Protein–RNA interactions for Protein: Q16378

PRR4, Proline-rich protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 134 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRR4Q16378 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
PRR4Q16378 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
PRR4Q16378 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
PRR4Q16378 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC9.14□□□□□ -0.95
PRR4Q16378 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
PRR4Q16378 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
PRR4Q16378 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.14□□□□□ -0.95
PRR4Q16378 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
PRR4Q16378 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
PRR4Q16378 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
PRR4Q16378 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC9.14□□□□□ -0.95
PRR4Q16378 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
PRR4Q16378 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC9.14□□□□□ -0.95
PRR4Q16378 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC9.14□□□□□ -0.95
PRR4Q16378 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC9.14□□□□□ -0.95
PRR4Q16378 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
PRR4Q16378 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC9.14□□□□□ -0.95
PRR4Q16378 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC9.14□□□□□ -0.95
PRR4Q16378 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC9.14□□□□□ -0.95
PRR4Q16378 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC9.14□□□□□ -0.95
PRR4Q16378 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.14□□□□□ -0.95
PRR4Q16378 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
PRR4Q16378 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC9.14□□□□□ -0.95
PRR4Q16378 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC9.14□□□□□ -0.95
PRR4Q16378 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC9.14□□□□□ -0.95
PRR4Q16378 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC9.14□□□□□ -0.95
PRR4Q16378 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
PRR4Q16378 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC9.14□□□□□ -0.95
PRR4Q16378 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
PRR4Q16378 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
PRR4Q16378 KIAA0141-201ENST00000194118 2203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
PRR4Q16378 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
PRR4Q16378 DNM3-208ENST00000627582 7625 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
PRR4Q16378 FBLIM1-203ENST00000375771 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
PRR4Q16378 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC9.14□□□□□ -0.95
PRR4Q16378 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC9.14□□□□□ -0.95
PRR4Q16378 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.14□□□□□ -0.95
PRR4Q16378 ANKRD36B-204ENST00000438709 6067 ntTSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
PRR4Q16378 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
PRR4Q16378 IMMT-204ENST00000410111 3001 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
PRR4Q16378 RB1-201ENST00000267163 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
PRR4Q16378 GPR37L1-201ENST00000367282 6588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
PRR4Q16378 DGCR2-201ENST00000263196 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
PRR4Q16378 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
PRR4Q16378 CYP1B1-AS1-201ENST00000413828 1781 ntTSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
PRR4Q16378 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC9.14□□□□□ -0.95
PRR4Q16378 CAD-201ENST00000264705 7265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
PRR4Q16378 PIK3CD-202ENST00000377346 5203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
PRR4Q16378 TRPC6-201ENST00000344327 4612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
PRR4Q16378 PIK3R5-220ENST00000623421 4318 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
PRR4Q16378 MCHR1-201ENST00000249016 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
PRR4Q16378 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
PRR4Q16378 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
PRR4Q16378 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
PRR4Q16378 SLC9B2-202ENST00000394785 3126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.14□□□□□ -0.95
PRR4Q16378 ADAM19-201ENST00000257527 6481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
PRR4Q16378 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.13□□□□□ -0.95
PRR4Q16378 FOSB-212ENST00000592811 3089 ntTSL 2 BASIC9.13□□□□□ -0.95
PRR4Q16378 GREB1-206ENST00000396123 5296 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
PRR4Q16378 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
PRR4Q16378 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
PRR4Q16378 RAVER1-206ENST00000611074 3586 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
PRR4Q16378 AL353608.3-202ENST00000429953 4384 ntTSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
PRR4Q16378 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
PRR4Q16378 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
PRR4Q16378 MADD-204ENST00000395336 5942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
PRR4Q16378 URGCP-207ENST00000453200 4042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
PRR4Q16378 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
PRR4Q16378 GPHN-203ENST00000478722 4297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
PRR4Q16378 CSNK1A1P1-201ENST00000430593 2147 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
PRR4Q16378 ATXN2L-205ENST00000395547 3981 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
PRR4Q16378 GATC-203ENST00000551765 4244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
PRR4Q16378 LDB3-202ENST00000361373 5297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
PRR4Q16378 STX16-NPEPL1-202ENST00000530122 3433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
PRR4Q16378 LOXL4-201ENST00000260702 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
PRR4Q16378 TBC1D22A-203ENST00000380995 3934 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
PRR4Q16378 ARHGEF26-202ENST00000465093 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
PRR4Q16378 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
PRR4Q16378 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
PRR4Q16378 TMEM120B-204ENST00000449592 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
PRR4Q16378 ZCCHC7-209ENST00000534928 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
PRR4Q16378 VAT1L-201ENST00000302536 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
PRR4Q16378 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
PRR4Q16378 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
PRR4Q16378 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
PRR4Q16378 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.13□□□□□ -0.95
PRR4Q16378 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.13□□□□□ -0.95
PRR4Q16378 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC9.13□□□□□ -0.95
PRR4Q16378 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC9.13□□□□□ -0.95
PRR4Q16378 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
PRR4Q16378 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
PRR4Q16378 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC9.13□□□□□ -0.95
PRR4Q16378 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC9.13□□□□□ -0.95
PRR4Q16378 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
PRR4Q16378 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
PRR4Q16378 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC9.13□□□□□ -0.95
PRR4Q16378 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
PRR4Q16378 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC9.13□□□□□ -0.95
PRR4Q16378 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC9.13□□□□□ -0.95
PRR4Q16378 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms