Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDR2

CTXN3, Cortexin-3, humanhuman

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Length 81 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN3Q4LDR2 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTXN3Q4LDR2 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTXN3Q4LDR2 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTXN3Q4LDR2 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTXN3Q4LDR2 PBDC1-201ENST00000373357 977 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTXN3Q4LDR2 HSPB7-203ENST00000406363 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTXN3Q4LDR2 RPL8P2-201ENST00000430538 502 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CTXN3Q4LDR2 CSTF3-202ENST00000431742 715 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTXN3Q4LDR2 LINC01088-201ENST00000437737 973 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTXN3Q4LDR2 AP000356.1-201ENST00000438893 364 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTXN3Q4LDR2 SRSF10-211ENST00000484146 1089 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTXN3Q4LDR2 PRKRA-211ENST00000487082 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTXN3Q4LDR2 RN7SL67P-201ENST00000492147 296 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CTXN3Q4LDR2 AC019193.1-201ENST00000506678 823 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CTXN3Q4LDR2 AC138230.1-201ENST00000525893 664 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTXN3Q4LDR2 SIRT3-210ENST00000529382 1225 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTXN3Q4LDR2 AC135983.1-201ENST00000562108 1097 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTXN3Q4LDR2 SHBG-207ENST00000570547 801 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTXN3Q4LDR2 IMPA2-207ENST00000588927 787 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTXN3Q4LDR2 EXOSC5-204ENST00000596905 826 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTXN3Q4LDR2 AC007718.1-201ENST00000621078 280 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CTXN3Q4LDR2 MBD3L2B-201ENST00000636986 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTXN3Q4LDR2 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTXN3Q4LDR2 PPIL3-201ENST00000286175 1370 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTXN3Q4LDR2 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTXN3Q4LDR2 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTXN3Q4LDR2 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTXN3Q4LDR2 SGCE-202ENST00000415788 1871 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTXN3Q4LDR2 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTXN3Q4LDR2 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTXN3Q4LDR2 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTXN3Q4LDR2 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTXN3Q4LDR2 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTXN3Q4LDR2 AATBC-201ENST00000400385 4598 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTXN3Q4LDR2 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTXN3Q4LDR2 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTXN3Q4LDR2 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTXN3Q4LDR2 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTXN3Q4LDR2 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTXN3Q4LDR2 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTXN3Q4LDR2 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTXN3Q4LDR2 LINC00513-201ENST00000447430 1616 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTXN3Q4LDR2 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTXN3Q4LDR2 FP565260.6-203ENST00000620015 1435 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTXN3Q4LDR2 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTXN3Q4LDR2 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTXN3Q4LDR2 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTXN3Q4LDR2 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTXN3Q4LDR2 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTXN3Q4LDR2 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTXN3Q4LDR2 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTXN3Q4LDR2 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTXN3Q4LDR2 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTXN3Q4LDR2 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTXN3Q4LDR2 PSG4-203ENST00000433626 1887 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTXN3Q4LDR2 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTXN3Q4LDR2 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTXN3Q4LDR2 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTXN3Q4LDR2 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTXN3Q4LDR2 FAH-201ENST00000261755 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTXN3Q4LDR2 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTXN3Q4LDR2 SNHG1-213ENST00000540725 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTXN3Q4LDR2 CAP2P1-201ENST00000557743 1390 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CTXN3Q4LDR2 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTXN3Q4LDR2 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTXN3Q4LDR2 OR9I1-201ENST00000302610 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTXN3Q4LDR2 LINC01006-202ENST00000418309 640 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTXN3Q4LDR2 SNHG14-206ENST00000450809 677 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTXN3Q4LDR2 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTXN3Q4LDR2 LINC02046-201ENST00000469812 378 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTXN3Q4LDR2 ZNF124-204ENST00000491356 956 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTXN3Q4LDR2 AC108142.1-201ENST00000505389 286 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTXN3Q4LDR2 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTXN3Q4LDR2 LTBR-209ENST00000541102 1084 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTXN3Q4LDR2 C12orf73-211ENST00000553183 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTXN3Q4LDR2 SLIRP-210ENST00000557431 725 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTXN3Q4LDR2 NAT9-220ENST00000582870 896 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTXN3Q4LDR2 HPN-206ENST00000597419 1212 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTXN3Q4LDR2 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTXN3Q4LDR2 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTXN3Q4LDR2 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTXN3Q4LDR2 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTXN3Q4LDR2 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTXN3Q4LDR2 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTXN3Q4LDR2 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTXN3Q4LDR2 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTXN3Q4LDR2 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTXN3Q4LDR2 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTXN3Q4LDR2 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CTXN3Q4LDR2 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTXN3Q4LDR2 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTXN3Q4LDR2 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTXN3Q4LDR2 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTXN3Q4LDR2 LRP10-203ENST00000546834 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTXN3Q4LDR2 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTXN3Q4LDR2 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTXN3Q4LDR2 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTXN3Q4LDR2 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTXN3Q4LDR2 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CTXN3Q4LDR2 TUBA3C-202ENST00000618094 1386 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
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