Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY56

SP6, Transcription factor Sp6, humanhuman

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Length 376 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP6Q3SY56 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
SP6Q3SY56 SERPINA4-203ENST00000557004 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
SP6Q3SY56 LPCAT1-201ENST00000283415 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
SP6Q3SY56 DPP3-209ENST00000531863 2974 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
SP6Q3SY56 GPRC5B-209ENST00000569479 2984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
SP6Q3SY56 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
SP6Q3SY56 DCAF10-202ENST00000377724 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
SP6Q3SY56 ELP4-201ENST00000350638 1907 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
SP6Q3SY56 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
SP6Q3SY56 MX1-202ENST00000398598 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
SP6Q3SY56 CRYBG1-201ENST00000369066 7553 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
SP6Q3SY56 ABI2-201ENST00000261016 6634 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
SP6Q3SY56 ABI2-203ENST00000261018 6638 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
SP6Q3SY56 B3GAT1-202ENST00000392580 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
SP6Q3SY56 SHCBP1-201ENST00000303383 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
SP6Q3SY56 PPP4R3B-205ENST00000616288 4310 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
SP6Q3SY56 INMT-201ENST00000013222 2559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
SP6Q3SY56 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
SP6Q3SY56 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
SP6Q3SY56 CCDC187-203ENST00000569961 3158 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
SP6Q3SY56 SPRY1-208ENST00000622283 2352 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
SP6Q3SY56 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
SP6Q3SY56 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
SP6Q3SY56 ABLIM2-213ENST00000514025 2974 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
SP6Q3SY56 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
SP6Q3SY56 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
SP6Q3SY56 MOG-221ENST00000376917 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
SP6Q3SY56 MIER1-202ENST00000355977 3595 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
SP6Q3SY56 B4GALT6-201ENST00000237019 2128 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
SP6Q3SY56 TBKBP1-201ENST00000361722 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
SP6Q3SY56 AL731571.1-201ENST00000617058 5428 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
SP6Q3SY56 TICRR-201ENST00000268138 6775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
SP6Q3SY56 TRIT1-214ENST00000537440 2026 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
SP6Q3SY56 DCAF8L2-203ENST00000545306 2013 ntAPPRIS P1 BASIC12.22□□□□□ -0.45
SP6Q3SY56 PWWP2A-202ENST00000456329 3991 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
SP6Q3SY56 AC068760.1-201ENST00000493579 1953 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
SP6Q3SY56 BEGAIN-212ENST00000637716 3259 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
SP6Q3SY56 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
SP6Q3SY56 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
SP6Q3SY56 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
SP6Q3SY56 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
SP6Q3SY56 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
SP6Q3SY56 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
SP6Q3SY56 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
SP6Q3SY56 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
SP6Q3SY56 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC12.22□□□□□ -0.45
SP6Q3SY56 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
SP6Q3SY56 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
SP6Q3SY56 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
SP6Q3SY56 RIMBP2-201ENST00000261655 6321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
SP6Q3SY56 GTF2I-215ENST00000614986 4415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
SP6Q3SY56 GTF2I-221ENST00000621734 4412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
SP6Q3SY56 PLEKHB2-205ENST00000409279 2488 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
SP6Q3SY56 VGLL3-202ENST00000398399 10400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
SP6Q3SY56 EPHA5-203ENST00000432638 3662 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
SP6Q3SY56 CLCN7-203ENST00000448525 4151 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
SP6Q3SY56 CFAP157-206ENST00000614677 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
SP6Q3SY56 FAM171B-201ENST00000304698 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
SP6Q3SY56 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
SP6Q3SY56 MAMDC4-202ENST00000445819 3895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
SP6Q3SY56 INO80-202ENST00000401393 5991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
SP6Q3SY56 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
SP6Q3SY56 TRIO-202ENST00000344204 11100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
SP6Q3SY56 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
SP6Q3SY56 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
SP6Q3SY56 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
SP6Q3SY56 STK33-203ENST00000396672 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
SP6Q3SY56 LAMB2-201ENST00000305544 5643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
SP6Q3SY56 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
SP6Q3SY56 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
SP6Q3SY56 NDRG4-221ENST00000563799 3014 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
SP6Q3SY56 GOPC-202ENST00000368498 4450 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
SP6Q3SY56 RNF41-202ENST00000394013 2452 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
SP6Q3SY56 RAB18-208ENST00000611151 4931 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
SP6Q3SY56 TAS1R3-201ENST00000339381 3433 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
SP6Q3SY56 PKD1P6-NPIPP1-202ENST00000605794 2902 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
SP6Q3SY56 STIM1-220ENST00000616714 4356 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
SP6Q3SY56 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
SP6Q3SY56 FAM30A-205ENST00000630242 9612 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
SP6Q3SY56 MYH14-201ENST00000262269 3848 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
SP6Q3SY56 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
SP6Q3SY56 AC083964.2-201ENST00000623988 2396 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
SP6Q3SY56 ZBTB47-201ENST00000232974 3781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
SP6Q3SY56 ADAM17-204ENST00000618923 1881 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
SP6Q3SY56 CLEC18B-204ENST00000617101 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
SP6Q3SY56 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC12.21□□□□□ -0.45
SP6Q3SY56 SLC35E2B-205ENST00000617444 6283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
SP6Q3SY56 ALX4-201ENST00000329255 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
SP6Q3SY56 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
SP6Q3SY56 WDFY1-201ENST00000233055 4660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
SP6Q3SY56 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
SP6Q3SY56 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
SP6Q3SY56 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
SP6Q3SY56 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC12.21□□□□□ -0.45
SP6Q3SY56 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
SP6Q3SY56 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC12.21□□□□□ -0.45
SP6Q3SY56 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
SP6Q3SY56 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
SP6Q3SY56 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
SP6Q3SY56 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
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