Protein–RNA interactions for Protein: Q16595

FXN, Frataxin, mitochondrial, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FXNQ16595 GRIN1-206ENST00000371559 3577 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
FXNQ16595 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
FXNQ16595 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
FXNQ16595 MAN2C1-216ENST00000563622 2961 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
FXNQ16595 RXRG-204ENST00000619224 2252 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
FXNQ16595 KIFC3-202ENST00000421376 3128 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
FXNQ16595 SCML4-203ENST00000369022 2377 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
FXNQ16595 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
FXNQ16595 RNF41-202ENST00000394013 2452 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
FXNQ16595 SEC14L3-204ENST00000403066 2474 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
FXNQ16595 OSTM1-AS1-202ENST00000441184 3334 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
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FXNQ16595 AC012349.1-201ENST00000518662 2643 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
FXNQ16595 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
FXNQ16595 PPT2-245ENST00000361568 1759 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
FXNQ16595 DUSP10-201ENST00000366899 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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FXNQ16595 BAIAP2-202ENST00000321300 2879 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
FXNQ16595 PISD-209ENST00000439502 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
FXNQ16595 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
FXNQ16595 SERPING1-201ENST00000278407 2002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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FXNQ16595 MKRN1-201ENST00000255977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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FXNQ16595 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
FXNQ16595 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
FXNQ16595 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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FXNQ16595 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
FXNQ16595 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
FXNQ16595 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
FXNQ16595 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
FXNQ16595 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
FXNQ16595 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
FXNQ16595 PRDM4-201ENST00000228437 4210 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
FXNQ16595 IL17RA-204ENST00000612619 8506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
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FXNQ16595 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
FXNQ16595 TMEM63B-202ENST00000323267 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
FXNQ16595 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.78□□□□□ -0.2
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FXNQ16595 TGIF2-201ENST00000373872 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
FXNQ16595 AP3M2-202ENST00000396926 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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FXNQ16595 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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FXNQ16595 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
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FXNQ16595 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
FXNQ16595 ABAT-215ENST00000569156 1911 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
FXNQ16595 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
FXNQ16595 EPN2-210ENST00000571254 1883 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
FXNQ16595 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
FXNQ16595 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC13.77□□□□□ -0.21
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FXNQ16595 LDLRAD4-208ENST00000586765 844 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
FXNQ16595 MFSD11-211ENST00000588460 3612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
FXNQ16595 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
FXNQ16595 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
FXNQ16595 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
FXNQ16595 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
FXNQ16595 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
FXNQ16595 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
FXNQ16595 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
FXNQ16595 TMPO-202ENST00000266732 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
FXNQ16595 PCDHGB7-202ENST00000612073 2785 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
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