAM71DQ8N9W8 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FAM71DQ8N9W8 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FAM71DQ8N9W8 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FAM71DQ8N9W8 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FAM71DQ8N9W8 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FAM71DQ8N9W8 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FAM71DQ8N9W8 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FAM71DQ8N9W8 ARHGEF7-201ENST00000218789 5233 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FAM71DQ8N9W8 PROM2-203ENST00000403131 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FAM71DQ8N9W8 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FAM71DQ8N9W8 ANO6-202ENST00000423947 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FAM71DQ8N9W8 SC5D-201ENST00000264027 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FAM71DQ8N9W8 CCNJ-201ENST00000265992 4115 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FAM71DQ8N9W8 ARHGAP45-202ENST00000539243 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FAM71DQ8N9W8 ARHGAP4-201ENST00000350060 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FAM71DQ8N9W8 LRRFIP1-203ENST00000308482 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FAM71DQ8N9W8 ZNF785-201ENST00000395216 3282 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FAM71DQ8N9W8 PAK3-208ENST00000446737 2550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FAM71DQ8N9W8 HSD17B4-215ENST00000510025 2589 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FAM71DQ8N9W8 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FAM71DQ8N9W8 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FAM71DQ8N9W8 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FAM71DQ8N9W8 AC099548.2-204ENST00000481651 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FAM71DQ8N9W8 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.6 ms