Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT98

PRAMEF20, PRAME family member 20, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF20Q5VT98 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PRAMEF20Q5VT98 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
PRAMEF20Q5VT98 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PRAMEF20Q5VT98 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
PRAMEF20Q5VT98 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PRAMEF20Q5VT98 EPAS1-201ENST00000263734 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PRAMEF20Q5VT98 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PRAMEF20Q5VT98 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PRAMEF20Q5VT98 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PRAMEF20Q5VT98 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PRAMEF20Q5VT98 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PRAMEF20Q5VT98 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PRAMEF20Q5VT98 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PRAMEF20Q5VT98 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PRAMEF20Q5VT98 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PRAMEF20Q5VT98 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PRAMEF20Q5VT98 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PRAMEF20Q5VT98 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PRAMEF20Q5VT98 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PRAMEF20Q5VT98 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PRAMEF20Q5VT98 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PRAMEF20Q5VT98 KBTBD12-202ENST00000405109 5727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PRAMEF20Q5VT98 EHD4-201ENST00000220325 6416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PRAMEF20Q5VT98 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PRAMEF20Q5VT98 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PRAMEF20Q5VT98 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PRAMEF20Q5VT98 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PRAMEF20Q5VT98 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PRAMEF20Q5VT98 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PRAMEF20Q5VT98 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PRAMEF20Q5VT98 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PRAMEF20Q5VT98 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PRAMEF20Q5VT98 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PRAMEF20Q5VT98 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PRAMEF20Q5VT98 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PRAMEF20Q5VT98 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PRAMEF20Q5VT98 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PRAMEF20Q5VT98 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PRAMEF20Q5VT98 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PRAMEF20Q5VT98 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PRAMEF20Q5VT98 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PRAMEF20Q5VT98 ZBED1-203ENST00000381223 4510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PRAMEF20Q5VT98 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PRAMEF20Q5VT98 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PRAMEF20Q5VT98 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PRAMEF20Q5VT98 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PRAMEF20Q5VT98 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
PRAMEF20Q5VT98 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PRAMEF20Q5VT98 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
PRAMEF20Q5VT98 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PRAMEF20Q5VT98 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PRAMEF20Q5VT98 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PRAMEF20Q5VT98 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PRAMEF20Q5VT98 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PRAMEF20Q5VT98 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
PRAMEF20Q5VT98 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PRAMEF20Q5VT98 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PRAMEF20Q5VT98 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
PRAMEF20Q5VT98 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PRAMEF20Q5VT98 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PRAMEF20Q5VT98 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
PRAMEF20Q5VT98 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PRAMEF20Q5VT98 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PRAMEF20Q5VT98 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
PRAMEF20Q5VT98 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PRAMEF20Q5VT98 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
PRAMEF20Q5VT98 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PRAMEF20Q5VT98 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PRAMEF20Q5VT98 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PRAMEF20Q5VT98 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PRAMEF20Q5VT98 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PRAMEF20Q5VT98 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PRAMEF20Q5VT98 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PRAMEF20Q5VT98 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PRAMEF20Q5VT98 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PRAMEF20Q5VT98 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
PRAMEF20Q5VT98 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PRAMEF20Q5VT98 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PRAMEF20Q5VT98 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PRAMEF20Q5VT98 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PRAMEF20Q5VT98 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PRAMEF20Q5VT98 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
PRAMEF20Q5VT98 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PRAMEF20Q5VT98 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PRAMEF20Q5VT98 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PRAMEF20Q5VT98 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
PRAMEF20Q5VT98 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PRAMEF20Q5VT98 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
PRAMEF20Q5VT98 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PRAMEF20Q5VT98 PDLIM2-201ENST00000265810 4592 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PRAMEF20Q5VT98 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PRAMEF20Q5VT98 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PRAMEF20Q5VT98 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PRAMEF20Q5VT98 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PRAMEF20Q5VT98 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PRAMEF20Q5VT98 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PRAMEF20Q5VT98 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PRAMEF20Q5VT98 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
PRAMEF20Q5VT98 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
PRAMEF20Q5VT98 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms