Protein–RNA interactions for Protein: Q16384

SSX1, Protein SSX1, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX1Q16384 HIPK3-201ENST00000303296 7408 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SSX1Q16384 AL022313.4-201ENST00000562756 2046 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
SSX1Q16384 MAP2K3-214ENST00000613338 2029 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SSX1Q16384 SMIM12-206ENST00000521580 3454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SSX1Q16384 MCM9-202ENST00000316316 5101 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SSX1Q16384 PLOD2-202ENST00000360060 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SSX1Q16384 SAP30BP-202ENST00000355423 2439 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SSX1Q16384 ABCF3-201ENST00000292808 2453 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SSX1Q16384 WDR33-201ENST00000322313 9471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SSX1Q16384 NCSTN-201ENST00000294785 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SSX1Q16384 IFT81-201ENST00000242591 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SSX1Q16384 PDHA1-212ENST00000540249 3277 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SSX1Q16384 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SSX1Q16384 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SSX1Q16384 CD99L2-205ENST00000437787 3493 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SSX1Q16384 TMCC3-201ENST00000261226 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SSX1Q16384 HNRNPUL1-204ENST00000392006 3555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SSX1Q16384 MPRIP-202ENST00000341712 3846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SSX1Q16384 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SSX1Q16384 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SSX1Q16384 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SSX1Q16384 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SSX1Q16384 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SSX1Q16384 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
SSX1Q16384 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
SSX1Q16384 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SSX1Q16384 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
SSX1Q16384 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SSX1Q16384 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SSX1Q16384 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SSX1Q16384 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SSX1Q16384 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SSX1Q16384 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SSX1Q16384 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
SSX1Q16384 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
SSX1Q16384 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
SSX1Q16384 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SSX1Q16384 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SSX1Q16384 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
SSX1Q16384 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SSX1Q16384 PROKR1-201ENST00000303786 4273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SSX1Q16384 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SSX1Q16384 AC024075.2-201ENST00000598112 1473 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
SSX1Q16384 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SSX1Q16384 ST6GAL1-201ENST00000169298 4645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SSX1Q16384 DUOXA1-205ENST00000558422 1678 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SSX1Q16384 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SSX1Q16384 USF1-202ENST00000368020 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SSX1Q16384 PGAP2-203ENST00000396986 1837 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SSX1Q16384 LILRB2-202ENST00000391746 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SSX1Q16384 TRIT1-202ENST00000372818 2034 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SSX1Q16384 CDK5RAP1-202ENST00000346416 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SSX1Q16384 CNTD1-204ENST00000588408 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SSX1Q16384 IFT81-202ENST00000361948 3048 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SSX1Q16384 ZNF501-205ENST00000620116 3382 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SSX1Q16384 ADGRA1-201ENST00000392606 3438 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SSX1Q16384 NAPB-202ENST00000398425 3824 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SSX1Q16384 STARD8-201ENST00000252336 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SSX1Q16384 MAPKBP1-215ENST00000514566 5394 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SSX1Q16384 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SSX1Q16384 MSRB3-202ENST00000355192 4289 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SSX1Q16384 GMIP-201ENST00000203556 3538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SSX1Q16384 ADAM19-203ENST00000517905 3312 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
SSX1Q16384 FSTL4-207ENST00000621681 2660 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
SSX1Q16384 RAB37-204ENST00000392613 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
SSX1Q16384 OS9-201ENST00000257966 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
SSX1Q16384 SLC26A6-202ENST00000337000 2317 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
SSX1Q16384 AL445250.1-201ENST00000641671 2259 ntBASIC13□□□□□ -0.33
SSX1Q16384 SLC43A3-214ENST00000529554 2207 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
SSX1Q16384 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
SSX1Q16384 EPN2-210ENST00000571254 1883 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SSX1Q16384 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SSX1Q16384 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
SSX1Q16384 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SSX1Q16384 AL359845.1-201ENST00000458202 1648 ntBASIC13□□□□□ -0.33
SSX1Q16384 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SSX1Q16384 ADAM11-201ENST00000200557 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SSX1Q16384 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SSX1Q16384 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
SSX1Q16384 PAX5-214ENST00000523241 1342 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SSX1Q16384 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
SSX1Q16384 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
SSX1Q16384 CTBP1-AS-201ENST00000625256 3886 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SSX1Q16384 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SSX1Q16384 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
SSX1Q16384 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
SSX1Q16384 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SSX1Q16384 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SSX1Q16384 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
SSX1Q16384 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
SSX1Q16384 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
SSX1Q16384 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SSX1Q16384 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SSX1Q16384 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
SSX1Q16384 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC13□□□□□ -0.33
SSX1Q16384 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SSX1Q16384 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
SSX1Q16384 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
SSX1Q16384 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
SSX1Q16384 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms