Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXW5

RPAP2, Putative RNA polymerase II subunit B1 CTD phosphatase RPAP2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPAP2Q8IXW5 GTF3C2-214ENST00000622534 1858 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RPAP2Q8IXW5 SHCBP1-201ENST00000303383 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RPAP2Q8IXW5 TMPRSS2-201ENST00000332149 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RPAP2Q8IXW5 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RPAP2Q8IXW5 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RPAP2Q8IXW5 DNMT3L-201ENST00000270172 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RPAP2Q8IXW5 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
RPAP2Q8IXW5 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RPAP2Q8IXW5 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RPAP2Q8IXW5 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RPAP2Q8IXW5 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RPAP2Q8IXW5 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RPAP2Q8IXW5 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RPAP2Q8IXW5 AL022313.4-201ENST00000562756 2046 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
RPAP2Q8IXW5 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RPAP2Q8IXW5 TFDP1-201ENST00000375370 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RPAP2Q8IXW5 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RPAP2Q8IXW5 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RPAP2Q8IXW5 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RPAP2Q8IXW5 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RPAP2Q8IXW5 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RPAP2Q8IXW5 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RPAP2Q8IXW5 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RPAP2Q8IXW5 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RPAP2Q8IXW5 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RPAP2Q8IXW5 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RPAP2Q8IXW5 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
RPAP2Q8IXW5 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RPAP2Q8IXW5 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RPAP2Q8IXW5 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RPAP2Q8IXW5 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
RPAP2Q8IXW5 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
RPAP2Q8IXW5 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
RPAP2Q8IXW5 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RPAP2Q8IXW5 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RPAP2Q8IXW5 PLEKHB2-206ENST00000409612 2210 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RPAP2Q8IXW5 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RPAP2Q8IXW5 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RPAP2Q8IXW5 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RPAP2Q8IXW5 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RPAP2Q8IXW5 AL357054.3-201ENST00000607084 2055 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
RPAP2Q8IXW5 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
RPAP2Q8IXW5 COG3-206ENST00000617493 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
RPAP2Q8IXW5 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RPAP2Q8IXW5 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RPAP2Q8IXW5 NBAT1-201ENST00000566912 1940 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RPAP2Q8IXW5 CYP4F23P-201ENST00000593402 1579 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
RPAP2Q8IXW5 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RPAP2Q8IXW5 GP1BA-202ENST00000611961 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RPAP2Q8IXW5 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RPAP2Q8IXW5 GPX3-201ENST00000388825 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RPAP2Q8IXW5 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RPAP2Q8IXW5 RNF144A-AS1-203ENST00000426122 579 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RPAP2Q8IXW5 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RPAP2Q8IXW5 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
RPAP2Q8IXW5 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RPAP2Q8IXW5 AC011773.1-201ENST00000520129 468 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RPAP2Q8IXW5 AC003686.1-201ENST00000550956 1034 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
RPAP2Q8IXW5 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RPAP2Q8IXW5 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RPAP2Q8IXW5 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
RPAP2Q8IXW5 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RPAP2Q8IXW5 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RPAP2Q8IXW5 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
RPAP2Q8IXW5 FAM86B1-203ENST00000448228 2096 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RPAP2Q8IXW5 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RPAP2Q8IXW5 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RPAP2Q8IXW5 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RPAP2Q8IXW5 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
RPAP2Q8IXW5 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RPAP2Q8IXW5 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RPAP2Q8IXW5 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RPAP2Q8IXW5 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RPAP2Q8IXW5 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RPAP2Q8IXW5 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RPAP2Q8IXW5 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RPAP2Q8IXW5 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPAP2Q8IXW5 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPAP2Q8IXW5 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
RPAP2Q8IXW5 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPAP2Q8IXW5 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPAP2Q8IXW5 PRIMPOL-211ENST00000515774 2007 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPAP2Q8IXW5 KRT8P24-201ENST00000560290 1559 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
RPAP2Q8IXW5 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPAP2Q8IXW5 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPAP2Q8IXW5 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPAP2Q8IXW5 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPAP2Q8IXW5 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPAP2Q8IXW5 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPAP2Q8IXW5 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPAP2Q8IXW5 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPAP2Q8IXW5 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPAP2Q8IXW5 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPAP2Q8IXW5 KRTAP19-5-201ENST00000334151 461 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPAP2Q8IXW5 AL009181.1-201ENST00000418471 1085 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPAP2Q8IXW5 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPAP2Q8IXW5 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
RPAP2Q8IXW5 AC006122.1-201ENST00000493323 440 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
RPAP2Q8IXW5 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RPAP2Q8IXW5 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.5 ms