Protein–RNA interactions for Protein: Q53SF7

COBLL1, Cordon-bleu protein-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COBLL1Q53SF7 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
COBLL1Q53SF7 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
COBLL1Q53SF7 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
COBLL1Q53SF7 ZFP64-203ENST00000361387 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
COBLL1Q53SF7 FAM90A1-203ENST00000538603 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
COBLL1Q53SF7 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
COBLL1Q53SF7 UBTF-205ENST00000526094 2459 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
COBLL1Q53SF7 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
COBLL1Q53SF7 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
COBLL1Q53SF7 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
COBLL1Q53SF7 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
COBLL1Q53SF7 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
COBLL1Q53SF7 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
COBLL1Q53SF7 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
COBLL1Q53SF7 CETP-203ENST00000566128 1733 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
COBLL1Q53SF7 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
COBLL1Q53SF7 TMBIM6-203ENST00000423828 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
COBLL1Q53SF7 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
COBLL1Q53SF7 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
COBLL1Q53SF7 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
COBLL1Q53SF7 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
COBLL1Q53SF7 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
COBLL1Q53SF7 LIPA-202ENST00000336233 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
COBLL1Q53SF7 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
COBLL1Q53SF7 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
COBLL1Q53SF7 STIP1-203ENST00000358794 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
COBLL1Q53SF7 TMEM87A-201ENST00000307216 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
COBLL1Q53SF7 AC005523.2-201ENST00000601192 3568 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
COBLL1Q53SF7 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
COBLL1Q53SF7 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
COBLL1Q53SF7 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
COBLL1Q53SF7 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
COBLL1Q53SF7 CROT-203ENST00000419147 2959 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
COBLL1Q53SF7 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
COBLL1Q53SF7 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
COBLL1Q53SF7 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
COBLL1Q53SF7 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
COBLL1Q53SF7 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
COBLL1Q53SF7 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
COBLL1Q53SF7 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
COBLL1Q53SF7 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
COBLL1Q53SF7 AC009975.2-202ENST00000634539 854 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
COBLL1Q53SF7 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
COBLL1Q53SF7 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
COBLL1Q53SF7 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
COBLL1Q53SF7 EFHC1-230ENST00000637263 2089 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
COBLL1Q53SF7 CLEC18B-204ENST00000617101 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
COBLL1Q53SF7 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
COBLL1Q53SF7 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
COBLL1Q53SF7 MAP3K3-203ENST00000577395 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
COBLL1Q53SF7 SGK3-208ENST00000521198 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
COBLL1Q53SF7 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
COBLL1Q53SF7 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
COBLL1Q53SF7 FCRL6-201ENST00000321935 1997 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
COBLL1Q53SF7 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
COBLL1Q53SF7 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
COBLL1Q53SF7 SEPT9-220ENST00000588690 2919 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
COBLL1Q53SF7 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
COBLL1Q53SF7 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
COBLL1Q53SF7 DENND1C-202ENST00000543576 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
COBLL1Q53SF7 C2orf68-201ENST00000306336 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
COBLL1Q53SF7 IL17RD-208ENST00000640796 2345 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
COBLL1Q53SF7 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
COBLL1Q53SF7 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
COBLL1Q53SF7 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
COBLL1Q53SF7 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
COBLL1Q53SF7 PDE4A-209ENST00000592685 2707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
COBLL1Q53SF7 SLC6A2-205ENST00000566163 1759 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
COBLL1Q53SF7 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
COBLL1Q53SF7 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
COBLL1Q53SF7 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
COBLL1Q53SF7 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
COBLL1Q53SF7 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
COBLL1Q53SF7 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
COBLL1Q53SF7 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
COBLL1Q53SF7 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
COBLL1Q53SF7 LAMA4-209ENST00000453937 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
COBLL1Q53SF7 AC097103.2-201ENST00000504670 602 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
COBLL1Q53SF7 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
COBLL1Q53SF7 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
COBLL1Q53SF7 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
COBLL1Q53SF7 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
COBLL1Q53SF7 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
COBLL1Q53SF7 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
COBLL1Q53SF7 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
COBLL1Q53SF7 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
COBLL1Q53SF7 ZBTB7B-202ENST00000368426 3594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
COBLL1Q53SF7 LETMD1-235ENST00000552739 1713 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
COBLL1Q53SF7 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
COBLL1Q53SF7 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
COBLL1Q53SF7 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
COBLL1Q53SF7 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
COBLL1Q53SF7 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
COBLL1Q53SF7 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
COBLL1Q53SF7 C17orf53-201ENST00000245382 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
COBLL1Q53SF7 WNT3A-201ENST00000284523 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
COBLL1Q53SF7 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
COBLL1Q53SF7 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
COBLL1Q53SF7 IL1RN-201ENST00000259206 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
COBLL1Q53SF7 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 133.1 ms